鄧寶珊將軍四處會晤閻錫山、宋哲元、韓複榘，懇勸他們同仇敵愾，抗擊日本侵略者；又到西安與楊虎城、張學良進行了晤談。
“西安事變”發生後，鄧寶珊讚同張、楊義舉，他應處境艱難的楊虎城之邀，前往西安相商善後之策。
在西安，他根據中共中央一致抗日政策的精神，努力做各派之間的團結工作。他認為蔣介石除楊的決心已下，而楊進行武力抵抗又不可能，且牽動大局，經與楊磋商，決定自己出麵見蔣，為楊斡旋，由蔣給楊以“出國考察”的名義。
到南京見蔣介石時，鄧寶珊從容地對蔣說：“此次西安事變實在是一個非常事件，楊虎城誠然對不起委員長，但委員長素以聖賢之心為之，當按非常辦法對待。這樣會使中外人士更加敬佩！”接著，鄧寶珊又主動提出東北軍、西北軍整編問題，陳述了楊的要求。
第二天，蔣邀鄧吃便飯，席間答應讓楊虎城出國。
1937年6月，鄧寶珊在上海將楊虎城、楊明軒、宋綺雲等人送上了輪船，才放心地轉回西安、蘭州。
這一係列的活動，使得我們知道，這位將軍，是一位很有睿智，很有能力，很有才華的將軍，他利用自己的身份，救了許多人！也使得蔣介石對他十分有好感。
1937年10月，蔣介石將駐甘肅的新一軍與駐榆林的86師合編為21軍團，軍團長鄧寶珊即由蘭州飛榆赴任。
而鄧到榆與高雙成坦誠合作，組織7000人的伊東遊擊縱隊，挺進包頭附近抗戰。同月，日本占領晉西，大同等地失守，秦晉河防吃緊。鄧寶珊派出主力部隊封鎖包頭至賀家川（神府縣治地）以北河防，並在龍泉設立辦事處，與邊區溝通，商請八路軍後方留守部隊擔任賀家川以南至軍渡一線河防。10月28日，八路軍陳奇涵部入境，中共特委、縣委設在軍隊中，以民運部、民運科的名義活動。12月，國共兩黨簽文宣布綏、米、清、佳、吳5縣為統一戰線區，八路軍在龍泉建立警備司令部，國民黨派頑固派何紹南任綏德專員。
此時，本境邊區、國統區，統一戰線區彼此交錯。
而在整個抗戰期間，鄧與陝甘寧邊區一直保持著睦鄰關係。
其實，他和高雙成也很清楚地知道，自己的榆林的位置，如果不與共產黨的關係搞好的話，那他們的處境會很危險的！那邊的內蒙的沙王，沙王底下的某些人在蠢蠢欲動，想投日本，想獨立；東邊是天天想撲過來的日寇，西邊是馬鴻逵的騎兵，南邊是陝甘寧邊區，他們的榆林處於四麵受敵的！
當然，共產黨對於他們一直在做各種工作。
鄧寶珊還多次到延安，與毛澤東、朱德、賀龍等同誌晤談。1943年5月，共產國際宣布解散，蔣介石乘機掀起第三次反共高潮。鄧寶珊曾電邀南漢宸到榆林，共商對策。1943年6月，當蔣介石電令鄧繞道寧夏去重慶時；他有意經過延安，並留住二十多天。他受到毛澤東、朱德等人的熱情接待，相互徹夜長談。參觀了邊區的各種自己生產的東西，包括共產黨的中央領導幹部紡線線，震撼了鄧寶珊。