田兆雄等調查54所省市級醫院關於前列腺術後資料，認為開放性手術半年以上性功能紊亂者17例，占總隨訪數的19．8％；而經尿道電切前列腺術引起性功能紊亂41例，占44．1％，其中陽萎及性功能減退為2．4％。
孟薈報道115例經會陰前列腺切除術後，有42．8％的病人陰莖勃起消失，因此，對年紀較輕或尚有性要求的病人不宜選此種手術方式。經會陰切除前列腺後發生性功能障礙的原因尚不清楚。據推測，也許是控製勃起的神經受損傷，會陰部切口可損傷支持陰莖海綿體的盆底組織，因此，在經會陰前列腺切除術後常常發生生殖器供血不足而引起勃起功能障礙。
在美國，這種手術方式可使40％～50％的病人勃起功能障礙。如果是前列腺癌做了根治手術，發生勃起困難的概率可達98％。
有一部分病例手術後雖保存勃起功能，但不能經尿道射精。單純前列腺切除後，30％～90％的病人會有逆向射精的情形，這讓很多男人沮喪，但不會造成身體傷害。射出的精液由前列腺窩反流入膀胱，因此，患者有射精感覺，但無精液自尿道流出，因為精液主要來源於前列腺及精囊已被切除，當性交時由尿道流出少量的尿道腺體分泌物。
極少數病人主訴術後性功能有改善，其實這是病人全身狀況改善後的主觀感覺，與前列腺手術本身無直接關係。
精神因素亦能影響術後性功能，如一些病人對結紮輸精管有顧慮，而術中結紮了輸精管，術後有可能造成性功能障礙，此點無生理病理依據，故與精神有關。此類病人不應該結紮輸精管。
前列腺切除術後尚保持勃起功能者，仍可享用性生活，但也有人在性高潮期出現不自主性溢尿。
康納斯德大夫說：她曾對136例前列腺手術後病人做了隨訪，得到回答78例。大多數病人術前每周至少性交1次，而術後僅28％有勃起功能，僅個別病人的性伴侶對此表示滿意。8例訴說在性高潮時有不自主性溢尿，還伴有應激性尿失禁。
從病理生理學考慮，此種溢尿本應出現於所有術後仍有勃起功能者，因為正常射精時膀胱頸關閉，外括約肌鬆弛；前列腺手術後膀胱頸消失，故外括約肌放鬆時必然有尿溢出。對此，有人認為，若仔細詢問病人，可能每例均存在此種情況。但這個問題長期以來並未引起醫生和病人重視。
相比之下，恥骨上經膀胱切除前列腺發生性功能障礙概率較低。前列腺手術後如發生性功能障礙，應以精神鼓勵為主，有的病人在短期內能恢複性交能力。應用藥物改善精神症狀，慎重用雄激素。
逆行射精者可口服麻黃堿（麻黃素），使症狀得到改善。不射精的原因可能是精阜及輸精管的損害或炎性閉鎖所致。國外報道，經尿道電切除治療前列腺增生術後，性功能紊亂為16％～54．5％。其發病率隨年齡增長而增加。
有人報道，行前列腺手術前得到詳細解釋的病人，在手術後發生勃起困難者較少，而未得到這類谘詢的病人60％以上有性功能困擾。