臣下的奏折也都握在魏忠賢的手中，他看不懂，王體乾等人就念給他聽，然後按他的意思定奪。偶遇他外出不在，爪牙們也要快馬加鞭將奏折送至他麵前請“旨”，熹宗朱由校根本就沒有批閱的資格。而魏忠賢外出之時竟僭用皇上的儀仗，所過之處，文武百官都跪趴道路兩邊，齊聲高呼“九千歲”，魏忠賢卻連看他們一眼都懶得看。客氏外出時，場麵也頗為壯觀，儀仗之盛，甚至路過乾清宮時都不肯下轎步行。當時民間有童謠唱道：“委鬼當朝立，茄花遍地紅”，“委鬼”指魏忠賢，“茄花”指客氏，可見兩人氣焰囂張到了極點。
明熹宗朱由校皇帝天性懦弱，對魏忠賢的種種犯上行為視而不見，但熹宗的皇後張氏卻深感不安，她總是想方設法提醒皇上。一日她事先知道皇上要到自己這兒來，就故意將一本書打開放在桌子上。熹宗朱由校來後看見了就問是什麼書，皇後回答說是《趙高傳》。趙高是秦二世時指鹿為馬的太監，他對二世亡國負有不可推卸的責任。張皇後的用意十分明確，熹宗朱由校也有所感悟。但宮中到處都是魏忠賢的耳目，這件事馬上就傳到了魏忠賢的耳中，便決意報複張皇後。不久他知道張皇後懷孕了，就與客氏密謀，讓客氏派出心腹宮女，借服侍皇後之際令胎兒流掉了。此後魏忠賢怕張氏再吹枕邊風，就蓄意廢後。他先找來一個七十多歲的老狗腿子劉誌選彈劾皇後之父張國紀“怙惡不悛”，暗示皇後非親生；接著又唆使一個死囚孫二妄稱是皇後的親爹，想借張氏來曆不正好讓自己的侄女取而代之。熹宗朱由校糊塗一世，但與皇後感情深篤，因此在這件事情上堅決不聽魏忠賢的擺布。魏忠賢見廢後不成，遂起殺心，他派數名武士身懷利刃欲行刺皇後，又被守護在皇後身邊的熹宗朱由校發現。王體乾見狀趕忙勸魏忠賢說：皇上雖對朝政漠不關心，但同妻子兄弟的感情卻十分深厚。欲速則不達，萬一逼急了皇上，恐怕對我們不利嗬！”魏忠賢這才作罷，便下令殺掉了殺手滅口，保存自己勢力。
熹宗朱由校的裕妃張氏也是性情直爽的剛烈女子，她一直不願順從魏忠賢的擺布，魏忠賢就趁皇上與皇後廝守時將她幽禁在冷宮。裕妃此時也有了身孕，魏忠賢發現就停了她的飲食。裕妃饑渴難忍，在一個大雨天用盡力氣爬至屋椽下仰頭接飲順椽瓦流下的雨水，終於中毒慘死。熹宗朱由校絕後本來就是魏忠賢的陰謀。魏忠賢又讓客氏找來一大堆宮女，使她們與人野合而有娠，企圖等生下了男孩後冒充龍種，將來名正言順地襲承皇位。
正當萬事俱備，隻欠“龍種”的時候，魏忠賢的如意算盤雖然打的劈啪作響，卻有不測風雲，熹宗忽然病重，眼看是等不及“龍種”了。
熹宗獻花將要走完生命緊要關頭，忽然有幾天腦子比較清醒。他看自己絕了後，就有意將皇位傳給五弟信王朱由檢。
魏忠賢覺察到皇上朱由校的心意後；馬上對朱由檢心生疑忌，派廠衛特務天天對朱由檢跟蹤盯梢。朱由檢自料不是魏忠賢的對手，嚇得隻好在家裝病，甚至不敢到宮中探望哥哥的病情。
熹宗朱由校彌留之際，差人將朱由檢召至臥榻之側，傳以皇位，囑咐以善視中宮、善待忠賢，到死還不忘將魏忠賢與皇後同列！遺言一出，魏忠賢得意非凡，朱由檢卻不能自安，朱由檢趁亂趕快離開了皇宮，怕被魏忠賢所害喪生。
天啟七年(1627年)八月，二十三歲的熹宗朱由校去世。魏忠賢本來準備秘不發喪、有所圖謀，無奈人多嘴雜走漏了風聲，隻得宣皇後懿旨告知天下，並派黨羽塗文輔等人接信王入宮。
朱由檢進宮之前，已做了種種準備。他廣告朝野，讓大家知道他入宮的消息，同時在衣袖之中藏了許多食物。朱由檢進宮之後，處處小心謹慎，不敢吃一口禦廚中進上的東西，而以自帶食物充饑。由於信王入宮已不是秘密，魏忠賢一時不敢輕舉妄動，隻能將朱由檢扣押宮中，再想對策。朱由檢與外隔絕，夜夜孤燈獨坐。一天他見一個手持長劍的內侍在自己住所前轉悠，就試著將其召入，許以日後封賞。這內侍本是受命看守朱由檢的，一聽朱由檢許願，興奮之中忘了職責。恰好又有一群巡夜的太監從門口經過，朱由檢立刻把他們都叫進房內，問寒問暖，還派“看守”到禦廚取來酒肉款待。眾人十分感激，都表示願為信王賣命，於是朱由檢同宮外取得了聯係。朝中多數大臣雖迫於魏忠賢的淫威奉迎，但內心深處不希望一個太監常年騎在自己的頭上肆意妄為，更不希望魏忠賢有朝一日當上皇帝。他們得到朱由檢送出的情報後馬上行動，擁戴朱由檢做了皇帝。