施琅對台的政策是：以剿為主，因剿寓撫，堅決主張以武力收複台灣。這與姚啟聖的政策可謂相輔相成，但也因此引起施、姚二人對台作戰方案的爭執。
為解決總督、提督間的不和，康熙毅然授予施琅專征台灣的大權，命姚啟聖負責軍需供應，在將領的選拔安排上，均依施琅所奏，使之能指揮如意。
平定三藩之時，康熙常常不顧眾議，堅持己見，指揮布置平叛戰役，然而對攻取台灣的戰鬥布署則很少表態。他說：“自用兵以來，凡陸地關山險隘，相度形勢以上為進，朕往往能懸揣而決。海上風濤不測，涉險可虞，是以朕不強之。”因自己不熟悉海戰情形，便不遙控指揮，充分尊重統兵將領的意見，使將領的才能得以盡情發揮。這大概是由於他所尊奉的“知之為知之，不知為不知”這句聖訓所致吧。
台灣收複後，竟意外地出現了對台灣是棄還是守的問題。原來積極支持收複台灣的大學士李光地借口惟恐發生新的割據局麵，提出：“重洋之險，守則必設重戍，設重戍而固業其子孫，一旦瀕海有警，隱然有夜郎自大之勢。”更為荒唐的是，他竟企圖將台灣拱手奉送給荷蘭，說：“乘國威遠播，予其地與紅毛，而今世守輸貢，乃永逸長安之道。”李光地是福建人，因困於海寇騷擾，故主張統一，統一後又怕戍守台灣會增加福建人民負擔，故有此前後矛盾的舉動。
施琅親至台灣，經過實地調查，上疏朝廷備述台灣的戰略地位及放棄之後可能產生的不良後果，斷言“棄之必釀成大禍，留之則永固邊圉。”福建總督姚啟聖，都察院右都禦史趙土麟等也先後上疏，反對放棄台灣。
康熙同意施琅等人意見，但因放棄收取台灣問題事關重大，所以，廣征群臣意見。他問李光地，台灣目前是否有形成割據被外國侵占的危險，李光地回答：“目下無妨，以皇上之聲靈，幾十年可保無事。”康熙聽後明確表示：“如此且置郡縣，若計到久遠，十三省豈能長保為我所有邪？”
由於康熙意圖堅決，群臣相繼讚同駐兵守衛台灣。康熙二十三年（公元1684年），於台灣正式設立地方政府，派兵駐守，差員辦理政務。
點評：
用人不疑難，用降將叛將而始終不疑就更難了。中國人素來重視“忠臣不事二主”，對叛降之人難免心懷疑點。而康熙對施琅的重用則體現出他的深謀遠慮和“任人之道，重在不疑”。
6.人盡其才，書生建奇功
漢高祖劉邦征戰南北，主要靠的是武將。他一向認為，讀書人派不上大用場，因此，也最討厭書生在他麵前賣弄文采。但是，劉邦用陸賈，卻打破了慣例。
陸賈是楚國人，他滿腹才學，胸懷大略，作為劉邦的幕僚，跟隨其左右，為劉邦出謀劃策，屢建奇功。漢初，中原人趙佗在南越自立為王，自然成為劉邦統一天下的一個障礙。為招撫趙佗，劉邦特派陸賈前去做工作。
趙佗聽說漢使到來，不以為然，很不禮貌的接待陸賈。陸賈一見趙佗，便正氣凜然地說：“足下是漢人，親戚、胞弟和祖墳也都在真定。現在您卻忘記了我們的風俗和傳統，竟然想憑借南越這一小塊地盤與漢朝抗衡，等待您的隻能是大禍臨頭。以前秦朝失掉政權，各方英雄豪傑紛紛起來抗爭，唯有漢王先進入關中，占據鹹陽。項羽自立為西楚霸王，諸侯們都附歸於他，可以說是夠強盛的了。然而，漢王在五年之內就消滅了項羽，平定了海內。今天漢王聽說您自為南越王，將相們都主張討伐南越，隻是天子不想再讓百姓受連累，才派我帶南越王的金印授於您。您該早早出城廓迎接，北麵稱臣才是，而您卻不識時務，想以這一塊小地方稱霸，我們隻要派一隻偏將，率上十萬人，就能輕易將你打敗。”趙佗聽罷這一席話，趕忙起身謝罪說：“我久居邊遠地區，不懂禮節，請先生諒解！”
陸賈代表漢高祖拜趙佗為南越王，授給他金印，命令他向漢朝稱臣。陸賈圓滿完成使命回朝，劉邦大為高興，拜他為大中大夫。