退耕還林後對林木的管護十分重要，為了防止套種和複耕，林業部門也應經常進行檢查，但由於缺乏工作經費，有的便采取了聽之任之，睜一隻眼閉一隻眼的態度，不但存活率底，林木長勢很差，還出現了套種和複耕的現象，退耕還林工作的效果也就大大地打了折扣。
計劃滯後、資金滯後，也是造成基層工作被動、老百姓產生疑慮，以致影響退耕還林工作進展的一個問題。特別每畝地的５０元苗木費，本來很多地方就反映標準太低，無法買到優質種苗，再加以資金遲遲不到位，意見也就更多了。各地由於氣候條件不同，植樹季節也不同，於是不少地方竟出現了植樹季節已過才拿到種苗款的情況。四川省涼山州某縣部分區鄉竟遲遲不兌現農民的種苗款和醫藥、教育補助費，全縣滯留約２０萬元，審計部門已經提出了意見，但這些區鄉仍一味拖延，不予改正。
至於在退耕還林（草）工程中如何提高科技含量，更是薄弱環節了。
把退耕還林當作“政績工程”的，在考察中也有發現，以後將專門涉及，此處就不再贅述了。
又會“造林不見林”嗎？
天然林保護工程是另一項重要的生態建設工程，目前也麵臨許多問題需要認真解決。
隨著近年來國家對生態建設的重視和生態投入的增加，各地也紛紛提出了建設生態縣、生態市乃至生態屏障的口號，但目前由於體製上缺乏統一管理、實施上缺乏科學規劃，於是生態項目的確定、資金的使用乃至國家行政部門管理的職能劃分等方麵，都存在一定的盲目性和隨意性。這些問題也反映在天保工程上。
甘孜藏族自治區州基層林業部門反映，州林業局最初要求他們先在江河沿岸造林，剛剛開始執行了，又改為先搞“綠色通道”——在公路沿線造林。涼山州一些縣反映，安寧河流域的規劃一會兒是林草結構，一會兒是林藥結構；對經濟林和生態林的比例，哪些算經濟林、哪些算生態林、哪些算兼用林，標準也不斷變化，具體操作時十分困難。
由於對生態環境建設管理職能的規劃既不明確也不科學，計委、林業、水利、畜牧、環保、國土乃至財政都承擔著生態建設任務，由於體製上的混亂，多頭建設、多頭管理，於是在有的地方便出現了互相爭項目、爭資金以及政出多門、互相掣肘的情況。再加上有的項目確定時本身便有一定盲目性，於是表麵看來熱熱鬧鬧、轟轟烈烈，但或重複建設，或缺乏針對性，浪費了國家資金，而實際上卻不解決問題，收效甚微。
根據２００２年８月底新頒布的《中華人民共和國水法》，國家將在重要江河、湖泊設立流域管理機構，但是，從目前我國條塊分割、部門分割的實際情況看來，對長江真正實行流域管理還相當困難。
和退耕還林（草）工程一樣，天保工程在資金投入上“一刀切”的現象也十分突出。
以四川公益林建設為例，國家統一規定人工植苗每畝投資２００元，其中中央投資８０％，地方配套２０％。但實際上由於地方財力緊張或對造林認識不足，絕大多數地區並沒有配套。而西部的高寒、高海拔地區以及岷江、大渡河、雅礱江、金沙江、嘉陵江流域的幹旱幹熱河穀地區，由於生態環境極度退化，造林難度很大，不但成活率、保存率低，需要多次補植，還往往要輔以引水工程或其它措施，按每畝地１６０元的投入計，實在無法保證工程的順利實施。按現在的實際成本，第一年每畝需４００～１０００元，加上以後的補植、管護，費用更需增加一倍到兩倍。因此有的地方反映：“造一畝虧一畝，林業部門背不起，地方財政也背不起，不如幹脆不造！”
根據這種情況，有的地方建議，在財力不足的情況下，國家能不能突出重點，集中資金在關鍵地區先進行治理，提高質量，造一畝算一畝。他們說，如果不改變這種“撒花椒麵”遍地開花的辦法，１０年後，可能“造林不見林”的現象又會出現了。
禁伐令下達、實施天保工程後，缺乏配套措施和實施細則，在貫徹時便產生了許多新的矛盾，遇到了許多新的問題。
人工林的商品材采伐和生產建設、人民生活用材如何解決都是首當其衝的大問題。
雲南省元謀縣反映，封山育林根本封不死，真要封死了，老百姓的燒柴怎麼解決？牲畜的放養又怎麼辦？元謀縣正爭取成為沼氣示範縣，也想推廣圈養，但這些既要經費又要時間，短時間內辦不到……
瀘定縣在製止老百姓砍伐燒柴時，老百姓們說：“連燒柴都不準砍，你把我們殺了算了！”
青衣江畔寶興縣的磽磧鄉是一個藏族鄉，有３０多戶農民要求建房，報告交上來一摞，縣上無法解決，包括有戶農民住房被火災燒毀也無法解決——砍伐人工林吧，還沒有成材，天然林呢又全部禁伐……老百姓們意見很大。
甘孜州壤塘縣３萬多人，上麵下達的建房、燒柴指標一年僅僅３萬立方米，縣城用去２萬立方米，剩下１萬立方米分給１１個鄉，一個鄉不足１０００米。這裏冬天冷到零下二三十度，怎麼夠？宗科鄉一個村共２４５戶，隻給了８０立方米建房和燒柴指標，而藏區人民建一幢房至少得有用６０～８０立方米木材，怎麼辦？有家老百姓房屋是紅軍時代被燒的，牆已經裂開，必須重修，村上隻給了３方指標、連梁、柱都不夠，最後這個老百姓隻得去犯法砍樹林……
自留地、自留山上的木材不準砍伐，老百姓們意見更大，他們質問政府：“我自己栽的樹，為啥不準砍？”“為啥爺爺栽的樹連孫子都不準砍？”政府工作人員無言以對。據四川洪雅縣林業部門反映，每一年全縣總要查處１０來起把自留山上的木材悄悄賣掉的人，農民們也曾毆打過林政執法人員……
樂山市夾江縣一戶農民房子破舊了，兒子要結婚，便砍了自家房前房後一些樹，被人舉報了。當林政人員前去處理時，看見這家農民十分貧窮，連條豬都沒有，老母親又患了病……咋辦？最後隻得把木材給他沒收了。但處理後，林政人員們心裏都十分難受……
這些問題都是每一天、每一月發生在老百姓中間的具體問題，單靠簡單的行政命令是不能解決的。如果處理不好，很可能引發社會矛盾，使生態建設前功盡棄。
因此，許多地區建議，對生態建設，國家應該作為係統工程來加以考慮，要考慮長江上遊地區的產業結構問題，老百姓的吃飯和致富問題，民族文化的保護和發展問題等等，並且應重視和研究在生態環境建設中，如何與市場經濟接軌，包括生態林、商品林、自留山自留林如何區別對待，采取不同的政策等等。
與這個問題相聯係的便是森林管護問題。
２０００年以前，森林管護按人均１８７公頃（２８０５畝）的標準執行，２００１年以後，全國統一為人均管護３８０公頃（５７００畝），翻了一番，在山高林密的高原地區按這樣的麵積進行管護，實在難免力不從心。
林業人員們常說：“造林造林，實際是兩分造八分管。”“幾十年來按上報的造林麵積算，早就把中華人民共和國的國土覆蓋了幾遍，為啥會造林不見林？原因一是虛報浮誇，報了假數字；一是隻造不管，管它成活不成活。”
難道我們還要走這條老路？
一人管護３８０公頃，一年１萬元（實際８０００元）工資，隻解決了人頭工資，防火、道路、交通、防治病蟲害又怎麼辦？
據說各地針對森林管護都編了許多方案，但因為自２０００年以後國家停止支付森林撫育和病蟲害防治等費用，於是這些方案便都束之高閣，直到發生問題後才想法去救火。
與森林管護相聯係的便是森林撫育問題。
考察期間，我曾到過涼山州金沙江幹熱河穀會東縣的黑嘎杉木林基地，麵積３５００畝，是縣林業局職工劉光成、胡書洪、秦開金等六人１９８４年克服許多困難，在荒山上一麵修房子一麵育苗，一擔擔挑水灌溉培育成功的。曾接待過許多外國專家前來考察。到２００１年，這裏的杉木林已經密密層層，粗的有二三十公分，細的四五公分。由於從來也沒有砍伐過，又不準進行間伐，有的地方黑黢黢的，連人都進不去。地上滿是橫七豎八的枯枝和斷枝，由於營養不良和別的原因，有的葉片已經變成黃色和紅色。
因此，當地林業部門多次呼籲，請求批準他們實行間伐，對森林進行撫育，以免進一步影響林木的生長。
像黑嘎杉木林基地這樣的森林還有不少，僅四川省２０世紀８０年代初大麵積營造的速生豐產林，目前成林的麵積便有１９４萬公頃（２９１０萬畝），每年可出商品材１６４萬立方米。許多林業工作者反映，過去亂砍濫伐是不對的，現在一律不準砍伐也違反了科學，失之偏頗，不但無法獲得經濟效益，也影響了林木的生長。他們建議國家應盡快完備天保工程的配套措施和實施細則，包括對森林實施分類經營，在加大對天然林的保護、嚴禁采伐的同時，允許對人工商品林、自留山自留林進行合理利用。
在實施天保工程中，各地都在鼓勵大戶承包荒山造林，但這方麵的政策也有待完善和明確。
四川省涼山州西昌市早在２０世紀８０年代中期就開始探索這項工作，目前已有幾百個造林大戶，其中代表人物便是全國綠化先進個人胡孝怡。
胡孝怡是１９８４年開始承包荒山造林的。促使他走上這條道路的是１９８３年家鄉發生的兩件事：一件是漲洪水時房屋、田地都被衝垮；一件是伐木時設計不當砸死了一個工人……
最初他隻想用十幾年時間造林５０００畝，但是在當地政府的支持下，他從８５０畝逐漸發展到了１１．６萬畝，其中花椒、梨樹、石榴等經濟林約１萬畝，桉樹、鬆樹等生態林、人工商品林１萬餘畝，據估計，活立木蓄積達６０萬立米，固定資產約１萬元。
除造林外，他還先後開發了旅遊業，投入３０００萬元巨資建立了垃圾處理廠，並成立了生物實驗室，研究對林產品如何提高科技含量，進行立體開發。
但是，如今胡孝怡卻是滿腹牢騷，他說：“一提起林業我心肝五髒都在痛，真是傷心……”