不僅如此，他甚至還遣使向朱元璋通好，獻上寶馬。
朱老大於是派出中書省都事汪河至開封，致書王保保道：元朝的土崩瓦解已成定局，你可得好好打算了。你的養父是個了不起的人物，我之前派人到開封隻是為了和他交流一下，並不是想投降元朝。既然你想跟我通好，那也行，從今往後，希望咱們和平相處。
這封信已經很不老實了。王保保隻要腦子還清醒，都看得出這姓朱的野心極大，是個刺頭。
本來，如果此刻元朝的各派勢力都聽命於王保保的話，他保準下一個開刀的就是這姓朱的。可是，很多事沒那麼多假設，有人出來挑事了。
挑事的人叫李思齊，論資曆他同李察罕一般老。對於朝廷任命王保保為總司令，他就一百個不滿。甚至連他的部將，如張良弼、孔興、脫列伯等也自恃功高，瞧不起王保保這個小輩。眾人是“各懷異見，請別為一軍，莫肯統屬”。
當然，王保保也不是吃素的，他的野心並不滿足於做一個割據的軍閥，其身邊不少謀士都在鼓動他成就“大事”。
於是，新一輪的軍閥混戰又開始了。
從這裏我們也可以看出：如果李察罕不死，以他的權威與號召力，再加上他的頭腦，那麼，元末的北方地區出現一個“曹操”式的人物是很有可能的。
在混戰期間，王保保也與皇太子鬧得有些不愉快。
太子想要逼迫老爹退位，可王保保不讚成。
太子又數次催促王保保南征（可見太子也不是個草包），可王保保一麵命弟弟脫因帖木兒等人盤踞山東，一麵繼續西向同李思齊等人搶地盤。
至正二十七年八月，順帝下詔命皇太子親自統帥天下兵馬，並分配任務如下：命王保保以其兵自潼關以東，肅清江淮；李思齊則以其兵自鳳翔以西，進取川蜀；禿魯以其兵與張良弼、孔興、脫列伯等取襄樊；王信以其兵固守山東等地。
可是，詔書雖下，不僅一貫嚷嚷著要親征的皇太子沒動靜，就連向來以忠臣良將自居的王保保也不肯受命。
眼見王保保有不臣之心，其屬下的幾員大將如貊高、關保等便萌生了誅滅主帥之心。最終，他們舉兵討伐王保保——可見，王保保多麼缺乏應有的政治頭腦。
十月，王保保已陷入眾叛親離的絕境，朝廷又進一步瓦解了他的兵權。身處不利的王保保隻得受詔，以一支孤軍屯駐於澤州（位於今山西東南）一帶。
與此同時，朝廷再次下詔命令諸軍南下。
可直到至正二十八年，即洪武元年（1368年），不甘心被人擺布的王保保還派兵占據了太原，殺盡朝廷所置官屬。盛怒之下的皇太子不得不命令各軍夾攻澤州、討伐王保保，而順帝又下詔削奪了他的爵邑。
二月，王保保退守於平陽一帶，眼看已經四麵楚歌。而就在這時，朱明王朝的大軍已經開始了北伐，這反倒“救”了他。
當時，大明王朝的北伐軍隊已經打到了河南，火燒眉毛的蠢材李思齊等人見狀，才趕緊派人私下裏同王保保和解，然後帶領著軍隊跑回關中老巢據守。七月時，貊高、關保等保皇派還在繼續進攻平陽，灰心喪氣的王保保不敢出城應戰。但是一天晚上，王保保趁貊高等人不備，突然率軍殺出，最後竟擒殺了貊高、關保等人。
朝廷聞訊後，強硬的態度也開始出現了急劇變化，而王保保本人又上疏表白了委曲的心跡，於是雙方很快達成了和解。
此時，中原之地已盡被明軍占領，朝廷急忙下令恢複王保保官職，並嚴令各路迅速出兵勤王。
可一切都已經太晚了。
這年閏七月底，元順帝父子棄大都北奔蒙古大漠，元朝宣告滅亡。
此後，王保保所能做的，就隻能是不停騷擾大明邊境，反複折騰，讓朱皇帝頭疼而已。
實話實說：作為元末明初天字第一號偶像的王保保，其人很複雜，前後簡直判若兩人。大元滅亡前，不僅看不出他有多高明，反倒可以說愚蠢透頂，熱衷於內鬥和爭權，而對於元帝國外部的致命敵人——朱元璋部，他一直是視而不見、放任和縱容。待到大元滅亡，蒙古貴族逃命漠北了，他反倒顯出了驚人的膽識、謀略和韌性，跟大明王朝周旋良久，勝多敗少，至死不屈。朱元璋在對他頭疼不已的同時，也佩服之至。而他的名氣也在此時達到了頂點。