鄧寶珊十分欣賞共產黨的抗日主張，減租減息的主張。
抗戰勝利後的第二年2月，鄧寶珊作為國民黨六屆中央執行委員，出席了在重慶舉行的二中全會。會後，他回到三原家中，托詞“養病”，表示不願再去榆林，以免卷入內戰漩渦。由於胡宗南再三催促，他才返回榆林。不久，所部曹又參旅在三邊起義，陝北保安副總指揮官胡景鐸在橫山起義。鑒於榆林的戰略地位。胡宗南將整編二十八旅徐保部兩個團，於1947年4月空運榆林；同時在榆林軍隊中安插了眾多的特務，對鄧進行監視和控製。
此時，共產黨派人動員他起義，可是，他畢竟跟國民黨有著幾十年的感情，一下子還轉不過來這個彎。
而且由於解放軍第一次第二次圍攻榆林，讓他惱火。他放棄了。
而平津暫以之時，鄧寶珊被傅作義請到了北平，因為共產黨要和平解放北平，鄧寶珊作為傅作義的談判代表，去跟共產黨的代表談判，而共產黨的代表，卻是林彪、羅榮桓、聶榮臻等諸位元帥，後來是毛澤東拍板。經過三天談判，達成了北平30萬軍隊出城改編，和平解放北平的協議。電達中共中央軍委主席毛澤東等領導後，毛主席表示，經鄧先生達成的協議是可行的，我們對鄧先生完全信賴。
北平和平解放了，保護了中國的許多文物。
北平《新民晚報》曾發表文章，標題是：“北平和談的一把鑰匙——鄧寶珊將軍”。
北平和平解放後，毛澤東、周恩來等在西柏坡和北平多次會見他，共商建國大計。國民黨南京政府立即宣布開除了他的黨籍。
在這個時候，鄧寶珊是榆林的陝北總司令呢！
所以榆林的部隊都聽他的話——但是，也有區別，因為裏麵被蔣介石安進來許多的特務，他們在搗亂。
就在1949年一月，鄧寶珊在北平為傅作義做代表談判的時候，他的手下，國民黨22軍86師的某些個中統特務，帶著一群人，裹夾著一群不知真相的人們，冒著三九天的寒風，冒著大雪，凍得一個個鼻青臉腫第，繞道寧夏，從被冰封了的黃河的冰麵上麵——冒著隨時都可能掉進黃河的生命的危險，騎馬飛奔了過去，一口氣跑到了歸綏，也就是今天的呼和浩特，當時是綏遠省的省會。
其中就有謝雲山和梁玉靜！他們自己看不清方向，又被人家蠱惑的，還對國民黨當局抱著某種幻想，又怕共產黨來了，自己做了多年的國民黨黨務的記錄員，。