1991年～1995年，國家兩次減征縣及縣以下農村圖書銷售的營業稅和增值稅。寧夏稅務部門又對銀川、石嘴山市店的教材稅金減半征收。寧夏有10個縣（固原、海原、西吉、隆德、涇源、彭陽、同心、吳忠、靈武、鹽池）屬民族貿易地區，寧夏稅務局先後免征了這些縣店的企業所得稅。據統計，僅寧夏兩項計減免稅金300萬元，全部用於網點建設，使全區新華書店縣及縣以下發行網點得到較快改造和新建。
四、商品管理
寧夏新華書店從建店起，就建立了圖書進、銷、調、存管理製度。進貨要記入卡片（包括書名、版別、著譯者、定價、數量）。銷貨按發票書名逐種軋銷，填入登記卡。庫存圖書每月盤點一次。1954年，根據總店規定，圖書一律用《發行記錄卡》管理，一書一卡，從訂貨開始進行登記。在圖書流轉過程中，有銷售、調撥、缺損紀錄，以卡盤點計算。這一管理形式有利於分析各類圖書的發行情況，獲取進銷動態與市場需求信息。但隨著圖書品種的不斷增加，數以萬計的圖書逐種、定期進行進、銷、存統計，費工費時，後停止施行。1957年，各店執行總店下發的《新華書店商品管理責任製試行辦法》和《商品管理責任製示範細則》，商品管理有了較為全麵的規範要求。1963年，自治區書店針對“大躍進”以來出現的商品管理混亂、損耗嚴重、賬實不符等問題，製定了《商品收發保管辦法》，對部門管理職責、工序管理責任、檢查考核評比等作了較為詳盡的規定，有效地扭轉了當時商品管理混亂的狀況。
《商品收發保管辦法》執行到1993年，其中部分章節在執行中曾做修改和補充。主要內容有：
（一）盤虧率
1980年修改為門市開架4‰、閉架2‰，批發1‰，流動供應1%，庫房分發0．5‰。
（二）盤虧處理
1980年修改為盤虧損失報銷50%，個人賠償50%。後因部分店報銷有漏洞，1986年又改為全額賠償。
（三）盤點方法
為了更好地執行圖書提成差價製度，自1980年起，庫存圖書一律按出版時間分年盤點、分期計算提成差價，出版一年期圖書按定價計提10%差價，出版2年期圖書提20%，出版3年期圖書提30%，出版4年期圖書提40%，出版5年期以上圖書提50%。庫存圖書每年至少盤點一次，結合年終決算進行。
1995年，自治區書店重新製定了《商品管理責任製實施細則》，《實施細則》對下列問題作出規定：
一是庫房收拆包件，必須2人以上共同完成。在途損失須2人共同出具證明。
二是盤虧從嚴控製。上限為：開架售書7‰，閉架售書4‰，批發2‰，流動供應1%。各店可根據實際情況向下浮動。
圖書停售報廢處理，是商品管理中的重要工作。一些有政治性錯誤的圖書，必須停止發行，以免造成不良政治影響。這類書一般由出版社或省級出版行政管理部門明文通知，存書封存並作紙漿處理（不能當廢紙出售）。圖書停售須及時登記造冊，一書一清。
滯銷書處理分定期和重點兩種，定期處理一般指在企業承受能力允許的情況下，逐年進行，先作降價促銷，促銷不完再報廢作廢紙出售。重點處理一般由上級主管部門統一部署，帶有全局性。全區新華書店重點處理圖書有以下幾次：
1952年，在全國新華書店開展推銷活動中，寧夏共處理各類圖書8．3萬冊，報損1．31萬元，資金由西北總分店核銷。
1962年，中央清倉核資領導小組批轉文化部報告，對各級新華書店庫存圖書進行清理。寧夏共報損35．15萬元，資金由地方財政核銷。
1980年，國家出版局通知，“文化大革命”中涉及劉少奇的圖書作報廢處理。寧夏經清理報損19．7萬元，資金由國家出版局撥付。
1980年，根據中央宣傳部批轉國家出版局黨組《關於解決馬列著作、毛主席著作積壓問題的請示報告》，寧夏報損61萬元，資金由全區新華書店在3年的超計劃利潤中抵扣。
1988年，因圖書提價導致全國性圖書積壓。寧夏壓庫圖書達400餘萬元，自治區書店向稅務機關申請免征營業稅一年約53萬元，安排全區新華書店降價處理存書。
五、職工人數
1949年10月，新華書店寧夏省分店初建時，有職工8人，其中軍管會派遣3人，接收原教育用品供應站3人，新招收2人。
1950年6月，西北總分店委派王維藩任省分店經理，並增員4人隨同來寧，後又陸續分配13人。1951年，省委組織部從寧夏幹校分給5人，由省級機關調配和新招收10人。1952年年底，省店及中衛、黃渠橋、吳忠支店共有職工57人。
1958年，寧夏回族自治區新華書店成立。自治區文教廳給區店分配高中畢業生7人，從上海支寧人員中選調10人，新華書店總店支援業務、財務幹部5人。為了充實基層書店，1963年區店從社會招收5人，1965年文教廳分配河南應屆高中畢業生28人。
1958年～1968年期間，全區書店有職工200人左右。
1974年11月，恢複自治區書店建製，一些調離書店的人員陸續返回。年底，全區書店人員達280人。
1975年～1995年，特別是黨的十一屆三中全會以後，根據全區圖書銷售和發行網點逐年增加的需要，書店人員每年約增加15人。
據統計，截至2004年年底，全區新華書店共有職工645人，其中在崗職工590人，內退55人。
（一）職工結構
根據2004年職工資料統計，全區新華書店在崗人員共590，其中：男230人，女360人。
1949年10月，寧夏省店建立後，省店幹部的調配、管理由省委宣傳部負責。1949年12月開始建立市、縣支店，支店幹部的調配、管理由省店負責。
1951年，全國新華書店實行統一管理。省店的人員編製及幹部調配，由西北總分店負責；市、縣支店的人事管理由省店負責，思想教育和組織工作由市、縣黨政有關部門與省店共同管理。
1954年寧夏省建製撤銷，寧夏省店並入甘肅省店，原寧夏省所轄各市、縣支店人事由甘肅省店管理。
1955年11月，根據國務院批準的文化部《關於文化行政部門所屬文化企業領導關係的規定》，新華書店各省分店及所屬市、縣支店的購銷業務、幹部人事等，均交由地方文化行政機關領導和管理。
1958年，寧夏回族自治區成立後，自治區書店歸文教廳領導，各市、縣店除進銷業務和財務核算由區店統一管理外，其餘均由各市、縣文教科（局）或宣傳部領導。
1962年9月18日，文化部發出《關於調整新華書店省以下各級機構管理體製的通知》，決定“將原已下放的專縣書店，改為由省店和專縣文化部門雙重領導”。據此，寧夏回族自治區人民委員會批轉了自治區文教廳《關於調整新華書店各級機構管理體製的報告》，決定“各專、市、縣新華書店一律收回，均為區屬文化企業，由區書店和各市、縣文教科（局）雙重領導，以區書店為主。幹部的調配任免由文教廳統一管理。財務由區書店統一核算。自1963年1月起，取消現行的××市、縣新華書店的名義，改為‘寧夏回族自治區新華書店××縣（專區、市）支店’”。從此，區店即負責全區各市、縣支店的人員編製、幹部培訓、網點建設，並協助文教廳和各市、縣文教科（局）進行思想教育工作。
1968年1月，自治區革命委員會以［1968］28號文批轉了自治區新華書店《關於各市、縣新華書店管理權力下交問題的請示報告》。自1969年1月1日起，市、縣新華書店的人、財、物三權交市、縣革委會，區店機構撤銷並入自治區毛主席著作出版辦公室。
1975年，自治區書店恢複建製，隸屬自治區出版局，隨後各市、縣書店亦相繼恢複。
1991年12月，自治區體改委、勞動人事廳、新聞出版局聯合下發《關於調整我區新華書店管理體製的決定》規定：“今後各市、縣書店人員管理，由自治區新華書店同當地有關部門共同協商，以自治區新華書店管理為主。自治區新華書店負責各市、縣書店人員編製和工資計劃，任免基層書店正、副經理，辦理一般人員調動。地方主管部門負責各市、縣書店黨的工作，向自治區新華書店推薦、交流幹部。基層書店黨支部書記、副書記的任免，由自治區新華書店會同當地主管部門協商確定。”根據上述決定，全區除銀川市店外，其他各市、縣書店從1992年1月起實行人、財、物統一由自治區書店管理的體製。
（二）職工教育
1951年，新華書店西北區管理委員會第二次會議討論、通過了《新華書店西北區各級店學習製度》。1953年3月，寧夏省分店黨委會製定了《分店在職幹部學習計劃大綱》。
1982年，總店召開全國新華書店培訓工作會議後，全區書店業務培訓工作逐步走向正軌。當年，根據總店“培訓規劃”的要求，結合寧夏實際情況，自治區書店製定了《全區新華書店職工培訓規劃》；同時，成立調查研究科，負責全區書店職工的業務培訓工作。1990年5月，總店召開全國新華書店第三次教育工作會議，貫徹落實新聞出版總署《全國新聞出版係統幹部工人教育培訓規劃（1990年～1991年）》。根據會議要求，全區書店成立了由區店及地級市所在地書店經理共7人組成的職工教育領導小組，並召開了全區書店第一次教育工作會議，討論製訂了《全區新華書店職工教育培訓規劃（1990年～1991年）》。
1．專業技能教育。
（1）崗位培訓。這是在職職工進行業務技能教育最普遍、最基本的形式。20世紀50年代，新華書店對調入或新吸收人員，均有一定的考試程序，亦需經過崗位培訓，並實行嚴格的考核製度。崗位培訓的內容包括：政治理論時事政策，圖書發行方針和新華書店的性質、任務，發行業務知識和操作技能等。寧夏省分店成立後，對調入人員都進行崗位培訓和業務實踐。自治區書店成立後，招收了一批學生和社會青年，均經崗位培訓後再分配到各縣店。1965年，文教廳分配給書店28名河南應屆高中畢業生，區店舉辦了2期曆時3個月的培訓班，係統講授了發行工作方針政策、新華書店店史及業務、財會知識。
1981年後，全區新華書店開展了兩次崗位練兵，組織業務知識和財會知識競賽，編寫輔導材料，統一命題考試，參賽人員405人。
（2）舉辦或參加專業培訓班。1952年～1954年，寧夏分店先後派送20餘人參加西北總分店發行學校專業培訓班，學習發行業務和財會知識。
寧夏省建製撤銷後，一些市、縣店繼續派員參加西北總分店舉辦的“發行記錄卡研究班”和甘肅省店舉辦的財務學習班。同時，由甘肅省店選派人員到文化部幹部管理學院學習。
1980年～1995年，自治區書店有計劃、有步驟地舉辦縣（市）店經理、財會人員、進貨人員、門市部主任、營業員及庫管人員等各類培訓班15期，培訓609人次。全區書店還派員參加總店、文化幹部管理學院及外省區書店舉辦的業務培訓11期，受訓27人次。其中：參加北三區經理培訓班4期14人；西北五省區儲運培訓班1期5人；農村發行讀書班1期2人；圖書發行進修班5期6人。
（3）選送到大專、技工學校培訓。根據中共中央、國務院《關於加強出版工作的決定》和新華書店總店的培訓規劃，全區書店共選送53人參加2年期圖書發行大專班學習。其中：武漢大學圖書發行專修科7人，大專函授班3人，專業證書班1人；文化幹部管理學院圖書發行專業7人；山西財經學院圖書發行專業證書學習班6人。
2．政治理論學習。
全區書店堅持每周二、周五學習製度，按照各級黨委的部署，係統學習政治理論和時事政策。1984年，區店組織職工130人參加幹部政治理論正規化教育，學習了《馬克思主義哲學綱要》《政治經濟學》《社會主義初級階段理論和黨的基本路線》等課程，取得了單科結業證書。
截至2004年，全區新華書店職工共撰寫論文148篇，內容包括圖書進銷業務、特色經營、門市部發行、農村供應、服務品位、市場挑戰、體製改革等方麵。其中有5篇被入選全國出版科學學術討論會，《淺談圖書進貨業務的全期管理》《構築出版與發行間的信息橋和供需道》獲全國出版科學研究優秀論文獎，另有14篇被中國圖書發行業協會和“三北”地區發行業協會評為優秀、良好論文，25篇被《書刊音像發行》期刊選登。