為了控製疾病是神賜予的謬說，希波克拉底努力探究人的肌體特征和疾病的成因。經過長期研究，他終於提出了體液學說。
希波克拉底認為，人的肌體是由血液、粘液、黃膽和黑膽這四種體液組成的。這四種體液在人體內的混和比例是不同的，從而使人具有不同的氣質類型：多血質、粘液質、膽汁質和抑鬱質。疾病正是由四種液體的不平衡引起的，而體液的失調又是外界因素影響的結果。他對人的氣質的成因的解釋雖然並不正確，但是提出的氣質類型的劃分以及它的名稱，卻一直沿用到現在。
那麼，有哪些外界因素會影響到體液失調呢？希波克拉底專門寫一本題為《論風、水和地方》的醫學著作，來論證自然環境對人體健康的影響。他指出，醫生進入一個城市的時候，首先要注意到這城市的方向、土壤、氣候、風向、水源、水質、飲食習慣、生活方式等等，因為這些都會對人體健康產生影響。
公元前430年，雅典發生了可怕的瘟疫。許許多多的人突然發燒、嘔吐、抽筋，身上長膿瘡，不久又引起潰爛、腹瀉。瘟疫蔓延得非常迅速，城裏到處是屍體，連享有盛名的雅典將軍伯裏克利也被傳染，不久死去。
當時，希波克拉底正在馬其頓王國擔任禦醫，聽到這個消息後，立即辭去禦醫職務，冒著生命危險，趕到雅典進行救護。到雅典後，他一麵調查瘟疫的情況，探求致病的原因，一麵治病，並尋找防疫的方法。不久他發現，城裏家家戶戶有染上瘟疫的病人，唯有鐵匠一個也未被傳染。由此聯想到，鐵匠打鐵，整天和火打交道，也許火可以防疫，便在全城各處點起火來。
希波克拉底還寫了一篇題為《預後》的醫學論文。他指出，醫生不但要對症下藥，而且要根據對病因的解釋，預告疾病發展的趨勢、可能產生的後果或康複的情況。“預後”這個醫學上的概念，正是希波克拉底第一次提出來的，直到現在還在使用。
長期的醫療實踐和理論研究，使希波克拉底積累了豐富的醫學經驗。他發現，人在40～60歲之間最容易發生中風；發生黃疸的時候，如果肝變硬，那末預後是不良的；人死亡前，指甲發黑，手腳發冷，嘴唇發青，耳冷且緊縮，眼睛模糊。其中對垂危病人麵容的具體描述，被後人稱為“希波克拉底麵容”。
據說，希波克拉底與古希臘傑出的唯物主義哲學家德謨克利特交情頗深。德漠克利特致力於自然科學和哲學的研究，不善理家業。他的族人便以瘋癲和敗家的罪名起訴他，目的是霸占他的財產。希波克拉底在為特謨克利特治病時，發現眼前所謂的“病人”根本不是瘋子，而是一個智慧出眾的思想家。於是，他出庭據理力爭，終於使德謨克利特無罪釋放了。
古代西方醫生在開業時都要宣讀一份有關醫務道德的誓詞：“我要遵守誓約，矢忠不渝。對傳授我醫術的老師，我要像父母一樣敬重。對我的兒子、老師的兒子以及我的門徒，我要悉心傳授醫學知識。我要竭盡全力，采取我認為有利於病人的醫療措施，不能給病人帶來痛苦與危害。我不把毒藥給任何人，也決不授意別人使用它。我要清清白白地行醫和生活。無論進入誰家，隻是為了治病，不為所欲為，不接受賄賂，不勾引異性。對看到或聽到不應外傳的私生活，我決不泄露。”這個醫道規範的製定者就是希波克拉底。1948年，世界醫協大會對這個誓言加以修改，定名為《日內瓦宣言》。後來又通過決議，把它作為國際醫務道德規範。