李德馨不耐煩地回說一句：“小邦已到危亡關頭，能不思慮自保之策嗎？現在到了王京，講和的事要跟國王商議一下。”
蕭應宮見威脅不成，惱羞成怒，大罵：“狗奴才，不作決定，還如此推托。
① 監軍：代表皇帝協理軍務、督察將帥、稽核功罪賞罰的職務。
我將不再為朝鮮做事了。”
凶狠狡詐如此，蕭應宮一點兒也不輸給沈惟敬。
九月，日軍深入忠清道，兵臨漢江。楊鎬派遣張貞明拿著沈惟敬的書信，去倭營責備日本人輕舉妄動。小西行長和豐臣正成比較讚成和議，大罵加藤清正發兵，隨即率部退屯離王京六百裏的井邑。其後，解生等取得稷山大捷，加藤清正也退往離王京四百裏的慶尚道。可惜，張貞明在回來途中，遭人暗算刺死。
麻貴上報稷山、青山大捷，不料蕭應宮從中作梗，奏稱，日本人是見了沈惟敬的親筆信之後才退走的，明軍在稷山、青山並未與倭子交戰，哪來的大捷？
蕭應宮如此不顧事實，漠視明軍的英勇作戰，明軍上下無不義憤填膺。邢玠和楊鎬對蕭應宮的倒行逆施，甚是憤慨，於是上書彈劾蕭應宮懦弱膽怯，畏倭如虎。不但沈惟敬沒給放出來，蕭應宮也一並給關押起來。
牆倒眾人推，鼓破萬人捶。遼東巡按禦史聽到此事，趁機參蕭應宮一本。
明神宗對蕭應宮這樣吃裏爬外、違反抗倭政策的人深惡痛絕，讓他削職回籍。
緊接著，就是對主和派石星、投機分子沈惟敬的秋後大算賬。
九月初四，明神宗下旨：
倭奴狂逞，掠占屬國，窺犯內地，皆前兵部尚書石星論賊釀患，欺君誤國，以致今日，殘我將士，擾我武臣，好生可惡，不忠，著錦衣衛，拿去法司，從重擬罪。(《萬曆邸鈔》)
石星馬上就被拉進刑部監獄。
初七，命經略邢玠對南原敗將楊元議罪。
十三日，又旨令刑部、大理寺、都察院三法司，會審石星。
三法司秉公斷案，不帶任何私人恩怨。最後判審決定，將石星永遠流放至遼遠的邊疆。那時的流邊，大都流放到雲南、青海等尚未開化之地，根本不是人住的地方。
不料，明神宗對石星的憎恨已經到了無以複加的地步。在他心裏，倭賊簡直就是石星招來的，對石星千刀萬剮，也不能解心頭之恨。所以，明神宗得知三法司判石星一個永流極邊之後，雷霆大怒，說是刑部、大理寺、都察院三法司朋比為奸，徇私枉法，石星要重新擬罪。
明神宗很生氣，後果很嚴重。
明神宗的責罵，讓主持審訊石星的刑部尚書蕭大亨驚恐萬分。石星倒台之後，蕭大亨一度成為替代石星的頭號種子。九月初一，內閣首輔趙誌皋還力薦蕭大亨任職兵部尚書。
蕭大亨主動引罪自責。但是，明神宗卻毫不留情，下旨革除蕭大亨世襲恩蔭的特權(但並未革去蕭大亨的刑部尚書職務)，然後重罰參與此次審訊的相關大臣。
處分最嚴重的是大理少卿(最高法庭審判長)白棟，削籍為民。
其餘的奪減歲俸。奪山西巡撫魏允貞、禦史袁九皋的半年俸祿；奪布政司(民政部)萬象春、參政馬溶的一年俸祿。
潞安知府劉複初降一級調用。
這其中，魏允貞是一個忠誠清直的好官。萬曆二十年(1592)，明神宗考核官員，朝中大臣隻有魏允貞和孟秋二人沒有受賄。著名的清官海瑞曾經稱頌魏允貞“天下直言第一”。
眾所周知，明代官員俸祿很低。像魏允貞這樣清廉的巡撫，家人的一切生活就靠月俸六十一石米(大約合今天人民幣1.5萬元)。讓他奉獻一半給政府，那麼家中有些人就隻得喝西北風了。
明神宗下旨二審石星。這回，會審官員摸清了明神宗的脾氣，小心翼翼地宣判：石星隱匿軍情失誤，律論死，父母子孫各流兩千裏。
沈惟敬這個無賴也終於得到了應有的懲罰。早在八月十四日，楊元和日本人在南原殊死搏鬥的同一天，明朝禦史況上進奉旨抄了沈惟敬的家。從他的妻子陳淡如那裏搜出倭旗一麵、長短倭刀倭劍共三百三十六把。倭衣、倭器、由絹、犀帶、日本圖等項共三百六十三件。沈惟敬通敵賣國證據確鑿，打入死牢。妻、子、女、妾給功臣為奴，財產變賣入官。
但是，九月獄案潮並未就此終結，最後還有天津兵備許守恩。
許守恩，字誠齋，陝西涇陽人。他身材魁梧，無所畏懼，敢於直冒權貴重臣。明神宗很看重他，不直呼其名而呼“許大漢”。經略邢玠調發大軍援朝，他卻推奸避事，被邢玠參劾，明神宗下旨處以廷杖之刑。