二、專家根據赤壁之戰的時間與血吸蟲病的易感季節推斷，曹軍遷徒、訓練水軍的秋季正好是血吸蟲病的易發季節。曹軍由路上作戰轉為水中作戰，最容易染上此病。血吸蟲病在人體內潛伏期為一個月，在一個月後患者才會出現急性病症狀。由此可以推斷出曹軍在訓練時期已經染上此病，一個月後此病進入急性期，即正值曹軍進入冬季決戰時期，曹軍備受此病折磨，因而不堪一擊。
然而，血吸蟲病說也並不是無懈可擊的。可疑之處較之火攻論為多，其中之一便是孫劉聯軍和曹軍同屬水上訓練和作戰，為什麼孫劉聯軍不受血吸蟲病之害呢？對血吸蟲病提出疑問者認為：
一、曹操訓練水軍的地點，不在疫區江陵，而在鄴（今河南省安陽境），那裏不屬血吸蟲病疫區，當然不用擔心感染血吸蟲病。
二、曹操燒船退軍，史書確有記載，但燒船的地點不在赤壁而在巴丘；時間不在赤壁大戰時，而在曹軍兵敗退到巴丘時，曹操燒船的目的是避免孫劉聯軍得到這些船隻。
三、血吸蟲病潛伏期，一般在一個月左右，因天氣冷熱、時間長短有別，兩個月以上者隻是少數，而潛伏期越長，發病時症狀也越輕。曹軍即使秋季感染到血吸蟲病，至十二月（大戰爆發）才發病，症狀也不會重了。
四、曹操水軍主要來自劉表，多為湖北人，一直處於血吸蟲病流行區，與孫劉聯軍的免疫能力不會有什麼差別。此外，劉璋補充給曹操的軍隊，是四川士卒，也來自疫區。所以，孫劉聯軍與曹軍在免疫能力方麵並無高低強弱之分。
另外，周瑜在赤壁戰前也有預見。他指出曹軍的不利條件：一是曹操占有北土，既未平安，加以馬超、韓遂尚在關西，為操後患；二是曹軍“舍鞍馬，仗舟楫，與吳越爭衡，本非中國（此指中原）所長”；三是彼時正值“盛寒”，馬無草料，會成群餓斃；四是北方士兵遠涉江湖之間，不習水土，必傳染疾病。裴注引《江表傳》還記有周瑜曾向孫權指出曹操征劉表之軍，“已久疲”，而他收編的劉表舊部“尚懷狐疑”雲雲。這就是說，曹操是“以疲病之卒，禦狐疑之眾”等等。
這就是說，火攻論不可盡信，血吸蟲病說也有缺陷，而所謂的“疾病”究竟是何種疾病，也無從考證。那麼，曹操在赤壁戰敗的原因，隻能作為一個千古之謎留存於人們心中了。
［相關鏈接］曹操敗走華容道
曹操赤壁兵敗後，帶著殘兵敗將逃往南郡江陵。在途中，先後受到趙雲、張飛阻擊，已馬困人乏。曹軍行至華容道，路上一片泥濘，根本無法通行，加之那天又刮大風，行走更加艱難。於是曹操下令，命羸弱之兵割草墊路，大軍才得以通過，而羸兵被人馬踐踏，深陷泥中，死亡無數。眼看大軍就要全部通過華容道，曹操不由哈哈大笑。諸將本已狼狽不堪，見曹操大笑，十分不解，問曹操為何發笑。曹操說道：“劉備的才智與我不相上下，但他的計謀總要晚我一步；假使他早派快馬至華容道放火，我等必全軍覆沒了。”曹操話音剛落，一聲炮響，為首大將關雲長帶五百兵士橫刀立馬，攔住去路。曹操見了，亡魂喪膽，麵麵相覷。曹操想決一死戰，在眾將領的勸告下，縱馬向前，欠身對關羽說：“將軍別來無恙！”意思是要關羽念舊情，放他曹某一馬。關羽是個義重如山的人，想起當年曹操許多之恩義，觀曹軍惶惶，皆欲垂淚，愈覺心中不忍。於是勒回馬頭，令眾軍士“四散擺開”，放曹操走了。