交易成本發生源自人性因素與交易環境因素交互影響下所產生的市場失靈（Williamson,1975）。Williamson指出交易成本的來源有：（1）有限理性（BoundedRationality）：指參與交易行為的人，因為身心、情緒等的限製，在追求效益最大化時所產生的約束；（2）投機主義（Opportunism）：指參與交易的各方，為尋求自我利益而采取的欺詐手法，同時增加彼此不信任與懷疑，因而導致交易過程監督成本的增加而降低經濟效率；（3）不確定性與複雜性（UncertaintyandComplexity）：由於環境因素中充滿不可預期性和各種變化，交易雙方均將未來的不確定性及複雜性納入契約中，使得交易過程增加不少訂定契約時的議價成本，並使交易困難度上升；（4）少數交易（SmallNumbers）：某些交易過程過於專屬性（Proprietary），或因為異質性（Idiosyncratic）信息與資源無法流通，使得交易對象減少，造成市場被少數人把持，使得市場運作失靈；（5）信息不對稱（InformationAsymmetric）：因為環境的不確定性和自利行為產生的機會主義，交易雙方往往握有不同程度的信息，使得市場的先行者（FirstMover）擁有較多的有利信息而獲益，並形成少數交易；（6）氛圍（Atmosphere）：指如果交易雙方互不信任，且又處於對立立場，無法營造一個令人滿意的交易關係，將使得交易過程過於重視形式，徒增不必要的交易困難及成本。而上述交易成本的發生原因，歸根到底還是源於交易本身的三項特征。這三項特征形成三個維度影響交易成本的高低。（1）交易商品或資產的特殊性（assetspecificity）：交易所投資的資產本身不具市場流通性，或者契約一旦終止，投資於資產上的成本難以回收或轉換使用用途。（2）交易不確定性（uncertainty）：指交易過程中各種風險的發生機率。由於人類有限理性的限製使得麵對未來的情況時，人們無法完全事先預測。加上交易過程買賣雙方常發生交易信息不對稱的情形下。交易雙方因此通過契約來保障自身的利益。因此，交易不確定性的升高會伴隨著監督成本、議價成本的提升，使交易成本增加。（3）交易的頻率（frequencyoftransaction）：交易的頻率越高，相對的管理成本與議價成本也升高。交易頻率的升高使得企業會將該交易的經濟活動內部化以節省企業的交易成本。
以交易成本理論來解釋組織整合，其主要觀點在於為達到總生產及交易成本的極小化，組織會按交易成本思路來選擇合適的關係治理機製，通過組織整合可降低交易所產生的不確定性，進而降低成本。另外，因交易中雙方皆無可避免會有主觀的機會主義行為，而交易成本的存在是為了降低有限理性的影響，即降低機會主義成本，當雙方進行有效整合後，由於較熟悉彼此的成本或內部信息，因此會減少彼此的投機行為，而利益也能有較妥善的分配(Williamson,1979;1985；Hennart,1988；Kogut,1988)。
2.3.2資源依賴理論
UlrichandBarney(1984)認為資源依賴理論(ResourceDependenceTheory)是探討組織與環境之間或組織與組織之間互動關係的理論。組織為獲得和發展競爭優勢，組織需要完全開發組織現有資源，在開發組織現有資源時，遭遇到無法滿足組織需求的情況，因此需通過獲取外部資源來滿足組織的需求。資源依賴的概念是由學者Pfeffer&Salancik(1978)提出，主要觀點如下：（1）環境中充滿許多資源，而組織為了生存就必須去爭取環境中的資源；（2）因為環境中有諸多限製，所以當組織在向環境爭取資源時，必然會有產生不確定性；（3）組織是否能夠存續，是要靠其是否具備效能；（4）環境並非一成不變，所以組織便需要時時去偵測，和對其生存能力質疑；（5）管理者的任務便是去發掘出對於組織有意義的改變。Bourantas(1989)則是在歸納了幾位學者看法後，對於依賴提出較為嚴謹的看法。認為組織間的互相依賴是建立在以下三項假設：（1）組織間的互相依賴，是因為對於彼此有其所需求的資源；（2）這項資源是從這兩個組織外所很難取得的；（3）其中一組織對於該資源有相當的控製權。在資源依賴理論中，特別強調組織和環境間的投入和產出關係，決定了其對於自主能力和環境的控製能力。而這樣的關係是可以改變的，也就是管理層可以重新塑造其對於環境的互賴關係。一般而言我們可以將組織間的互賴關係區分成兩大類(Pfeffer,1976)：（1）競爭性互賴：存在於地位相同、同一產業的公司間，彼此對於相同的稀少性資源互相競爭；（2）共生性互賴：存在於互不相似的組織間之相依關係，通常在垂直相關的公司間出現。因此，他們認為當產業集中度、科技密集度等環境因素發生變化時，組織的策略與策略型態也因為互賴的關係而產生改變。組織所采取的所有策略，最終都是為了管理這種和環境間的互賴關係，以確保資源的可獲得性，以增加企業本身在營運上策略性資產的形成。