拿破侖在簽署停戰協議這個大喜事之前，向督政們發回的報告，其語氣是近乎傲慢的；這反映了他當時已自信他能主宰局勢的發展。他曾經就對待撒丁的政策問題，向督政們提出了建議；他指出，鑒於撤丁國王維克托?阿馬迪厄斯已放棄了他的三個大要塞，他實際上已處在法國軍隊的掌握之中。
“如果你們不同意與他締結和約，如果你們的計劃是要推翻他的王位，那麼你們得先讓他高高興興地過幾旬；而且，你們得事先告訴我。那樣，我就可以拿下瓦蘭察，並且向都靈進軍。”
拿破侖表明，在軍事問題上他是不容許來自巴黎的幹預的。他要
求督政府從克勒曼將軍的阿爾卑斯山方麵軍征調15000人來增援他的部隊。
他寫道：“這樣就可以使我的這個方麵軍擁有45000人的兵力，也許我可以將其中的一部分派去攻打羅馬。如果你們繼續信任我，並且讚成以上計劃，我是有把握成功的；意大利就會是屬於督政府的地方了。”
不久，督政們表示，可以批準他所要求的增援；但又規定，軍隊的一部分應當留在米蘭地區由克勒曼指揮。對此，拿破侖於5月15日作了答複：鑒於奧軍的增援部隊已經到達，法軍如果分散指揮權，那是十分失策的。兩位將軍都有各自的作戰方式。克勒曼將軍經驗更豐富，無疑更善於指揮部隊；但是如果把兩個司令官擺到一處來指揮一個部隊，就會把事情弄糟。
這次又是督政們犯了錯誤。他們想要讓拿破侖遵守其他將軍們都得遵守的規則，這些規則是1793年迪穆裏埃叛逆案以來就實施了的；在這點上，督政府無疑是想照顧共和國的根本利益。督政府們的本意，是力圖防止大將專權反戈的情況出現；但是，他們這樣做時，卻違反了戰略上的基本原則，即：軍事行動要求統一指揮。
拿破侖提出的反駁，是他們無法回答的。後來，關於分兵給克勒曼指揮那個糟糕的方案，就再沒有提了。
撒丁王國已跪在了腳下，拿破侖並不滿足，他的眼睛正盯著波河對岸的奧軍，米蘭——這個意大利北部美麗而富庶的城市，正是他計劃中的下一個目標。
在給部隊發放軍響並重新裝備好部隊之後，拿破侖準備東進了。他要把奧軍一舉攆出倫巴第，而米蘭則是督政府賦予他的最後目標。
拿破侖既已掌握了原屬撒丁王國的三個要塞，他現在就有了極好的作戰基地。這三個地方雖然將來要交還給撒丁國王，但是在締結正式和約以前，這些地方應由法軍征用。
奧軍由於遭到其意大利臣民的敵視而受到削弱；尤其不利的是，奧軍終究隻能依靠經由曼圖亞、從阿爾卑斯山脈以北抽調來的增援部隊。不過，在富饒的倫巴第平原作戰，奧軍卻有一個有利條件，而在亞平寧山脈的亂石叢中他們是不具備這個條件的。在平原上，奧軍的將領們可以施展他們引以為自豪的戰術才能，而且他們的出色的騎兵，在平原上有可能與當年匈牙利和克羅地亞騎兵相比美。
因此，奧軍期待著法軍的進攻；他們沒有因為最近連吃敗仗而沮喪；同時，他們還因懷有一種想法而興奮起來，他們認為，法軍不擅長打正規戰，一到了平原地區，就會喪失其在山區曾經贏得的那點虛名。但是，對拿破侖這位具有特殊才能的人物說來，意大利戰役第二階段的這個作戰地區，並不見得就不如第一階段的作戰地區有利。而在那個地區，他作為司令官，旗開得勝，贏得了赫赫戰功。前一階段，在亞平寧山區，隻能調動小股的部隊投入戰鬥；即使指揮騎兵與步兵缺乏經驗的將領，也能在戰術上初試鋒芒，滿有打勝仗的機會，在山區打仗，主要的要求是：動作快，幹勁大，能迅速占領中心製高點；在山區，調動大批人馬作戰是不行的。