特許加盟商已經投入了不少時間來培訓員工，所以特許加盟商必須確保他們忠實於自己，確保員工能夠發揮其潛能來為加盟店服務，為此特許加盟商就要有一定的激勵員工的措施。如今，光靠支付工資來激勵員工是不夠的，還要有其他措施。員工的工作日複一日都是一樣的，時間長了會感到厭倦，因此需要對他們進行交叉培訓，讓他們從事不同工作，使工作多樣化，否則，他們會因為厭倦而離開。另外，對他們進行交叉培訓也會使每個人對多個工作都能勝任，從而可以在某個工作空缺時，把他們中的某一位抽調過去。
特許加盟商激勵員工的最好方法是讓他們感到他們對加盟店的經營做出了貢獻，這裏麵有他們的心血。如果他們感覺沒有受到尊重，無論特許加盟商支付多少工資，他們都有可能離開。特許加盟商應該考慮到：給員工適當的權利了嗎？對業績好的員工是否給予了適當獎勵和表揚？是否將自己的觀點強加給員工？是否鼓勵老員工指導新的員工？是否鼓勵他們提意見？
如果特許加盟商讓員工的責任多樣化，員工會感到精力充沛。這是進行交叉培訓的一個重要原因。如果員工覺得能勝任工作而且很自信，他們會一直做下去。員工喜歡得到獎勵，如果獎勵能夠影響他們的生活方式，他們會更高興。特許加盟商可以使用的激勵方式有：對全勤、表現好的員工進行獎勵，增發獎金、組織出去旅遊等；把升遷和額外的休假時間與獲利能力聯係起來；把員工的成就刊登在公司的內部刊物上；如果員工工作滿一定時間，為他們設立一個與其工資所得相匹配的俱樂部；向員工提供加盟店的股權。
很明顯，即使特許加盟商付出最大努力，還是會有員工流失掉的。有的員工會因要成為家庭主婦而離開；有的是因為顧客抱怨或工作表現太差不得不離開。即使特許加盟商的員工都很好，流失率很低，也要保持一個很強大的招聘員工的計劃，說不定什麼時候就用得著了。