這位長孫皇後真是唐太宗的賢內助。貞觀之治也有他的一份功勞。貞觀初，她堅決要求唐太宗免去她哥哥長孫無忌的宰相之職，開了一個好風氣，她對唐太宗也多有勸諫，尢其重要的是她曾保護過以直諫而得罪皇帝的魏徵。有一天，唐太宗下朝回宮，咬牙切齒地說：“總有一天要殺死這個鄉巴佬！”長孫皇後問殺誰，唐太宗說是魏徵。原來魏徵經常在朝廷上當麵諫爭，據理力駁，詞色不屈，唐太宗很憤怒，要殺魏徵以泄其憤。長孫皇後默默退下，換上朝服，向唐太宗道賀。唐太宗驚問其故，長孫皇後說：“妾聞主明臣直；今魏徵直，由陛下之明故也，妾敢不賀？”唐太宗立即意識到了魏徵的無私與忠誠。
在貞觀後期，房玄齡盡管一如既往地鞠躬盡瘁，但他明哲保身的缺點卻使他沒有發揮應有的作用。貞觀十七年魏徵病逝後，朝廷上失去了一位能力挽狂瀾的大臣，而具有這樣的資格的人中，房玄齡是首屈一指的，但他沒有勇敢地擔起這副重擔。唐太宗的晚年偏執多疑，政事漸亂，貞觀十七年，太子承乾與魏王李泰爭嗣，最後雙雙落敗，軟弱無能的李治揀了個便宜；在這一事件中，眾多的大臣被牽入其中，人人自危，離心離德的局麵開始出現。房玄齡的次子房遺愛參與了李泰一黨，房玄齡多少也受了點牽連，感情上略有疏遠，但房玄齡仍是唐太宗所倚重信任的肱股之臣，為了穩定新太子李治的地位，太宗還任命房玄齡為太傅。應該說，房玄齡的意見還是很受重視的。有一件小事可以證明。貞觀二十一年，唐太宗巡幸翠微宮，派房玄齡留守京師。太宗任命李緯為戶部尚書。有人從京師去翠微宮，太宗問：“玄齡聞李緯拜尚書，如何？”來人回答道：“但雲‘李緯大好髭須’，更無他語。”唐太宗意識到房玄齡是不讚成的，便改派李緯做洛州刺史。
唐太宗重視房玄齡的意見，也相信他的忠誠，在遠征高麗時授權房玄齡：“便宜從事，不複奏請。”有人告房玄齡，太宗即令腰斬，並命令房玄齡：“更有如是者，可專決之。”這雖然有收買人心的成分，但總體上說，對房玄齡的信任是沒有動搖的。雖然房玄齡此時受信任的程度不及長孫無忌和褚遂良，但以他的資曆和忠誠程度，他是有能力匡正唐太宗的一些過失的，但他沒有膽量直諫力爭，而是眼看著唐太宗錯殺劉洎等大臣，並錯誤地征伐高麗。
貞觀二十二年，70歲的房玄齡已是垂垂老矣，風燭殘年。唐太宗巡幸玉華宮去了，房玄齡因為舊病複發，“詔令臥總台省”。後來病情漸重，便“追赴宮所，乘擔輿入殿。”君臣相見，唐太宗淚流滿麵，房玄齡哽咽難言，他們都清楚地知道，30多年君臣相依的曆史就快要結束了。在君，再也找不到這樣鞠躬盡瘁、奉上忘身的臣子與朋友，在臣，再也不能輔佐這樣雄才大略、令人敬愛的英主再建功立業。此時此際，唐太宗與房玄齡的淚水和感情都是絕對純淨的，這在中國曆史上十分罕見。唐太宗命令多位名醫全力救療，“若微得減損，太宗即喜見顏色；如聞增劇，便為改容愴。”
垂危中的房玄齡脫盡了人世間的一切俗念，他傾吐不再唯唯諾諾，患得患失。他對唐太宗的感恩與忠誠也不容他萬事不理。對有些積鬱已久而不敢傾吐的話，他要喊出來，理直氣壯地喊出來，就像一生不鳴的天鵝在臨終時發出最嘹亮的歌唱，房玄齡在垂危之際完成了他一生中最漂亮的一次諫爭。
他諫爭的是唐太宗晚年最大的錯誤——征討高麗。唐太宗於貞觀十九年初出兵高麗，雖然取得了一些勝利，但在最後一仗中卻吃了敗仗，加之天寒地凍，士卒多病，不得已而班師。唐太宗對此耿耿於懷，立即策劃籌備，準備再征高麗，房玄齡很清楚地知道再征高麗必然會勞民傷財，為國家帶來災難，所以他對他的兒子說：“當今天下清謐，鹹得其宜，唯東討高麗不止，方為國患。主上含怒意決，臣下莫敢犯顏；吾知而不言，則銜恨入地。”於是，房玄齡抗表進諫：
臣聞兵惡不，武貴止戈。當今聖化所覃，無遠不暨，洎上古所不臣者，陛下皆能臣之，所不製者，皆能製之。詳觀今古，為中國患害者，無如突厥。遂能坐運神策，不下殿堂，大小可汗，相次束手，分典禁衛，執戟行間。其後延陀鴟張，尋就夷滅，鐵勒慕義，清置州縣，沙漠以北，萬裏無塵。至如高昌叛換於流沙，吐渾首鼠於積石，偏師薄伐，俱從平蕩。高麗曆代逋誅，莫能討擊。陛下責其逆亂，弑主虐人，親總大軍，問罪遼、碣。未經旬月，即拔遼東，前後虜獲，數十萬計，分配諸州，無處不滿。雪往代之宿恥，掩崤陵之枯骨，比功較德，萬倍前王。此聖心之所自知，微臣安敢備說。
且陛人仁風被於率土，孝德彰配於天。睹夷狄之將亡，則指期數歲；授將帥之節度，則決機萬裏。屈指而侯驛，視景而望書，符應若神，算無遺策。擢將於行伍之中，取士於凡庸之末。遠夷單使，一見不忘；小臣之名，未嚐再問。箭穿七劄，弓貫六鈞。加以留情墳典，屬意篇什，筆邁鍾、張，辭窮班、馬。文鋒既振，則管磬自諧，輕翰暫飛，則花葩競發。撫萬姓以慈，遇群臣以禮。褒秋毫之善，解吞舟之綱。逆耳之言必聽，膚受之訴斯絕。好生之德，焚障塞於江湖；惡殺之仁，息鼓刀於屠肆。鳧鶴荷稻粱之惠，犬馬蒙惟蓋之恩。降乘吮思摩之瘡，登堂臨魏徵之柩。哭戰亡之卒，則哀動六軍，負填道之薪，則精感天地。重黔黎之大命，特盡心於庶獄。臣心識昏憒，豈足論聖功之深遠，談天德之高大哉！陛下兼眾美而有之，靡不具備，微臣深為陛下惜之重之，愛之寶之。
《周易》曰：“知進而不知退，知存而不知亡，知得而不知喪。”又曰：“知進退存亡，不失其正者，惟聖人乎！”由是言之，進有退之意，存有亡之機，得有喪之理，老臣所以為陛下惜之者，蓋此謂也。老子曰：“知足不辱，知止不殆。”謂陛下威名功德，足可足矣，拓地開疆，亦可止矣。彼高麗者，邊夷賤類，不足待以仁義，不可責以常禮。古來以魚鱉畜之，宜從闊略。若必欲窮其種類，恐獸窮則搏。且陛下每決一死囚，必令三覆五奏，進素食，停音樂者，蓋以人命所重，感動聖慈也。況今兵士之徒，無一罪戾，無故驅之於行陣之間，委之於鋒刃之下，使肝腦塗地，魂魄無歸，令其老父孤兒、寡妻慈母，望車而掩泣，抱枯骨以摧心，足以變動陰陽，感傷和氣，實天下冤痛也。且兵者凶器，戰者危事，不得已而用之。向使高麗違失臣節，陛下誅之可也；侵擾百姓，而陛下滅之可也；久長能為中國患，而陛下除之可也。有一於此，雖日殺萬夫，不足為愧。今無三條，坐煩中國，內為舊王雪恥，外為新羅報仇，豈非所存者小，所損者大？
願陛下遵皇祖老子止足之誡，以保萬代巍巍之名。發沛然之恩，降寬大之詔，順陽春以布澤，許高麗以自新，焚淩波之戰船，罷應募之眾，自然華夷慶賴，遠肅邇安，臣老病三公，旦夕入地，所恨竟無塵路，微增海嶽。謹罄殘魂餘息，預代結草之誠。倘蒙錄此哀鳴，即臣死且不朽。
房玄齡此表是嘔心瀝血之作，忠君憂國之情溢於言表，唐太宗看到後非常感動，對自己的女兒、房玄齡的兒媳高陽公主說：“此人危如此，尚能憂我國家。”可悲的是房玄齡最後的忠誠雖然感動了皇帝，但他的意見並沒有得到采納，唐太宗當時並沒有放棄再征高麗的計劃。
唐太宗讓人在苑牆上開了一道門，不停地派人看望房玄齡。他又親自來到房玄齡的病榻前，握手敘別，悲不自勝。當著房玄齡的麵，任命房玄齡的兒子房遺愛為右衛中郎將，房遺則為中散大夫。房玄齡死後，“廢朝三日，冊贈太尉、並州都督，諡曰文昭，給東園器，陪葬昭陵。”
房玄齡畢其一生的才智與精力，輔佐唐太宗李世民平定四方，奪取皇位，治理天下，其謹慎與忠誠冠絕當時。貞觀之治是中國封建時代最輝煌的時期，房玄齡個人也是曆史上為數不多的成功宰相。他一生忠君修身，也注重對子孫的教育，經常教訓兒子不要驕奢沉溺，不要仗勢欺人，他把古今聖賢們的家訓收集起來，寫在幾具屏風上，讓兒子們各拿一具，並說：“若能留意，足以保身成名。”
可惜的是，他的兒子們終於沒能保身成名。事情出在兒媳婦高陽公主身上。這位公主驕橫霸道，又得太宗溺愛，因而，房遺愛也就“特承恩遇，與諸主婿禮秩絕異。”房玄齡死後，長子房遺直繼承了房玄齡的封爵，高陽公主心裏不滿，想把這份家業奪過來。高宗永徽年間，高陽公主誣告房遺直“無禮於己”，高宗派長孫無忌調查此事，沒想到查出了房遺愛和高陽公主謀反的事來，房遺愛被殺，高陽公主自盡，連累得房遺直也除名為庶人，房玄齡配享太宗廟庭的資格也被取消了。