潔淨、防塵、易散熱。
4.3.1.6接種室
要設緩衝間，防塵換氣性能良好，內壁和屋頂光滑，經常清洗和消毒。做到空氣潔淨。
4.3.1.7培養室和貯存室
內壁和屋頂光滑，便於清洗和消毒。培養室和貯存室牆壁要加厚，利於控溫。
4.3.1.8菌種檢驗室
水電方便，利於裝備相應的檢驗設備和儀器。
4.3.2布局
應按菌種生產工藝流程合理安排布局。
4.4設備設施
4.4.1基本設備
磅秤、天平、高壓滅菌鍋或常壓滅菌鍋、淨化工作台、接種箱、調溫設備、除濕機、培養架、恒溫箱、冰箱、顯微鏡等及常規用具，產量大的菌種廠還應配備攪拌機、裝瓶裝袋機。高壓滅菌鍋應使用經有關部門檢驗的安全合格產品。
4.4.2基本設施
配料、分裝、滅菌、冷卻、接種、培養等各環節的設施規模要配套。冷卻室、接種室、培養室和貯存室都要有調溫設施。
4.5使用品種
4.5.1品種
應使用經省級以上農作物品種審定委員會登記的品種，並且清楚種性。不應使用來源和種性不清的菌種和生產性狀未經係統試驗驗證的組織分離物作種源生產菌種。並從具相應技術資質的供種單位引種。
4.5.2移植擴大
母種僅用於移植擴大原種，1支母種移植擴大原種不應超過6瓶(袋)；1瓶原種移植擴大栽培種不應超過50瓶(袋)。
4.6生產工藝流程
培養基配製→分裝→滅菌→冷卻→接種→培養(檢查)→成品。
4.7生產過程中的技術要求
4.7.1容器
4.7.1.1母種
使用玻璃試管和棉塞，試管18mm×180mm或20mm×200mm，棉塞主要使用梳棉，不應使用脫脂棉。
4.7.1.2原種
使用650～750mL，耐126℃高溫的無色或近無色的玻璃菌種瓶，或850mL耐126℃高溫白色半透明符合GB 9687衛生規定的塑料菌種瓶，或15cm×28cm耐126℃高溫符合GB 9688衛生規定的聚丙烯塑料袋。各類容器都應使用棉塞，棉塞應符合4.7.1.1規定；也可用能滿足濾菌和透氣要求的無棉塑料蓋代替棉塞。
4.7.1.3栽培種
使用符合4.7.1.2規定的容器，也可使用≤17cm×35cm耐126℃高溫符合GB 9688衛生規定的聚丙烯塑料袋。各類容器都應使用棉塞或無棉塑料蓋，並符合4.7.1.2規定。
4.7.2培養原料
4.7.2.1化學試劑類
這類原料如硫酸鎂、磷酸二氫鉀等，要使用化學純級試劑。
4.7.2.2生物製劑和天然材料類
生物製劑如酵母粉和蛋白腖，天然材料如木屑、棉籽殼、麥麩等，要求新鮮、無蟲、無蟎、無黴、潔淨、幹燥。
4.7.3培養基配方
4.7.3.1母種培養基
一般使用附錄A中第A.1章規定的馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養基(PDA)或第A.2章規定的綜合馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養基（CPDA），特殊種類需加入其生長所需特殊物質，如酵母粉、蛋白腖、麥芽汁、麥芽糖等，但不應過富。嚴格掌握pH。
4.7.3.2原種和栽培種培養基
根據當地原料資源和所生產品種的要求，使用適宜的培養基配方（見附錄B），嚴格掌握含水量和pH。
4.7.4分裝
母種培養基的分裝量掌握在試管長度的四分之一至五分之一，滅菌後擺放成的斜麵頂端距試管口不少於50mm，原種和栽培種培養基裝至距瓶(袋)口不少於60min，滅菌後不少於45min。棉塞大小鬆緊要適度。原種和栽培種培養基的鬆緊度要一致。
4.7.5滅菌
母種的培養基配製分裝後應立即滅菌；原種和栽培種培養基配製後應在4h內進鍋滅菌。母種培養基滅菌0.11～0.12MPa，30min；木屑培養基和草料培養基滅菌0.12MPa，1.5h或0.14～0.15MPa，1h；穀粒培養基、糞草培養基和木塞培養基滅菌0.14～0.15MPa，2.5h。裝容量較大時，滅菌時間要適當延長。滅菌完畢後，應自然降壓，不應強製降壓。常壓滅菌時，在2h之內使滅菌鍋溫度達到100℃，保持100℃ 8～10h。母種培養基、原種培養基、穀粒培養基、糞草培養基和木塞培養基，應高壓滅菌，不應常壓滅菌。滅菌時應防止棉塞被冷凝水打濕。
4.7.6滅菌效果的檢查
母種培養基置於28℃恒溫培養，原種和栽培種培養基經無菌操作接種於GB4789.28—1994中4.8規定的營養肉湯培養基中，於28℃恒溫培養，48h後檢查，無微生物長出的為滅菌合格。
4.7.7冷卻
冷卻室使用前要進行清潔和除塵處理。地麵鋪消毒過的塑料薄膜後，將滅菌後的原種瓶（袋）或栽培種瓶（袋）放置在冷卻室中冷卻到料溫降至適宜溫度。