1870年6月發生了著名的天津教案，天津數千名群眾懷疑天主教堂存在拐騙人口、虐殺嬰兒的行為，與洋人教堂人員發生流血衝突。當時正任職直隸總督的曾國藩被朝廷派往天津處理此事。曾國藩考慮當時的局勢，不願與法國開戰，在法國的要求下，決定最後處死為首殺人的18人，充軍流放25人，並將天津知府張光藻、知縣劉傑革職充軍發配到黑龍江，賠償外國人的損失46萬兩白銀，並由崇厚派使團至法國道歉。這件事使曾國藩名譽掃地，遭到全國朝野的唾罵，他的湖南同鄉也把他在湖廣會館誇耀其功名的匾額砸爛焚毀。
1872年3月12日，曾國藩在南京病逝。朝廷贈太傅，諡文正。其墓地在今長沙市望城縣坪塘鎮伏龍山下桐溪寺後，文革期間遭到破壞，現墓地仍殘留石馬等遺跡。曾國藩的故居，如今經過整修已成為國家重點文物保護單位，並開始對遊人開放。
曾國藩的後代，都很有成就。長子曾紀澤繼承世襲的侯王爵位，並出使英、法、俄等國，是清朝著名的外交家；次子曾紀鴻，則是著名的數學家；孫輩中的曾廣鈞，23歲便中了進士；第四代孫曾約農、曾寶蓀，則是大學校長、著名的教育家；第五代、第六代，則遍布海內外，也都是學有所成……
曆史評價：譽之則為聖相，讞之則為元凶
關於曾國藩的評價，曆來褒貶不一。大清朝對曾國藩褒獎至極；而對於欲推翻封建王朝的某些革命黨人，則稱曾國藩為劊子手、賣國賊，稱其在天津教案中“開就地正法之先河”。 著名清末革命家陳天華說他是“不曉得有本族、異族之分”“隻曉得替滿人殺同胞”，孫中山先生則說他是“漢之不肖子孫”。
對曾國藩曆史評價較高的則有：
1.滿清遺老所著的《清史稿·曾國藩傳》：“……至謂漢之諸葛亮、唐之裴度、明之王守仁，殆無以過，何其盛歟！……中興以來，一人而已。”
2.同僚左宗棠：“謀國之忠，知人之明，自愧不如元輔；同心若金，攻錯若石，相期無負平生。”
3.曾國藩的門生李鴻章：“師事近三十年，薪盡火傳，築室忝為門生長； 威名震九萬裏，內安外攘，曠世難逢天下才。”
4.湘軍重要首領胡林翼：“曾公素有知人之鑒，所識拔多賢將。”
5.太平天國陣營裏不太得誌的石達開：“雖不以善戰名，而能識拔賢將，規劃精嚴，無間可尋，大帥如此，實起事以來所未見也。”
6.曾國藩的幕僚薛福成：“曾國藩識人之鑒越軼古今，或邂逅於風塵之中，一見以為偉器；或物色於行跡之表，確然許為導才。”
7.楊開慧的父親楊昌濟教授，曾以曾國藩的事跡勉勵毛澤東，並促成女兒與毛澤東的婚事，他對曾國藩評價很高：“宋韓、範並稱，清曾、左並稱，然韓、左辦事之人，範、曾辦事兼傳教之人也。”
8.曾國藩幕僚、晚清經濟學家王闓運：“用將則勝，自將則敗。”
9.中國留學生之父容閎：“故其身雖逝，而名聞千古。其才大而謙，氣宏而凝，而為清代第一流人物，亦稱舊教之特產人物。”
10.湖南老鄉蔡鍔將軍對曾氏治兵思想推崇備至：“‘帶兵如帶子弟’一語，最為慈仁貼切。能以此存心，則古今帶兵格言，千言萬語皆付之一炬。”
11.梁啟超可能沒看過世界史，也不知道全世界古今出現過幾個大人物，所以他的評價讓人覺得多少有點肉麻：“豈惟近代，蓋有史以來不一二睹之大人也已；豈惟我國，抑全世界不一二睹之大人也已。然而文正固非有超群絕倫之天才，在並時諸賢傑中，稱最鈍拙；其所遭值事會，亦終生在指逆之中；然乃立德、立功、立言三不朽，所成就震古爍今而莫與京者。其一生得力在立誌自拔於流俗，而困而知，而勉而行，曆百千艱阻而不挫屈，不求近效，銖積寸累，受之以虛，將之以勤，植之以剛，貞之以恒，帥之以誠，勇猛精進，堅苦卓絕。吾以為曾文正公今而猶壯年，中國必由其手獲救。”
12.年輕時的毛澤東，佩服曾國藩：“予於近人，獨服曾文正，觀其收拾洪、楊一役，完美無缺，使以今日易其位，其能如彼之完滿乎？”成為無產階級革命領袖的毛澤東，階級立場則轉為鮮明：“曾國藩是地主階級最厲害的人物。”
13.蔣介石：“辛亥以前，曾閱《曾文正全集》一書……民國二年失敗以後，再將曾氏之書與胡左諸集悉心討究……實不愧為當世之名將。”
14.民國胡哲敷教授：“五百年來，能把學問在事業上表現出來的，隻有兩人：一為明朝的王守仁，一則清朝的曾國藩。”
15.近代著名大學問家章太炎：“譽之則為聖相，讞之則為元凶。”
學術思想：八大學問，後世之師
有人說曾國藩有十三套學問，結果隻流傳下來《曾國藩家書》與《冰鑒》兩套學問；也有人列出曾國藩的十三套學問是：《家書》《冰鑒》《求闕齋文集》《奏議》《家調》《經史百家雜鈔》《十八家詩鈔》《治學論道之經》《處世交友之道》《修身養性之訣》《疆場競鬥之計》《持家教子之術》《為學之道》。這兩種說法都有些過於牽強，難有令人信服的證據。不過，目前通過學者研究，大致可將曾國藩的學術思想歸納為八大學問：
1.治國的學問。曾國藩是近代著名政治家，對當時滿清王朝的腐敗衰落，洞若觀火，他認為：“國貧不足患，惟民心渙散，則為患甚大。”“吏治之壞，由於群幕，求吏才以剔幕弊，誠為探源之論。”“行政之要，首在得人。”……他不盲目排斥洋人，認為應當學習西方先進的科學技術，從而逐漸讓國家強盛起來。