學校自籌經費，包括教學、科研、對外服務、對外投資以及從社會各界獲取的各類讚助與獎學金等款項。學校自籌經費占總收入比例指標反映高校除財政撥款外，多方籌集教育資金，拓寬收入來源自我發展的能力。
2）財務運行績效指標。運行績效就是根據投入與產出的社會經濟效益原理，對高校財務運行效能、效率、效益等多種產出形式進行綜合評價。運用績效分析指標，科學地評價高校教育資源的使用狀況和收益狀況，準確地衡量資本的投入與產出，以便正確、合理地評價教育資源配置的效率情況，為高校調整和配置辦學資源提供參考，提高資源的使用效率和管理水平。
根據高校的現實情況，運行績效指標應該主要包括：生師比、教學儀器設備占當年設備購置支出比例、生均教學儀器設備值、生均圖書資源、各項內涵建設經費支出結構比例、內涵建設經費占當年總支出比例、資產負債率和貸款風險係數等。
根據內涵建設經費的內容，分為師資隊伍建設、教學資源投入、教學質量提高、重點學科實驗室建設、科技平台建設等模塊分別進行核算，核算各模塊支出占學校內涵建設總支出的比例，可以反映高校內涵建設的投入結構，推動學校內涵建設的合理化發展。
3）財務發展指標。財務發展指標從縱向的角度反映高校內涵建設經費的投入趨勢，對未來的發展狀況進行預期。如建立內涵建設經費支出增長率指標，反映高校內涵建設經費的增長速度，指導高校的內涵建設經費投入，在不斷提高增長質量的基礎上穩步增長。
（二）主管部門的創新路徑
1.製度規範
高校內涵建設，涉及師資隊伍、教學資源、建設成果、學生及培養質量等各方麵。目前，不少高校沒有開展對內涵建設的財務分析，即使開展也是按照各個學校自己的理解嚐試著進行分析，從內容到形式都存在很大差異。主管部門應該給予界定和規範，這樣才有利於財務分析的開展。
首先，高校主管部門可借鑒上市公司的管理經驗，對財務報告報送的內容進行規範。如現階段，可規定高校報送的財務報告應該包含財務報表、說明（或附注）、基本財務分析，適當的時候也可以將報表的審計報告納入到報送內容之中。
其次，主管部門可以組織專家和有經驗的實際工作者，製定詳細的內涵建設經費支出規範，界定清楚高校內涵建設經費應包括的核算項目，如人才引進經費、人才培養經費、教學科研團隊建設，重點學科、重點實驗室建設，教學、圖書設備購置等內容，是否應該納入內涵建設經費核算？如何分門別類地歸入各個項目？同時，上級部門也應該與時俱進，將內涵建設的經費投入項目反映在預算科目中，以便高校在編製預算時，根據學校實際情況，在年度預算中安排相應的項目預算，這樣不僅保證了內涵建設的經費投入，而且增強了經費支出的控製力度，更加明確了內涵建設經費的核算範圍。
2.技術支撐
高質量的財務分析報告不僅僅是計算出各項指標數值，更需要將這些數值進行縱向和橫向的對比，評價各項指標的優劣，對糾正出現的偏差提供有力的數據支持。縱向比較是通過學校曆年的指標數值對比分析，了解學校內涵建設的發展情況，這種比較容易實現；而橫向比較則需要將本校的財務分析指標值與其他學校的指標或同類院校的平均指標進行對比。從目前情況看，我國高校的財務報表尚未步入向全社會公布的階段，因此，學校往往無法獲得其他學校的指標，也無從掌握各種指標的平均值。
一方麵，高校的主管部門可以選擇有共性的、重要的財務分析指標，區分不同類型或不同層次的高校，通過分析一定時期高校的基礎數據，計算出可參照的最高值、最低值或者指標平均值，以便為高校財務分析提供參照對比值；另一方麵，主管部門可以通過權威機構測算、製定並公布財務評價的標準值，如2009年中央教育科學研究所高教研究中心發布了《中國高等學校績效評價報告》，首次對教育部的直屬高校進行績效評價。在評價過程中選取了72所高校2006—2008年三年的數據，初步篩選了14項投入指標和16項產出指標進行數據分析，最後運用“產出/投入”數學模型分別算出高校n年產出以及投入綜合指標得分的算術平均值，代入模型所得比值計算高校n年的績效得分。從該研究可以看出，主管部門為高校的財務分析、績效評價提供參照值，或者說提供財務分析與評價的技術支持是可行的。
在對高校財務分析有比較統一認識的基礎上，主管部門則可以組織所管理高校統一開發或購買財務分析軟件，減輕財務分析人員數據查詢和統計工作負擔，讓他們將時間和精力更多放在財務計算結果的分析之上，更好地為高校決策服務。
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