按理說，用這種報表是造不出有價證券來的，人們也很難靠這裏的數字徇私舞弊。因此，此種做法在民間被普遍應用，是官員們默認的方式。誰知，朱元璋偶然知道了這個情形，認定自己發現了一個官員相互勾結、舞弊欺詐的滔天大案。於是，這位缺少財務知識的皇帝立即發雷霆之怒，下令將全國各地、各級政府部門的正印官，即一把手全部處死，副手以下官員打一百棍，充軍邊疆。
當時，全國有13個布政使司，相當於我們今天的省；141個府，相當於今天的地級市；192個州，相當於今天的小地級市和大縣級市；1013個縣。這1300多個官員全部被殺掉了。而且，是在有人已經向朱元璋解釋清楚了個中緣由的情況下被殺掉的。
冤死！
這其中肯定有很多深受百姓愛戴的好官，也被稀裏糊塗地幹掉了。比如方孝孺的父親方克勤。當時他是山東濟寧的市長。他一件布袍能穿十幾年，每日三餐，有兩頓用一盤素菜下飯。很多時候就是吃個山東煎餅了事。當地百姓在他的任期內，日子過得很滋潤。大蔥賣的好，煎餅銷路也不錯。百姓們不願意這位知府調離，自發地作歌傳唱挽留。歌曰：“使君勿去，我民父母。”結果，這麼一個好官好人，此次卻被朱元璋不由分說地殺死。二十多年後，他的兒子方孝孺也成為中國曆史上赫赫有名的人物。原因是，他不肯迎合奪了侄子皇位的永樂皇帝朱棣，結果成為中國曆史上唯一一位被滅了十族的人物。當然這是後話。
“郭桓案”則號稱是洪武朝最大的貪汙案，發生在洪武十八年（1385年）。郭桓當時任戶部侍郎，相當於今天的全國最高財政經濟部門的二把手。據說，這廝貪汙的財物總計可以折合精米2400百多萬石，差不多相當於當時全國一年的稅糧收入。
朱元璋要求對此案一追到底。也就是說，要從中央部門開始，一級級地追查出所有犯罪終端。
最後的結果是，所有中央六個部和全國各地、各級的大部分官員被牽連了進去。《明史》的《刑法誌》中說：自六部左右侍郎，即從中央六部每個部兩位副部長開始的以下官員全部被處死，全國各地各級官員處死者數萬人。其中有多少冤魂怨鬼估計無從查考。
最後，老朱來了一招更絕的，為了化戾氣為祥和，平息人們的怨恨與恐懼，朱元璋把辦這個案子的專案負責人員也殺了，並相當鄭重其事地布告天下說：“我讓他們除奸，誰知他們反而生奸，來擾害我民。這種人哪裏可以縱容？今後再有這樣的壞蛋，將不在赦免之列！”
貌似有點可笑！
罪狀不明胡惟庸
洪武十三年（1380年）五月初二，朱元璋從西華門擺駕出皇宮，要到皇宮附近的胡惟庸家去。胡惟庸是誰？就是中書省左丞相，是政府的最高行政長官，也就是相當於現在的總理，是真正的“一人之下、萬人之上”。馬正悠哉遊哉地往前走呢，路上忽然有一個人迎著皇帝的車駕就直衝了過來，攔住禦駕車馬，由於緊張，一下子竟然說不出話來。朱元璋見他衝撞車駕，又不說話，特別生氣。這不成心找碴兒嗎？沒等朱元璋開口，他身邊的衛士見這個人敢這麼冒犯聖駕，立即衝上去開打。這人是誰呢？他叫雲奇，是西華門的內使，一個宦官。雲奇很快被打倒在地，胳膊都快被打折了，還拚命指著胡惟庸的家。朱元璋一看，有意思，憑著他多年的實戰經驗，敏銳地察覺到，一定是發生什麼事了，雲奇才敢於這麼拚死攔駕陳訴。老朱就開始分析了，既然雲奇不在別處攔駕，偏偏在他前往胡惟庸家的路上攔駕，那此事就可能與胡惟庸有關。西華門離胡惟庸家很近，朱元璋於是登上西華門的城樓向胡惟庸家眺望。不看不知道，一看嚇一跳，隻見胡惟庸家裏有很多的猛士，全都拿著武器，埋伏在屏壁間。老朱當時就出了一身冷汗，多虧自己沒有冒冒失失地去胡惟庸家，這要是去了還不完蛋了？直接被胡惟庸扣下了。不過難道胡惟庸真想趁我臨幸時造反謀逆嗎？老朱一時找不到頭緒。因為西華門與胡惟庸家近在咫尺，內使雲奇發現了這一逆謀後，便緊急趕來向朱元璋報告。這在曆史上被稱為“雲奇告變”。
那朱元璋為什麼要到胡惟庸家裏去呢？這是有原因的。丞相胡惟庸是個馬屁精，時刻在想著怎麼討好朱皇帝。他知道古代的皇帝都想多來點好像天人感應的事，比方說自己家井裏湧出了個醴泉，這明擺著就是祥瑞之事。要不是皇帝治理的好，怎麼會平白無故地出這種東西呢？上天要表彰皇帝的勞苦功高，就用這種方式表達了。果然，朱元璋一聽說此事，非常的高興，自己正愁沒有什麼實質上的證據誇自己好呢，現在這個胡惟庸正好提供了一個，可喜可賀！於是興衝衝地來了。誰知道，這竟然是胡惟庸的一場陰謀。好你個胡惟庸簡直是活的不耐煩了。