1月：
12日，鹹豐命西淩阿、國瑞協助僧格林沁辦理軍務。
19日，奕偕大學士桂良、戶部左侍郎文祥，統籌全局，酌擬善後章程六條：（一）京師設總理各國事務衙門。（二）設南洋通商大臣。（三）新添各岸（通商口岸），由各省派員就近管理。（四）各省督、撫、將軍在辦理外事時，應隨時互相知會。（五）挑選八旗子弟學習英文、法文。（六）各海口內外商情及各國新聞紙按月谘報總理衙門。
20日，清廷以崇厚充任三口通商大臣，薛煥兼任上海通商事務；準旗人學習外國語言；命田興恕為欽差大臣，督辦貴州軍務。
同日，鹹豐下詔設置總理各國通商事務衙門（又稱“總理衙門”、“總署”），命恭親王奕與桂良、文祥管理之。此為中國政府有外交部之濫觴。
自1860年以後，清廷外交事務日益繁忙，而居要津，為辦好此務，特設總理各國事務衙門，派恭親王奕、大學士桂良、戶部右侍郎文祥負責管理。時文祥、桂良為軍機大臣兼領該衙之事。次年（1862年）恭親王奕以議政王總領軍機處。至此，軍機處與總理事務衙門漸合為一體。清代軍機處，初為承寫密旨之地，後則演變為定議取旨中樞權力機關，職同內閣。而原內閣與翰林院之擬議反而由軍機處審定。至奕總領軍機處與總理各國事務衙門後，外交之權位與軍機處等，駕於其它各部之上。自是而後，太後聽政、親王執政之新法章，代替不準親王、皇後幹政之舊規矩。清政府也就變成親王太後之裙帶政府，更加腐敗不堪。
總理衙門之職責，初為接待外國使節，及辦理外交事務，係一臨時機構。以後，則凡屬新政與外交均歸總理衙門負責，成為外務部、學部、傳郵部、工商部、海軍部及稅務機構之綜合體，其權力已淩駕於軍機處之上。
其附屬機關為總稅務司，設總稅務司一人，由洋人擔任。
下轄之各海關設稅務司一人，負責全關行政，亦由洋人擔任。
總理衙門之下，還有南、北洋兩大臣，為其外交總代表。凡對外國人議約、訂約、換約之事，概由北洋大臣或南洋大臣負責辦理。辦完後，報告總理衙門，再由總理衙門上報朝廷。
此外之特附機構為同文館，初為訓練翻譯人才之學校，後增至八館：英文館、法文館、俄文館、德文館、天文館、化學館、算學館、格致館。由八旗子弟與漢人之才俊考取之。設管理大臣一人總理之，下設洋教習、漢教習各若幹人。光緒二十七年（1901年）在各國政府要求下，廢總理衙門，改設外務部，專司外交事務，與六部並列。
文祥（1818～1876），滿族，姓瓜爾佳，盛京正紅旗人，進士出身。曆任尚書、軍機大臣。1860年隨奕留京和談。1861年參加廢除八王、大臣之辛酉政變（亦稱祺祥政變），升任軍機大臣。遂依靠洋人，裝備清軍洋槍、洋炮，建立神機營；並以此營鎮壓東北義軍。臨終前，對於喪失民心之清政府的未來，深為憂心。
24日，恭親王奕根據曾國藩、薛煥、袁甲三並瑞昌、王有齡等馳奏之“借夷剿賊”折，上奏己見。先是本年1月6日，鹹豐命奕議奏曾國藩、王有齡、薛煥等人複奏同意借洋兵事。本日，奕遵鹹豐命議奏：江南官軍，現尚未能進剿金陵，即令夷船駛往，非但不能收夾擊之效，並恐與賊相持，如薛煥所慮，勾結生變，尤宜預防。該撫所計劃令夷兵由陸路進剿，不但經過地方驚擾，即支應一切，諸多窒礙，夷性貪婪，一經允許借兵剿賊，必至索請多端。經費任其開銷，地方被其蹂躪。鹹豐諭：借夷助剿，英、法等國必因以占據城池，流弊滋多。自不可貪目前之利，而貽無窮之患。惟此時，初與換約，拒絕過甚，又恐夷性猜疑，轉生叵測，惟有告以中國兵力，足敷剿辦，將來如有相資之日，再當借助，以示羈縻，並設法牢籠。誘以小利。口弗夷（法國人）貪利最甚，或籌款購其槍炮船隻，使有利可圖，即可為我所用。倘上海夷人誠懇請求助兵剿賊，由曾國藩、薛煥，量為獎勉；倘有兵船駛入內地，即按照條約攔阻。並命該大臣等。就現有兵力，設法攻剿逆匪，無再觀望。
至睇夷槍炮，既肯售賣，並肯派匠役教習製造，由曾國藩、薛煥，酌量辦理。即外洋師船，現雖不暇添製，或仿夷船製造。或將彼船雇用，誘之以利，以結其心，而我得收實濟。若肯交雇助剿，隻可令華夷兩商（商人）自行經理，於大局或可有利無弊。由該督、撫斟酌試行。將來於通商各口關稅內，酌提取稅餉，仍濟軍需。（此是洋務運動之濫觴。）
其代運南漕一節，亦照恭親王等所議，由薛煥出示，招商運津。無論華商、夷商，一體販運，按照稅則，完納稅餉……咪夷（美國）性質校醇，與英、法情形不同，其應如何交往。使為我用……亦由曾國藩、薛煥隨時酌量情形，妥為辦理。
又諭：自英、法、美三國換約後，於上海通商各小國，亦欲赴京換約，命該撫（薛煥），預為杜絕，不令各小國經駛天津；並曉喻英、法、美三國，各小國不得與三國平列，一體換約，令其幫同阻止，方為妥善。如各小國不遵理諭，徑赴天津，惟薛煥是問。
又諭：吉、黑二省，與俄國相鄰，應於東三省加強練兵與防務。除習弓馬以外，兼習槍炮、技藝。以後，不得再調用東三省之軍隊，對俄國應嚴密防範。由景涫、麟瑞、特普欽等，妥議章程具奏。
27日，以左宗棠克複江西德興、安徽婺源，予其三品京卿。
2月：
5日，命官文、周祖培為大學士；肅順協辦大學士，沈兆霖為戶部尚書；朱鳳標為兵部尚書。
本歲中免江蘇、浙江、安徽三省額賦、欠賦，並直隸山東、河南、江西、湖北、湖南、福建、廣西等省四百餘州縣被災被兵額賦；馮桂芬上裁汰冗員奏章，裁撤長蘆鹽政，由直隸總督管理之。
合計中國人口二萬六千零九十二萬四千六百七十五人（不包括太平天國地區人口）。存倉穀數：五百二十三萬一千九百二十石四鬥六升。朝鮮人貢。
9日，英國專使額爾金於上月20日，令駐上海英海軍司令何柏偕領事巴夏禮“視察”長江各口岸，辦理開埠事宜，表示隻要太平軍允開商埠，即仍保持“中立”。本日，何柏自上海起碇。
12日，鹹豐詔令3月23日回鑾（回京）。
16日，清廷召翁同書來京，以李續宜為安徽巡撫。
17日，以福濟為成都將軍。
21日，忠王圍攻杭州，杭州戒嚴。
22日，鹹豐下詔：紀年開秩，應予特赦，非常數。原委不清者，鹹減除之。（十二年為一紀，鹹豐即位已十二年）。
25日，恒福病免，以文煜為直隸總督，譚廷襄為山東巡撫，鄧爾恒為陝西巡撫，何冠英代理貴州巡撫。
28日，鹹豐詔令袁甲三等：撚軍中有大量良民，未便概行誅戮，可剴切曉諭，設法將其解散；投誠者免罪，“殺賊”者立功，並傳知李世忠，一體招撫。
3日，太平軍陳玉成統領水路軍，自桐城西征，於十一天中攻克霍山、英山，進抵湖北省境。
3月19日，攻克湖北省黃州郡。此時湘軍圍困安慶，武昌空虛，陳即揮軍指向武昌。恰值此時，英國軍艦抵達漢口。
23日，英軍司令何柏派巴夏禮至黃州見陳玉成，阻止其進攻武漢。時天王亦正與英國訂立本年不進攻上海協定書。再過旬日，天王還將頒布《中西永遵約章》詔旨，陳玉成自主決定停攻武漢，改向麻城、德安進軍。數月後，李秀成率軍攻克大冶、興國等州縣，鑒於陳玉成北走，自主舍武漢而東撤，從湖北向江西撤退。因此之故李秀成、陳玉成會師武漢，力取長江上遊之戰略方針，完全破產。至9月，安慶被湘軍攻陷，太平軍守將葉芸來、吳定彩，率領將士二萬人進行巷戰，全軍陣亡。天京上遊屏障盡失，湘軍得以自安慶進逼天京。英國之幹涉，使太平軍未能完成安慶解圍，鞏固上遊之軍略，導致太平天國之失敗。
18日，鹹豐詔準山東抵還法國教堂地基；並命各直省：遇有交涉，即行著辦請旨，不許推諉。
24日，熱河朝陽“盜匪”攻破縣城，鹹豐命克光阿前往鎮壓。命明誼、明緒會勘中俄邊界；英蘊、奎英辦理俄人通商事宜。
29日，鹹豐下詔：“前經降旨，訂日回鑾。旬日以來，體氣未複綏，俟秋間再降諭旨。”
4月：
鹹豐下詔：挑選兵丁，演習俄國人送到之槍炮。
3日，洪秀全答應英國何柏、巴夏禮要求，太平軍不進入距上海、吳淞百裏之內地方。為期年內。但又稱此為“中西永遵和約”。
5日，清廷裁撤黑龍江團丁使之歸農。
10日，清廷派崇綸、崇厚為辦理條約事務大臣，給予全權，便宜行事；命侍郎成琦赴興凱湖會勘中俄邊界；命道員聯捷以四品京卿。辦理河防事務。
13日，恭親王奕請赴承德叩問起居。鹹豐手詔答之：別經半載，時思握手而談，隻是近日咳嗽不止，時有紅痰，尚須靜養，不宜多言，且待秋間再會麵敘談。
17日，鹹豐令皇長子載淳於5月16日入學，以李鴻藻充師傅。
19日，都興阿奏：鎮揚水師船隻年久損壞失修，請令廣東購運紅單船應用。鹹豐準奏。
21日，清廷命勝保督辦直隸、山東“剿匪”事務，派賈臻代理安徽巡撫。
5月：
1日，英、法侵華軍退出廣東省城。
2日，命前大學士彭蘊章代理兵部尚書。
7日，廣西“土匪”攻破太平府養利州城。
19日，山東撚軍等連克館陶等七縣城。
25日，據奏，江北糧台既有指捐、借捐、包船捐、畝捐，而江南糧台，又有米捐、餉捐、畝捐；漕河有炮船捐、堤工捐、餉捐；袁甲三軍營有米捐。此外，有船捐、房捐、鹽捐、卡捐、板厘捐、活厘捐，所征甚巨，報解（上交國家）廖廖。候補投效，以及職員生監，營謀劄委，目為美差，四出騷擾。指借則任意訛索；卡厘則以多報少；糧台漕河大員，多由情托，知而不問，並有擅自立卡，抽取商船捐銀。為此，鹹豐特諭軍機處：命督辦大員嚴定章程，以絕貪官侵漁。諭中說：近年因軍餉浩繁，不得不借資民力。若多立名目，任聽貪劣之員，橫征暴斂，中飽肥己，成何體統。命袁甲三、晏端書、王夢齡，並傳諭喬鬆年、江清驥嚴密訪查，如有多設名目，及營謀差委，任意訛索，以多報少，並私自設卡收捐者，即據實嚴參，懲一儆百。至所收捐款，亦應設立印簿，曉示通衢，以禁侵冒中飽之弊。並遴選公正之人，董事其事，不得濫委多員，虛耗薪水。