蔡倫是被安帝的寵臣王聖、李間等借故定罪而死，當時被害者有鄧後家族及以“四知”故事傳名後世的楊震等。冤獄曾使朝野震懾，作為禦犯而死的蔡倫，其生平史績隻能在同情者之間留傳。三十年後桓帝命史官曹壽、延篤為他平反立傳，其經曆能載人《東觀漢記》及各家東漢史書。約300年後，南朝宋史學家範曄寫《後漢書》從各家史書取材時未必能準確被定次要的升遷任職時間。而且蔡倫曆經五朝皇帝，從人宮至身亡。
一部二十五史都是以帝王為正統，皇權為中心，帝王將相、官爵稱號、爭權奪利的記載，占去許多篇幅；曆史是人民創造的，仍有官僚貴族皇親國威者，或以文治武功，為民請命，為國禦敵，為政清廉；或以發展生產，促進科學，創作器物，良醫巧匠而傳。蔡倫即其中之一。在封建社會中，太監被認為刑餘之人，除了籍沒為奴者外，幾乎沒有官僚貴族的子孫會去當太監，《蔡倫傳》中出身不詳就說明他隻能是民間子弟。秦漢之世，二千石之官，三百戶之侯多不勝數，如無豐功，豈能立傳。《後漢書》中不乏有人封候就國後因生活下降而跑回京都的記載；蔡倫發明造紙，功大於定晚年仍能在封地傳授造紙，為人民所紀念，實為難能可貴。
曆史上第一個宦者封侯是鄭眾，因竇憲兄弟圖謀不軌，鄭眾首謀誅之。第二個宦者封侯是蔡倫，因發明造紙。和帝劉肇與鄧後還是遵照高帝約非有功不侯的原則。但從安帝開始則已濫封親信，使後漢共封宦者列侯達10人，後人與史筆留下不良的印象與記載，從而也影響了蔡倫的形象，對此不可不辨。據統計後漢共封各種列侯877人，宦老侯60人中可查到所封戶數者37人，平均為4630戶，高出300戶甚多，其中最少是封300戶者10人。清代萬斯同撰寫《東漢宦者候表》列出36人，(後漢書·宦者列傳》立傳9篇，其中都包括蔡倫。說明立傳的標準是功績而不在於高官，為蔡倫立傳功在造紙。
“永元七年九月癸卯，京都地震。儒說閣官無陽施，猶婦人也。是時和帝與中常待鄭眾謀奪竇氏權，德之，因任用之，及幸常侍蔡倫，二人始並用權。”居然把地震與和帝重用鄭眾、蔡倫聯係起來，未免荒誕。宦者和普通人一樣，同樣有良與勞、賢與不肖之分。《蔡倫傳》中讚揚他“倫有才學，盡心敦慎，數犯嚴顏，匡妞得失”，如實地寫出蔡倫為人正直，辦事認真，敦厚慎重，好學多才的性格，這也是曆史上許多發明家所共同具備的素質。有人認為蔡倫“每至休沐，輒閉門絕賓，暴體田野”是具有“群而不黨”的潛在品質。蔡倫作為宦官，卻是在世俗的偏見與儒家的歧視之沉重精神壓力下創造出發明造紙的功績。
蔡倫發明造紙剛剛成功，漢和帝劉肇就死了。28歲的鄧後登上了執政的地位，她遇到了部分文官儒者的陽奉陰違，遇到了部分官員的公開反對，蔡倫則成為鄧後的忠實支持者。司空周章與王尊、叔元茂等陰謀篡權，欲閉宮門，誅蔡倫，廢鄧後；政變未遂，司空周章自殺。以後又有何敞稱病不朝，杜根上書逼退鄧後，馬融為文諷諫，鄧後均毫不退讓。蔡倫也如實上奏何敞詐病。鄧後知書識禮，德才兼備，節約樸素，禮賢下士。她在位期中組織文人校訂經傳，編寫建武以來名臣傳。下令表彰奉公惠民的洛陽令王渙；接納樊籠之言，屢舉方正敦樸仁賢之士，悉以公田賦與貧人；接受張禹之言，將廣成、上林苑圍空地給貧民耕種。鄧後以曆史上外成權大受誅為鑒，準許其兄弟功成身退，返歸故裏。鄧後能排除朝臣對宦官的歧視，而封蔡倫為侯，器重蔡倫為人功績。
鄧後死後，安帝聽信讒言，殺害蔡倫與鄧後兄娃等多人。在《祭誌》中載：“安帝以讒害大臣，……及崩，無上宗之妻。”《五行誌》載：“安帝不能明察，信宮人及阿母聖等讒言，破壞鄧太後家-…”說明蔡倫之風屬於冤屈。“倫恥受辱，乃沐浴整衣冠，飲藥而死”，被後人評論為重氣節，有強烈自尊意識，寧死不肯受辱。蔡倫參與校汀經傳，必定了解《史記》、《漢書》中的曆史人物；秦二世時的馮去疾、馮劫獄以“將相不辱”而自殺，李廣恥對刀筆支而自到，以及周亞夫、王嘉、朱建、蓋克、肖望之等恥對獄吏，殺身自明。從而這位造紙發明家也如此死得從容而又壯烈，《後漢書·蔡倫傳》最後一段是褒重投貶；他留下的造紙術向四方傳播，後代對他這一功績的評價。
國家有關領導人與各界代表以曆史為根據，以科學為準繩，充分評價了蔡倫的功績，得到廣大群眾的讚同，海內外報刊紛紛作了報道。在確鑿的科學鑒定與雄辯的史實麵前，指責試問當年揚言“動播與推翻蔡倫造紙記載”的田野諸公尚有之說？
科學鑒定雄辨的史實我國古代四大發明唯一能載入正史的發明家傳記《後漢書·蔡倫傳》僅280字，對蔡倫首創植物纖維紙以及內因後果之敘述相當明確，使蔡倫發明造紙術之功在古今中外所公認，蔡倫為我國四大發明之一的造紙術作出了貢獻，是一位偉大的造紙術發明家。蔡倫的功績，得到了曆史鑒定，載入光輝的曆史史冊。