依照上麵的論述，我完全相信，在係統的漫長曆程中物種一度產生變化，就這我已進行了複述。這基本上是經由對數之不清的不間斷的、微小的，有利的變異進行自然選擇來實現的；而且采用重要的方式；也就是借助器官的使用與不使用的遺傳效果；還有不重要的方式，即有關於不管過去或現今的適應性結構。其產生依賴於兩個方麵，一方麵是外界條件的直接影響，另一方麵是對我們來說仿佛是無知的自發變異。看來以前在自然選擇以外使得結構上永久變化的此種自發變異的頻率與價值，是被我低估了。可是由於近來我的結論曾被極度歪曲，而且有人說我把物種的變異全部歸因於自然選擇，因而請允許我指出，在本書的第一版，以及在今後的若幹版中，這樣一段話曾被我放在最顯著的地位--《緒論》的結尾處：“我相信，‘自然選擇’是變異的最關鍵的但並非獨一無二的手段。”此話並未產生什麼作用，可盡管根深蒂固的誤解力量這樣之大，科學的曆史亦會說明，此力量是不會長久延續的。
讓人無法想象的是，某種虛假的學說竟然也可以如同自然選擇學說那般給上述幾大類的事實以這樣令人滿意的解釋。有人近來反對說，此種討論方法存在欠缺；然而，該方法是用以判斷一般生活事件的，而且頻繁地被最偉大的自然哲學者們所運用。光的波動理論就是這般而來；而地球環繞中軸旋轉的看法，至今還未找到直接的證據。倘若誰要說科學對於生命的本質或起源這一更高深的問題還未提出解釋的話，這並非有力的異議。誰可以說清地心引力的本質是何呢？但是無人會反對依據地心引力這一未知條件得出的結論；雖然以前列不尼茲曾經對牛頓發難，說他把玄妙的性質與奇跡引進到哲學裏來了。
我無法找到好的理由來說明本書所提出的觀點何以會震動一切人的宗教感情，記住下麵情況，你就會明白此種印象是多麼短暫--人類曾有過的最偉大發現，也就是地心引力法則，曾經也被列不尼茲攻擊為“自然宗教的覆滅，因而推理也是啟示宗教的覆滅”。某位知名的作者兼神學者給我寫信說，“他已慢慢感到相信‘神’創造出某些少部分原始類型，它們自己可以發展成另外的必要類型，與相信‘神’需要某種新的創造作用以補充‘神’的規律作用所產生的空虛，一樣都是崇高的‘神’的觀念”。