魏忠賢不得已隻能以退為進，提出辭職，崇禎帝順水推舟答應了。這下魏氏弄巧成拙，一旦沒有職務，真是牆倒眾人推，彈劾他的奏章雪片似地飛到崇禎帝的案上，幾乎人人皆欲殺，崇禎帝利用輿論的力量趁熱打鐵將魏忠賢貶到鳳陽替皇家看守祖陵，看到大勢已去的魏忠賢，在半路上自殺。
魏忠賢死了，按理說完全可以把所有的壞事推到他身上就行了。但他提拔的官員還把持朝廷要津，崇禎帝如果不把這場鬥爭引向深入，將魏黨除根，他的權力布局意圖是很難達到的。魏黨餘孽當然要反擊，他們的招數還是不外乎拿先帝既定政策做幌子。
可是，這世上總是活人最終勝死人的，聰明人多得很，完全可以繞過先帝已經做出的決定，將先帝的靈位高高供起來，而把他生前的政策措施來個翻天覆地的大變化。
中國的封建傳統政治中，新的權力布局、政治變革總是從平反冤獄開始。此舉既能打倒舊勢力，又能收拾民心，爭取輿論。
此時，翰林院的編修倪元璐向皇帝連上奏折，不但要求為東林黨平反，而且要求搗毀《三朝要典》。盡管這招有風險，但倪元璐看到了皇帝的心思，他比兩個在魏忠賢快完蛋時還拍馬屁的監生聰明多了。因為平反冤獄、新政實施不僅是人事上的變遷，還必須有理論上的突破，在古代就是“正名”。這《三朝要典》是天啟朝在魏忠賢的主持下修訂的國史，用現在的話來說就是對當時一些重大政治事件進行定性的“正名”之舉。在這個“正名”過程中，東林黨人被當成奸邪之徒，魏黨則是忠貞的國家柱石。當年修纂成功後，魏黨也希望《三朝要典》成為永不翻案的東西，它一旦翻過來，魏黨餘孽就沒有了再在政治場上生存下去的正當理由。
崇禎帝很聰明，麵對因毀棄《要典》而可能有人質疑他辜負亡兄天啟帝的信任，他說有了熹宗皇帝的實錄，不必有《要典》，熹宗皇帝的光輝形象在實錄中留給後人景仰。然後下旨說：“從今以後，官方不要以天啟朝東林黨人事件來決定好壞醜惡的評價，天下的人才不要依照《三朝要典》來決定進退。”
理論上一旦有了突破，平反就順風順水了，魏黨還留在朝廷的人很快就清除了，崇禎帝大勝。也許是崇禎帝在當信王和即位之初時裝孫子，憋了很久，一旦釋放就控製不住。魏黨除掉後，崇禎很快就顯露出他剛愎自用、狹隘多疑的本性，急躁冒進，鬧得政局不可收拾，本想做中興之君最終成了亡國之君。
崇禎帝即位後，先忍耐靜觀，再進行人事調動，然後解決魏黨首要人物，最後憑借“正名”，以求根本解決魏黨的殘餘影響，這是封建政治中常見的套路了。