現在新疆的主管是潘效蘇巡撫，此人是湖南湘陰人，早年投軍，在左宗棠手下多有軍功。光緒十五年（1889）饒應祺即在新疆任布政使。光緒二十八年（1902）10月6日，饒應祺調安徽巡撫，新疆布政使潘效蘇升新疆巡撫。
潘效蘇，字重賢，湖南湘鄉人。鹹豐十一年(1861年），23歲的潘效蘇投效軍營。同治二年(1863）八月，潘效蘇因參加了清軍收複杭州等城池的戰鬥，作戰勇敢，經左宗棠保奏以縣丞留於浙江。此後，潘效蘇跟隨部隊支援福建的剿匪作戰，陸續收複了漳州的各府廳州縣城池，福建全省的剿匪結束以後，部隊犒賞三軍，經左宗棠保奏，潘效蘇免補本班，以通判改留福建，優先補用。但不久，潘效蘇所在部隊又轉戰廣東，先後收複了廣東鎮平等城市，再次經左宗棠保奏奉旨賞加同知銜。同治七年(1868年），潘效蘇隨西征軍赴直隸地區圍剿撚軍起義，戰功卓著，又經左宗棠保奏，以同知銜改留陝西補用。同治八年(1869年）五月，潘效蘇署理膚施(今延安市)澄縣等縣的知縣。
此後，潘效蘇的母親去世，其回鄉丁憂一年，喪期服滿後，他趕赴甘肅，管理恪靖中營，兼帶左路、左後等營。同治十年(1871年），潘效蘇調署狄道州(今甘肅臨洮縣）知州。同治十一年(1872年）其調河州知州。光緒四年(1878年），奏保以知府用。不久，又再任河州知州，並轉任循化廳(今青海循化撒拉族自治縣）同知。
在從軍的十七年間，潘效蘇從一個23歲的俊秀青年，官階一步步提升，後升為知府同知。他的才幹得到了上級官員的認可與褒獎。
光緒九年(1883年）十月，潘效蘇奉劉錦棠調遣，趕赴新疆，旋調補迪化直隸州知州。光緒十年(1884年）三月，其接印視事。光緒十二年(1886年），潘效蘇交卸迪化州事，調署和闐直隸州知州。光緒十四年(1888年）八月，調署伊犁府知府。光緒十五年(1889年）三月，護理新疆巡撫魏光燾奏補迪化府知府，由於修理城池有功，經魏光燾保奏加鹽運使銜。光緒二十年(1894年）三月，回赴迪化本任。
光緒二十一年(1895年）十一月，經前陝甘總督陶模奏請，開去潘效蘇迪化知府一職，以道員身份歸甘肅新疆補用。此後，又因會剿西寧北大通回民起義有功，朝廷賞加其西林巴圖魯名號。光緒二十二年(1896年）十月，潘效蘇奉旨補授新疆鎮迪道尹，兼按察使銜。光緒二十四年(1898年）十月，潘效蘇署理新疆布政使。光緒二十五年(1899年）三月，回任，九月再次署理新疆布政使。光緒二十五年(1899年）五月，綏來回民起義，新疆巡撫饒應祺飭迪化城守協副將查春華等嚴戒城防，會同迪化縣知事劉兆送等設法緝拿，並委鎮迪潘效蘇等總理省團練，選募天津商民丁壯500名，編成營隊，協助城防。
光緒二十六年(1900年）五月，回任，旋經陝甘總督魏光燾奏調，赴甘差遣，委署甘肅布政使，光緒二十七年(1901年）正月，奉旨補授甘肅按察使。光緒二十八年(1902年）九月五日，朝廷鑒於其久任邊缺，熟悉民情，升任新疆巡撫。“清實錄”也載：“任道鎔因病解職，調安徽巡撫聶緝椝為浙江巡撫，甘肅新疆饒應祺為安徽巡撫，以甘肅新疆布政使潘效蘇為甘肅新疆巡撫。”
從1883年潘效蘇被劉錦棠調來新疆，勤勤懇懇多年，政績顯著。千辛萬苦熬到了巡撫的職位，這已經到了他人生的頂峰。擔任巡撫以後，更是對理順新疆軍政事務貢獻很大。
新疆建省後，由於幅員遼闊、地廣人稀，按照“因陋就簡”的原則，清政府在新疆南北兩路分別設置了鎮迪、阿克蘇道、喀什噶爾和伊塔道四道。但運行多年以後，原來設置的府、州、縣過寬、過大的弊端便顯現出來。建省18年後，到光緒二十八年(1902年）饒應祺主政新疆時，由於人民生活安定，人口日漸增多，邊境平定，很多回民紛紛來新疆屯墾、做工，經商。隨著人口的增加，各種政務也日漸增多，一些地方的建置越來越不適應社會發展的需要。