鄭成功以熱堡在一鯤身北端，北隔大港口以控製北汕尾島；南接淺水有大小沙堆七座，以與本島之喜樹半島相連；東瀕汪洋浩瀚之台江；西臨風濤洶湧之外海，地勢既踞險製高，堡之四角又裝有巨炮可資嚴守。必於東南北三麵夾擊之，更逼近以困之，方可克之。於是即於四月初七日乘潮水低退時下令水陸聯合夾攻。
初七日拂曉，各軍同時攻擊，甲板船及戰艦首遭攻擊，荷蘭戰艦欲戰無力，欲逃不得，對戰不久，即焚者沉者各一艘，其餘艦上軍官兵幸得堡上炮火掩護，乘劃遁入堡中。其不及逃者，非死於銃火，即為北汕尾船隊所擄。荷蘭在台之船艦至此悉為鄭軍所得。
成功之陸軍自七鯤身北擊六鯤身。荷蘭守軍不敵，逐島北還至一鯤身，藉熱堡炮火掩護，向鄭軍逆襲，鄭軍將士冒炮火突擊，與荷蘭兵肉搏，荷蘭兵不敵，棄甲曳兵逃奔堡內，鄭軍追至堡下，乃於各要隘立寨堆土建壘，環柵挖壕以困之。一日之間，各島嶼皆入鄭軍之手，僅餘熱堡未下。
鄭成功既圍困該堡，以庶政急在撫民，乃遣人四出慰問華人及各土番。另方麵命諸軍在一鯤身築土圍長堤，以圍熱堡。四月二十四日（陽曆五月二十三日）土垣圍成，分裝巨炮二十八門，一齊開炮向熱堡轟擊，更以四千官兵掘壕近迫堡下，因熱堡堅，火力雖熾盛，一時不能下，乃繼續圍困之。
十月初，荷軍以兩巨艦夾小艇數隻，自熱堡北爭奪北汕尾島，用炮火掩護步兵二百餘登陸。鄭軍水陸夾擊之，大破其人員及船隻。荷蘭人遭此慘敗，便采取消極防禦，於堡周海岸構植木柵以防鄭軍。
5.台灣荷蘭人投降。
荷蘭台灣太守揆一坐守孤堡，彈盡援絕，堡內人人具有降意。有將軍馬篤爾德，不忍僑民遭受苦難，乃率之越城垣詣鄭軍降，備述堡中實況，請速攻之，以解倒懸。鄭成功乃令宣毅前鎮陳宣、右虎衛左協陳衝，以小船數十隻，內裝磺藥及引火諸物，以推進焚燒敵夾板船。命黃信督水師攻熱堡之東；劉國軒督陸軍攻熱堡之南，水陸各架巨炮二十尊以轟擊堡垣之一點。於正月二十五日拂曉開始攻擊，須臾堡垣破裂，碉堡亦壞，鄭軍乘勢進攻，荷軍抵擋不住，遂衝人堡中。荷蘭人欲逃奔艦上，見各艦船已為鄭軍所燒，不得已乃聚守堡之西北角頑抗。
鄭成功見荷蘭人窘勢，乃遣通事李仲往諭之曰：“此地非爾荷蘭人所有，乃前太師（指鄭芝龍）練兵之所。今藩主前來，是複其故土。此處離爾國家極遙遠，爾等安能久乎？藩主動柔遠之念，不忍加害，開爾一麵。凡倉庫不許動擅，其餘爾等珍寶珠銀等私積，悉聽載歸。如執迷不悟，明日環山海悉用油薪硫磺積壘齊攻，船破城毀人盡，悔之莫及矣。”
荷蘭官兵自知不敵，遂請停戰五日，至期出降，成功許之。荷蘭人遂降服而退出台灣。
（四）戰略評論
1.鄭成功東征戰略。
鄭成功自進攻南京失敗後，以金門、廈門地狹逼處，不足以為反清複明基地，乃策定東征台灣，開辟新基地，其眼光遠大，目標正確，堪稱雄略獨到。如果天假之年，當可收複呂宋，混一南洋，以海上勢力與滿清長期周旋。
台灣本為中國故土，明中葉後為防海盜，始遷台民而墟其地，視為荒島而棄之。鄭芝龍等自日本逃來，遂據台灣以組織其水師。後受明室招撫，為明守禦海疆，防製荷蘭人、西班牙人侵寇，為閩浙沿海的唯一海防軍。荷蘭人乘明清作戰之際，進占台灣視之為殖民地。鄭成功如於北伐中取得南京，當以全力恢複明朝，亦將無暇於收複台灣失地。明朝失地，鄭成功為明朝恢複之，以用為複明基地，其在台灣之明朝子民，向祖國報告紅毛賊掠台灣及淩辱危害中國人實況，乃理所當然事。故鄭成功之力排眾議，主持東征，在戰略上見先機，亦因係完全中國人對外寇作戰有其必勝信念也，非比其與清作戰，漢奸遍地，多存改朝換代的傳統觀念。
鄭成功對台灣實行海禁，為其東征之先聲。以現代語言之，可謂之日經濟封鎖戰。在台荷人所圖者為海上貿易。今以海禁扼絕海上交通，使台灣生產物資不能運出，所需物資不能運入，則台灣成為死地。使在台荷人不得不遞國書，貢方物，求開海禁，是成功政略的第一步成功。何斌鑒於郭懷一武力對抗荷人的失敗，乃竭力運用鄭成功恢複台灣，救民自救，是其用智強於用力處。彼知鄭軍所缺者惟錢與糧，特以台灣多錢多糧為詞，以引動鄭軍必來東征。然後更為之準備進軍道路及軍用地誌，俾能順利得手，是台灣的光複，多出於何斌善為運用之力。成功覽其圖而有：東方扶餘”的興趣；諸將見其模型而能進退出入如指掌，此作戰的必勝準備。荷蘭人聞怒潮而疑為千軍萬馬；見炮壘陰暗，而不禁呻吟歎息，眾情疑懼，此作戰的必敗現象。終於民間謠言四起，迫使荷蘭太守向巴達維亞無故請援。及援軍既到，久無作戰跡象，又遣使至鄭軍探其虛實，情怯多疑，徘徊不定，致令援軍撤走，束手無策，此必敗之象。皆是孫子所謂：“兵者詭道也，故能示之不能，用示之不用，近而示之遠，遠而示之近，利而誘之，亂而取之，實而備之，強而避之，怒而撓之，卑而驕之，佚而勞之，親而離之，攻其無備，出其不意。”因此，鄭軍東至澎湖，即能迎風而東直抵鹿耳門外，待潮升至丈，得以從容進入台江，一戰而破其海軍艦隊，再戰而攻取普羅文查城，遂即進圍其基地熱蘭遮堡，取得台灣全部地麵。