跟所有達賴喇嘛的轉世靈童一樣，他從小就顯露出過人的智慧，超凡的才能。
天將降大任於斯人，為什麼要降大任呢？三百年前的西藏，到處暗湧浮動，各股勢力犬牙交錯，一片山雨欲來風滿樓的態勢。
曾聽過一首詩：
鐵甲將軍夜渡關，朝臣待漏五更寒。
山寺日高僧未起，看來名利不如閑。
說的是做官不如當和尚，當和尚多麼清閑自在啊。
羅桑嘉措在五歲的時候被以四世達賴轉世靈通的身份迎接到了哲蚌寺。五歲的小孩子不可能執掌權力機關，於是，他就一直跟著四世班禪羅桑卻吉堅讚學習。
等到羅桑嘉措長到八歲的時候，正式拜四世班禪羅桑卻吉堅讚為師，受沙彌戒，這是中國曆史上第一對互為師徒的達賴班禪。公元1627年，羅桑嘉措十歲，受比丘戒，正式成為活佛。
這樣，羅桑嘉措的人生道路算正式開始了，他在曆史上留下了濃墨重彩的一筆。
羅桑嘉措在哲蚌寺接受教育的這一段時期裏，藏巴汗政權和其他各派對格魯派持續進行攻擊。
1630年，藏巴政權利用地方勢力內訌之機對格魯派進行了一次嚴重打擊，甚至迫使年僅十三歲的羅桑嘉措離開拉薩去往西藏的山南地區避難。此後不久，蒙古喀爾喀部的卻圖汗、藏巴政權的巴汗和康衢的白利土司結成了聯盟，立誓一定要徹底消滅格魯派。在顛沛流離中，早慧的羅桑嘉措便意識到獨立的政治地位對於格魯派存亡的重要性。
公元1636年，羅桑嘉措長到了十九歲，當時的他，意氣風發，霸氣外露，顯得成熟而又幹練冷靜。而且剛好在這一年，他就任了哲蚌寺、色拉寺兩寺的住持。也正是從羅桑嘉措開始，曆代達賴喇嘛都將成為這兩座寺院的住持，並且這個職位除活佛之外別人均不能擔任。
羅桑嘉措一就任住持後，就進行了他大刀闊斧的改革，為了改變格魯派長期遭迫害的狀態，羅桑嘉措於1641年和他的師父四世班禪洛桑卻吉堅讚商議決定，利用藏巴汗政權同蒙古和碩特部之間的矛盾，派人去青海與和碩特部的首領顧始汗談判。以借和碩特部大軍的強大實力徹底推翻藏巴汗政權，從而開創出一個屬於格魯派的新政治局麵。
果然，當和碩特大軍一到，便迅即將三股反對格魯派的勢力消滅殆盡，並且幫助格魯派建立了以五世達賴喇嘛羅桑嘉措為首的甘丹頗章政權。並且，和碩特部與格魯派的信仰正式結盟。這一年是公元1642年。
羅桑嘉措在藏區開辟出了一番新天地，到處顯得生機勃勃。
而此時的中原已是戰火衝天，努爾哈赤靠祖上留下來的十三副鎧甲起兵創業，打出了一片大好天下，可惜他不幸早亡。
努爾哈赤死後，他的接班人是皇太極。這個人可不簡單。據說皇太極有一次打仗，剛好流鼻血，一般說來，流鼻血，不是個問題，拿張手紙塞著，也行了。但皇太極流鼻血，據說相當之詭異，流量大，還沒個停，連續流了好幾天，都沒辦法。可是軍情緊急，皇太極也不含糊，拿了個碗，就放在鼻子下麵，一邊騎馬一邊接著，連續兩天兩夜趕路，據說到達目的地時，接了幾十碗。
就是這樣的一個人，在甘丹頗章政權建立之前的1639年，藏曆第十一饒迥土兔年，稱帝建國，改國號為“大清”。
據《清實錄》記載，是年十月，皇太極派遣以察漢喇嘛為首的一批人去往西藏，帶信給當時掌管西藏地方政權的藏巴汗和“掌佛法大喇嘛”，說“朕不忍古來經典泯滅不傳，故特遣使延致高僧，宣揚佛教，利益眾生”。表明了慕名聘請之意，也明確地表達了清朝想在藏區之外發揚佛教的願望。這為後來羅桑嘉措的進京提供了十分良好的機會。
同時，和碩特部落見明朝式微，皇太極完完全全取而代之也是指日可待，便有意投靠清政府。於是，和碩特便聯係五世達賴和四世班禪暗自派遣使者去盛京，“自人跡不至之區，經仇敵治國，閱數年”，曆經艱險，方才於公元1642年十月抵達當時清朝之都盛京，也就是現今的遼寧省沈陽市。
當時，清太宗皇太極得到西藏使團要前來朝見的消息，親自率領眾臣前往懷遠門給西藏使團接風洗塵。並率眾拜天，行了三跪九叩的大禮。不但如此，皇太極還為了紀念這一次藏傳佛教使團的來訪，特地在盛京修建了第一座黃教寺廟“實勝寺”。使者們在盛京留至次年才回藏。此時，正值格魯派甘丹頗章政權建立，於是在使團臨行之前，皇太極還委托使者致書給羅桑嘉措，並贈予大量禮品。
“金剛達賴喇嘛。今承喇嘛有拯濟眾生之念，欲興扶佛法，遣使通書，朕心甚悅，茲特恭候安吉。凡所欲言，俱令察幹格隆、巴喇袞噶爾格隆、喇克巴格隆、諾木齊格隆、諾莫幹格隆、薩木譚格隆、袞格垂爾紮爾格隆等口悉。外附奉金碗一、銀盆二、銀茶桶二、瑪瑙杯 一、水晶杯二、玉杯六、玉壺一、鍍金甲二、玲瓏撒袋二、雕鞍二、金鑲玉帶一、鍍金銀帶一、玲瓏刀二、錦緞四，特以侑緘。”