馬皇後這個女人，實在是一位偉大的女性，她做了那麼多大事，可是做人非常低調。朱元璋把她比作唐太宗的長孫皇後，她知道後，說：“妾聞夫婦相保易，君臣相保難。陛下不忘妾同貧賤，願無忘群臣同艱難。且妾何敢比長孫皇後也。”
（《明史·太祖孝慈高皇後傳》）
大家想想，誰能比她更了解朱元璋呀？她這時候就看出來朱元璋對群臣不放心了，所以借機規勸，希望朱元璋能夠做到君臣相保始終。
後來朱元璋興大獄，殺戮功臣，馬皇後雖然無力阻止，可是她從中多所協調。《明史》中說：“帝前殿決事，或震怒，後伺帝還宮，輒隨事微諫。帝雖性嚴，然為緩刑戮者數矣。”
（《太祖孝慈高皇後傳》）
馬皇後都做了哪些規勸朱元璋的事情呢？史書中列舉出來的這種例子實在太多了。從戰爭年代開始，馬皇後就在一些事情上規勸朱元璋，使他少犯了不少錯誤。
當時有人告訴朱元璋說，和州守將的兒子拿著長矛要殺父親。朱元璋大怒，這還了得！要讓人去把守將兒子抓來殺了。馬皇後說：“這個守將隻有這麼一個兒子，萬一傳言不實，殺了他就絕後了。”派人去調查，果然沒有傳說的那麼嚴重。
朱元璋的親外甥李文忠被人誣告不法。朱元璋想把他召回來治罪。馬皇後說，文忠守嚴州，是前沿之地，輕易不要換將。文忠是你自己的親人，怎麼會有不法圖謀的事？後來李文忠守嚴州立下了不小的戰功。
朱元璋當了皇帝以後，馬皇後這個賢內助起的作用更大了。很多事情都靠馬皇後調和其間，對朱元璋多有規勸，才有了較為妥善的結果。有一次朱元璋因穿的衣服不合適，向周圍人大發脾氣，馬皇後看到後，對他說了這麼一句話：“你難道忘了當年貧賤艱難，根本沒有一件像樣衣服穿的時候了？”朱元璋聽了，十分震動，沉默良久，回想起當年打天下的艱苦日子，當即不再說話，也不再發脾氣了。
所以朱元璋說：家之良妻，就好比國家的良相，要想讓家庭和睦，就必須有一個像馬皇後這樣的良妻。
還有這樣一個傳說，大財主沈萬三因為出錢修了南京城，又提出要犒賞三軍，朱元璋說他：“匹夫犒天子軍，亂民也，宜誅。”馬皇後說：“妾聞法者，誅不法也，非以誅不祥。民富敵國，民自不祥。不祥之民，天將災之，陛下何誅焉。”
（《明史·太祖孝慈高皇後傳》）
結果朱元璋就沒有殺沈萬三，而是把他充軍到雲貴去了。其實沈萬三在朱元璋建立明朝前就去世了，朱元璋怪罪的是沈萬三的兒子，所以這段故事隻是個傳說而已，但人們為什麼要編出這樣的故事呢？當然是因為馬皇後為人善良，處事得體，在打天下的時候，勸朱元璋不殺人，當了皇後，還是規勸朱元璋不要亂殺人，因此得到了後人的尊敬和愛戴。
如果說沈萬三是個傳說，那宋濂的故事可是確有其事。因為孫子宋慎被定為胡惟庸黨，宋濂也將被株連處死。馬皇後勸諫說：“宋先生是太子的老師，民間家裏請了老師，都要禮遇始終，何況天子？再說宋濂已經不在朝中，他在家裏未必知道孫子的事。”朱元璋那時候一心要殺功臣，馬皇後怎麼勸他都不聽。到了吃飯的時候，馬皇後就不沾一點兒酒肉。朱元璋問她怎麼了，她說：“妾為宋先生作福事也。”意思就是說我提前給宋濂祭奠，所以隻吃素，不吃酒肉。朱元璋聽了，心裏為之震動，“帝測然，投箸起。”
（《明史·太祖孝慈高皇後傳》）
飯也吃不下了。第二天就下令赦免了宋濂死罪，改為發配茂州。雖然宋濂因為年事已高，又經此難，死在發戍途中，但終究朱元璋沒有殺他。
馬皇後特別尊重老師，當時朱元璋請來教兒子們讀書的老師中最有名的叫李希顏。這位李老先生是私塾老師出身，平日裏教學生習慣用體罰。到了宮裏教皇子們，他也改不了老習慣。哪個皇子不好好學，照打不誤。有一回被朱元璋看見了，心裏很不爽。馬皇後立刻說：“先生這是替聖人教咱們家孩子，怎麼能為此發怒呢？”