馮玉祥這話，綿裏藏針，把張作霖和段祺瑞從開始答應請孫中山進京的密約，不動聲色給講出，還悄悄刺了張作霖一下。張作霖臉都氣白了，可對馮玉祥的戲言又不好發作，隻得借故走掉。
段祺瑞勸不住張作霖，宴罷，又拉住馮玉祥，讓他以大局為重。實際上，馮玉祥和張作霖有一點是共同的，都想在這次戰爭中擴大地盤，然後插手中央，所以都想擁戴自己的人主政。馮玉祥讀過孫中山的三民主義，覺得同自己的觀點吻合，如果把孫中山擁進中央，對自己也是十分有力的。這一點，老謀深算的段祺瑞，已經猜到馮玉祥的心思。他找到馮玉祥，徹夜長談，把利害全擺了出來，迫使馮玉祥放棄自己的主張。
段祺瑞對馮玉祥說：“現在情況變了，張作霖羽翼豐滿了，他不在乎以前，你對他的違約，似乎有些不平，此一時也，彼一時也，想來雨亭對你也沒什麼，隻是他對孫中山有些不放心。如果奉軍再和國民軍打起來，那可是太慘了，山東的鄭士琦和山西的閻錫山，可從津浦、京漢夾擊國民軍，到時對你多有不利啊。煥章一向以為百姓謀利自居，切不要因小失大。”
段祺瑞這番話，對馮玉祥有些觸動。說起來，國民軍要是和奉係比較起來，還是薄弱的，聽段祺瑞的口氣也已經完全站在張作霖的立場上了。
為了自己的利益，馮玉祥也隻能裝聾作啞了。
段祺瑞趁熱打鐵，連夜拉著他去了張作霖在天津住所曹家花園。在段祺瑞的巧妙斡旋下，馮玉祥多次權衡，最終同意與張作霖、盧永祥聯名推段祺瑞為臨時執政。張作霖的目的還沒有達到，推段祺瑞為執政，不等於就能給他地盤，所以他仍是主張對吳佩孚用兵，徹底消滅直係的力量。段祺瑞有些不悅，他說：“我看雨亭還是適可而止，弄不好再把自己陷進兵禍裏去，想出都出不來。北方時局的穩定，對東南西南的統一才有促進的意義。”
段祺瑞這些話，對連年戰禍的中國人來說，無疑是悅耳的，張作霖雖然心懷不滿，但對這位北洋前輩，也不好發作。
張作霖說：“我不是要地盤，我隻是想為盧帥出口氣，反正我願意將奉軍一部分人歸盧帥調遣，尋機南下討伐齊燮元，以報上海之仇。將來讓盧永祥繼任江蘇督理，吳光新任安徽督理。”
這些話，雖然把張作霖圖霸江南的野心揭出來，可他推薦的都是皖係的人，而吳光新還是段祺瑞的妻舅，段祺瑞會舒服。為了緩和張作霖和馮玉祥的爭奪，段祺瑞在分配地盤上，絞盡腦汁，最後決定，自津浦路沿線一帶至長江下遊地區，為張作霖的範圍，任命李景林為直隸督辦、張宗昌為蘇、皖、魯剿匪總司令；而以京綏線及京漢線為馮玉祥範圍，任命孫嶽為豫、陝、甘三省剿匪總司令，胡景翼為河南督辦，張之江為察哈爾都統，李鳴鍾為綏遠都統，並特任馮玉祥為西北屯墾督辦。
馮玉祥對這個決議，讚否參半，他不願奉軍的勢力伸入到東南的富有地區，在這個決議前，馮玉祥就讓北京的內閣免去吳佩孚的兩個心腹張福來和李濟臣，他也要為自己的兩個同盟者孫嶽和胡景翼找到合適的地盤，曾委派胡景翼為河南軍務督辦，孫嶽為河南省長，也就是說沒有這個決定，馮玉祥也要往京漢路南端發展的。
得到段祺瑞的首肯，張作霖為確保自己在長江下遊的勢力，派張宗昌和盧永祥南下。張宗昌率四個旅，繼續攻打江蘇的齊燮元。由於齊燮元部隊人心渙散，沒經過多大戰事，奉軍就攻入了上海。這時，長江流域的直係，感到事情緊迫，蘇、浙、皖、閩、鄂、贛、豫開始對峙奉軍和國民軍，七省以聯防的姿態反對北方勢力南伸。為了求得局勢的和緩，七省的主要人物在南京開會，決定由齊燮元、蕭耀南、孫傳芳聯名發出通電請段祺瑞出山，組織北京臨時政府。
可謂局勢多變，撲朔迷離，軍閥諸侯各懷心計，拿國事遊戲。
段祺瑞欣然接受了“中華民國臨時執政”的職務，並公布《中華民國臨時政府製》六條，組成新政府，內容如下：
第一條，中華民國臨時政府以臨時執政總攬軍民政務，統率海陸軍；
第二條，臨時執政對於外國，為中華民國之代表；
第三條，臨時政府設置國務員讚襄臨時執政處理國務。臨時政府之命令及關於國務之文書由國務員副署；
第四條，臨時執政命國務員分長外交、內務、財政、陸軍、海軍、司法、教育、農商、交通各部；
第五條，臨時執政召集國務員開國務會議；
第六條，本製自公布之日施行，俟正式政府成立，即行廢止。
顯而易見，這個臨時執政，對段祺瑞來說，實在是太實惠了，一個非正規化的機構比較容易取得各方麵一致意見。段祺瑞力求國家統一，隻是想得到些進步勢力的同情，最終目的，還是想把奉係抓過來，因條件還不成熟，隻能謹慎行事。段祺瑞現在還打著另一算盤，那就是他不太相信直係能徹底敗北，在七省聯名擁他執政的同時，也有人提出“段吳合作”的建議。段祺瑞正式執政前幾天，孫傳芳在給他的電文中說：“吳子玉大帥智勇兼備，確為國家棟梁之才，允宜優加護持，為國愛惜。”段祺瑞心領神會，說服了張作霖和馮玉祥，對吳佩孚不予通緝，準其和平下野。
段祺瑞這番心機，明眼人自能看出來。而且，他回北京後，第一道命令就是把廢帝溥儀門前的衛兵給撤了，為其跑進日本使館開了綠燈。段祺瑞對吳佩孚還是網開一麵的，齊燮元、蕭耀南、孫傳芳南京會議前，段祺瑞還有心拉吳一把，倒是吳佩孚自己不甘心，惹出事來，弄得齊、蕭、孫也對吳佩孚不滿。
馮玉祥曾命令，凡活拿吳佩孚者，賞十萬元，拎吳之人頭者，賞金減半。吳佩孚怎麼不膽顫心驚，落荒而逃呐。吳佩孚在塘沽登華甲艦，浮海南下，在大沽口停留，沒聽到什麼好消息，而山東督理鄭士琦宣布中立，拒絕吳佩孚登岸。吳佩孚又跑到青島，守軍溫樹德派人送來食物，仍不許登陸，此時，他想返洛陽重新起兵的計劃成為泡影。吳佩孚在海上真是度日如年，但這總比讓人把腦袋給割下來要好些，想當初，那吳子玉八麵威風，再回想，第一次直奉交惡中，又是何等氣魄，現在卻是四麵楚歌，眾叛親離，在海上遊蕩，成了孤魂野鬼。吳佩孚心中惆然，自憐自愛之時，蕭耀南派決川艦來接他，於是，他從吳淞口改乘該艦駛入揚子江，直奔南京，以為這是蒼天有眼，得到神助，沒想到蕭耀南早已經同意擁段，所以如此，多是同情，不想置他於死地，全無同他起兵之意。
吳佩孚在南京遇到齊燮元，拿出在艦上起草好的“護憲軍政府組織大綱”，讓齊燮元簽字，並要求大家聯名發出，當得知齊燮元要擁段時，甚是不滿說：“你們各省同盟，一致對外，我十分讚成，但是要聯名擁段祺瑞，這不是把直係給徹底埋葬了?采取軍事行動，是自救的唯一出路。”