蓋茨又獲得了與素有“藍色巨人”之稱的IBM公司即國際商用機器公司合作的權利。
上帝把機會給了蓋茨。IBM的代表回到西雅圖，和蓋茨簽訂了購買微軟公司操作係統的合同。微軟為IBM個人電腦設計製造操作係統，IBM按售出數量支付微軟費用，並不擁有操作係統的所有權。當時誰也沒想到，這一合約竟為電腦業建立了新秩序。據此，10年後，微軟取得了像IBM一樣的霸主地位。
“藍色巨人”這回是犯了一個大大的錯誤。他們一心隻想推出自己的個人計算機，和蘋果公司爭奪小型機市場。但卻沒有看到，未來的計算機市場，完全是軟件的天下，硬件支配市場的曆史已經結束了，IBM把一塊肥得滴油的肥肉，拱手送給了蓋茨。以致後來微軟竟然敢和“藍色巨人”叫陣，比權量力，要平分天下。機會已經獲得了，但當時的微軟公司除了具有最為自豪的BASIC語言外，可以說是一無所有。俗語雲：“謀事在人，成事在天。”當時，令蓋茨最為擔憂的一件事是，IBM公司是否會中途放棄他們開發個人電腦的計劃。他深知，這家公司總是同時進行著許多項目的研究，而最終能搞到底的隻有極少數的幾個項目。如果他們將項目取消，微軟公司除了得到一筆有限的研究經費外，將一無所獲。合約規定微軟得在3個月內向IBM交出一個穩定的操作係統。過去，比爾·蓋茨和艾倫曾在未完成阿爾泰的BASIC語言前，承諾交貨給MITS。現在，他們又向IBM保證，準時交出一項根本還沒開始設計的產品。
此時，西雅圖電腦產品公司已經設計製造出一套可用於英特爾8086的操作係統COP-DOS。西雅圖認為，這套係統隻是個實驗品。比爾·蓋獲知道這個廉價操作係統修改後可以用於IBM新電腦，遂由艾倫出麵與西雅圖電腦公司進行交易。談判結果是由微軟支付西雅圖電腦2．5萬美元，取得該係統的使用權。微軟沒有向任何人透露它與IBM的合作。棋走到這一步，蓋茨決定要大幹一場了。按照他的設想，他要準備設計一種開放性很強的操作係統，使其能夠容許多種應用軟件在上麵運行，這是第一步。憑著這一點，他的這個操作係統就比其他的操作係統更優越。第二步，他要讓這個係統掛在IBM開發出來的個人計算機上，借助“藍色巨人”的威勢，占領軟件市場。最終，使這個係統成為行業標準，使微軟成為操作係統的霸主。
這，就是蓋茨的戰略計劃。他要通過實現這一計劃，徹底改變微軟在操作係統領域的被動局麵，一統天下。
第二年，在IBM推出個人電腦前數天，微軟以5萬美元的代價向西雅圖電腦買斷DOS的所有權利。
微軟公司在談判時許諾：西雅圖電腦公司不僅可以繼續使用現在的DOS，更可以免費運用DOS的升級版本。此外，由於DOS是由帕特森最先發明的，微軟將這種免費使用的許可權同時授予了帕特森。微軟出5萬美元買斷整套操作係統的所有權。
西雅圖電腦公司的老板布洛克並沒有認清DOS係統的真正價值，認為這是一個合算的買賣，自己不但能夠繼續使用DOS，還能淨賺5萬美元，何樂而不為？
為了使布洛克盡快簽署合同，蓋茨又派巴爾默親自前往勸說。緊接著，在艾倫的再三催促下，布洛克簽署了這份合同。蓋茨終於從西雅圖電腦公司獲得了SCP-DOS操作係統的所有權。微軟公司正是依靠這套係統，發展出MS-DOS，從此成為軟件市場最大的獲利者。後來，西雅圖電腦公司控告微軟，要求補償，微軟又付給它近100萬美元。