作為共同體組織的南部非洲發展協調會議的成就也十分顯著。該組織成立於1980年4月，成員國有安哥拉、博茨瓦納、馬拉維、莫桑比克、坦桑尼亞、斯威士蘭、萊索托、讚比亞和津巴布韋。主要目標是建立平等的區域經濟一體化，促進各國的和地區的經濟政策的實施，通過協同行動，爭取國際合作，減少在經濟上對南非的依賴。該組織自成立以來，先後已提出100多個建設項目，重點是擴建安哥拉和莫桑比克的海港，恢複和改善鐵路係統，建立各國間的微波聯係，以利於各成員國之間的貿易往來和貨物進出口。成員國還在促進工農業生產方麵進行了廣泛的合作，以盡快擺脫對南非的經濟依賴。有些成員國如坦桑尼亞、莫桑比克和讚比亞之間，還建立了以貨易貨的貿易製度。在當前非洲國家資金、外彙短缺，而西方國家又采取貿易保護主義的情況下，以貨易貨的貿易製度對拓展非洲國家間貿易多樣化，增加貿易額是有益的。
在專項合作方麵，進展較大的是塞內加爾河的開發協作。塞內加爾河開發組織成立於1972年5月1日，由塞內加爾、馬裏和毛裏塔尼亞三國組成，總部設在達喀爾（1982年該組織第七屆首腦會議決定將總部遷往聖·路易市）。其開發的原則是：灌溉、能源和航運綜合利用。主要開發計劃包括：修建迪亞馬水壩（塞內加爾境內）和馬南塔利水壩（馬裏境內）；在塞內加爾河兩岸開墾農田，修建灌溉渠；疏通河道，修建港口和沿河停泊站，在馬南塔利水壩修建發電站等。塞內加爾河開發工程所需巨額資金，主要依靠外援。目前，建造兩座水壩的5億美元資金已籌集到手，工程正在順利進行。整個計劃完成後，可灌溉37.5萬公頃土地，每年發電量為8億度，從塞內加爾河口到馬裏的卡伊將全年通航，原來塞內加爾河流域不發達的狀況將大為改觀。
在金融合作方麵，非洲開發銀行成績顯著，在促進非洲經濟、社會發展和提供優惠貸款方麵起著良好的作用。非洲開發銀行成立於1964年，起初有資本3億美元，1979年增加到63億美元。1964—1980年，該銀行向非洲國家的460個項目提供了25億美元的貸款，並且把其中45%的貸款用於非洲最不發達國家的公路、鐵路、能源和電訊等基礎設施的建設。1982—1986年又向非洲國家提供73億美元的貸款，其中33%用於發展農業，著重解決非洲的糧食問題。為了擴大資金來源，促進非洲國家經濟發展，1982年5月，該行第十八屆年會修改了不吸收非洲以外國家為成員國的決定。該行股本由原來非統組織成員國擴大到非洲大陸以外的國家。到1985年5月，該行成員國已達75個，其中非洲以外國家為25個。
在貨幣合作方麵，根據西非貨幣聯盟成立時的宗旨，其成員國科特迪瓦、尼日爾、塞內加爾、布基納法索、貝寧和多哥已實行貨幣統一，共同使用由聯盟所屬西非國家中央銀行發行的非洲金融共同體法郎，取代了原來在這些國家流通的法屬非洲殖民地法郎。此外，參加中非經濟和關稅聯盟的喀麥隆、中非、剛果、加蓬、乍得和赤道幾內亞也實行了貨幣統一，共同使用聯盟所屬中非國家銀行發行的中部非洲金融合作法郎。貨幣的統一便利了各成員國之間的貿易往來，對促進各地區的經濟合作具有重要意義。
非洲國家間經濟合作還有一個成就，那就是推動了地區防務合作。從1970年代開始，超級大國在非洲的激烈爭奪，南非種族主義政權對鄰國的襲擾，加劇了非洲大陸的不穩定性。它使非洲國家深切感到，沒有安定就沒有發展，沒有政治上和軍事上的合作就難以實行持久的經濟合作。正是基於這樣的認識，1977年，西非經濟共同體（1974年1月建立，由法語非洲國家馬裏、毛裏塔尼亞、尼日爾、塞內加爾、貝寧、布基納法索和科特迪瓦組成。）成員國與多哥簽署了互不侵犯和相互援助協定；1978年，西非國家經濟共同體也簽署了互不侵犯條約。到1981年，西非國家經濟共同體又通過了防務互助議定書，規定共同體根據緊急需要可建立一支幹預部隊，以幫助成員國反對外部侵略，也可以應某個成員國要求而協助其處理內部問題。至於像南部非洲發展協調會議、埃及—蘇丹一體化組織和非洲—毛裏求斯共同組織等，從其成立的那天起，就帶有鮮明的政治色彩。
從上述成就可以看出，非洲國家間地區經濟合作已取得了較大進展，正在顯示著自己的生命力。不過，與其他新生事物一樣，非洲國家間地區經濟合作畢竟起步不久，尚處於低級階段，還存在一些妨礙進一步發展的弱點和障礙。
單一經濟結構的存在和過分依賴西方發達國家的市場需求，是妨礙非洲國家間的經濟合作進一步發展的首要障礙。非洲國家的單一經濟結構是帝國主義長期殖民統治造成的。獨立後變化不大，至今絕大多數國家仍靠一兩種農礦初級產品作為出口的主要收入。例如，在西非國家經濟共同體的16個成員國中，有5個國家的出口收入主要靠花生，有4個國家的出口收入主要靠可可，而其他成員國一般也都生產花生和可可。這樣，要推銷這兩種產品，隻能依賴共同體以外的市場，其中主要是西方發達國家的市場。在工業上，非洲國家一般隻能從事輕工業產品的生產，如罐頭、啤酒、卷煙、紡織和手工藝品等，相互間的貿易量也不大。所需其他工業品和設備，基本上依賴於西方發達國家。非洲國家間要增加橫向貿易，顯得十分困難。
非洲國家間經濟發展不平衡，彼此存在著經濟利益的矛盾，這是妨礙經濟合作進一步發展的又一障礙。非洲國家普遍存在著沿海的和內陸的巨大差別，氣候、降雨量和資源儲藏量等條件也各不相同，還有在長期曆史發展過程中形成的差別，其中包括獨立以後選擇不同的經濟發展模式等，都影響到不同國家的經濟發展水平。同時，在合作過程中，有的國家對本國眼前利益較重視，而對別國利益不夠重視，致使相互間發生利益糾紛。在這方麵，東非共同體是一個例子。東非共同體成立於1967年12月，由肯尼亞、坦桑尼亞和烏幹達三國組成。其中肯尼亞的工業基礎較好，發展水平較高。所以，在三國貿易中，肯尼亞總是處於順差地位，每年順差額高達5000萬到1億美元。坦桑尼亞和烏幹達多次要求在共同體內權力與利益平等，特別是要求貿易平衡，而肯尼亞則認為這是坦、烏兩國有意在貿易上設置障礙，會損害本國的利益，內部矛盾因此日益加劇。從1970年起，三國首腦會議不再舉行，重大問題無法作出決定。1974年，肯尼亞首先接管共同體所屬的鐵路公司。接著，坦桑尼亞、烏幹達也接管共同體在本國的公司企業。1977年，三國相繼建立本國關稅機構。東非共同體已不複存在。再以西非國家經濟共同體為例。在該共同體中，尼日利亞不僅地廣人多，石油資源豐富，而且工業較發達，被認為是非洲經濟大國。盡管尼日利亞一再聲明在共同體內奉行平等互利政策，但其他成員國還是存有戒心。實際上，在共同體經濟發展先後次序上，尼日利亞與多數成員國之間就存在著分歧。尼日利亞多方強調要首先消除共同體內的關稅壁壘，加強貿易往來，以便為它的工業品在共同體內打開銷路。而其他成員國擔心這樣會加強尼日利亞的地位並危及自己的利益，因而主張優先在農業、工業、交通、能源方麵進行合作。而以科特迪瓦、塞內加爾為代表的六個法語國家，則把主要力量用來加強沒有尼日利亞參加的西非經濟共同體的發展上。
資金和技術嚴重依賴西方發達國家，這是妨礙非洲國家間經濟合作順利發展的另一障礙。非洲多數國家財政困難，發展經濟所需資金大部分來自西方發達國家。這不僅使非洲國家債台高築，也使得非洲國家間的經濟合作易受西方發達國家的製約。以南部非洲發展協調會議為例，該組織為了擺脫在經濟上對南非的依賴，把改善和發展交通運輸係統放在首位，擬訂了100多個項目的龐大計劃，所需資金約24億美元。西方發達國家雖答應提供援助，但各有各的打算和條件。美國早在1981年8月就聲稱，援助是可以的，但希望該組織不要成為政治性的組織。歐洲經濟共同體雖也願意向該組織提供資金，但以莫桑比克和安哥拉加入該集團作為前提，以便把協調會議的所有成員國都納入歐洲經濟共同體的經濟勢力範圍。由於技術力量的缺乏，非洲國家在許多經濟發展項目中，對技術的選擇和利用基本上由西方發達國家的技術人員決定，有些技術並不適合非洲國家的情況和需要，非洲人也很難從中得到訓練。在技術上對西方發達國家的這種依賴，影響了非洲國家間經濟合作的進程和發展的速度。
多種貨幣的存在，也是妨礙非洲國家間經濟合作進一步發展的一個障礙。目前，非洲國家間各經濟合作組織除了西非貨幣聯盟、中非關稅與經濟聯盟內部各自有統一的貨幣之外，其餘的大都貨幣種類繁多，在本地區貿易中不能起支付作用，並且多數不能自由兌換硬通貨。例如，西非國家經濟共同體有16個成員國，但使用的貨幣就有11種，其中隻有非洲法郎、利比裏亞元等4種貨幣可以兌換硬通貨，加上多數國家外彙比較短缺，因此即使共同體內完全取消關稅，要發展自由貿易仍會因支付問題而受到限製。為了減少貿易中的貨幣障礙，西非國家經濟共同體還專門成立了西非結算局，用記帳的辦法代替現款支付。這對促進共同體內部貿易有一定的作用，但仍不是解決問題的根本辦法。
此外，政治經濟發展模式不一、邊界糾紛和難民問題等，也影響到非洲國家間地區經濟合作的鞏固和發展。東非共同體的自行解散，除了成員國之間經濟利害這一矛盾之外，政治和經濟發展模式不一也是一個重要因素。1964年10月，阿爾及利亞、摩洛哥和突尼斯三國共同簽署合作協定，成立馬格裏布常設協商委員會，但由於政治上的原因，至今仍未被有關國家批準。西非國家經濟共同體把九個法語國家、五個英語國家和兩個葡語國組合在一起，本來就是一件不容易的事。然而由於成員國之間政治見解的不同，致使共同體在有些事情上達不成一致意見。如該共同體在1981年簽訂防務議定書時，就有三個國家持反對立場。從1960年代以來存在的非洲難民問題（一些難民從事反對所在國政府的活動，另一些難民以所在國為基地從事反對原住國政府的活動），往往造成非洲國家之間甚至某一共同體成員國之間關係的緊張甚至發生衝突。至於邊界爭端，更是非洲國家獨立以來相互間發生糾紛以至衝突的一個重要因素。
非洲國家間的地區經濟合作從1964年第一個組織成立起，已走過了20多年不平坦的道路，有成功，也有失敗；有前進，也有挫折；有經驗，也有教訓。實踐證明，非洲國家隻要本著平等互利、共同發展的原則，堅持“集體自力更生”的方針，團結協作、互諒互讓、求同存異，經濟合作一定會得到進一步發展。
和平解決邊界問題
自帝國主義瓜分非洲以來，非洲一直是個邊界爭端頻繁、民族糾紛迭起的大陸。在以往殖民者主宰非洲的情況下，一旦出現邊界爭端，解決的辦法不是政治訛詐就是兵戎相見，結果不僅舊的矛盾得不到解決，而且又產生新的矛盾。第二次世界大戰以後，隨著帝國主義殖民體係在非洲的崩潰，民族獨立國家一個個在非洲大陸出現，解決邊界爭端的方法也隨之發生變化。尤其是1963年非洲統一組織建立後，非洲國家在解決相互間邊界爭端時越來越重視和平談判和協商的辦法，其中非統組織起了重要的作用。非統組織成立於非洲民族國家邊界衝突頻繁激烈之時，這就要求它為解決邊界衝突提出原則和策略。根據非洲民族國家邊界形成的曆史和現狀，非統組織從一開始就不主張改變非洲國家邊界，把邊界不可改變的原則作為自己外交活動的一項基本準則。這一思想在1963年5月非統組織成立大會上通過的《非洲統一組織憲章》中就得到了反映。1964年7月召開第二屆非統組織首腦會議時，正式通過了關於非洲邊界不得改變、和平解決邊界爭端的決議。決議中說：“考慮到邊界問題是一貫造成不和的重要因素，意識到存在著來自非洲之外旨在分裂非洲國家的行徑，還考慮到非洲國家的邊界獨立時已經形成”，因此，“會議鄭重聲明，所有成員國保證尊重非洲國家獨立時業已存在的邊界”，如果有關國家一旦因邊界發生糾紛，就應通過“和平方式並完全是在非洲範圍內解決”。正是依據非統組織確定的“尊重邊界現狀，和平解決爭端”的原則和策略，自1960年代以來，非洲民族國家在解決殖民時代遺留下的邊界爭端問題上取得一個又一個成功。
為了說明非洲國家在和平協商解決邊界爭端上的不斷進展，這裏有必要對非洲國家邊界的形成和邊界形成後為何引起爭端作一論述。
古今國家邊界之形成，其種類大體上可分為兩類：一類是曆史形成的以山川、湖泊、沙漠、荒原為界，稱天然的邊界；另一類是通過訂立條約而確定標誌，稱人為的邊界，或政治邊界。不過，隨著社會文明的發展，國家與國家之間關係的增長，所謂天然邊界也越來越成為人們可以劃定的邊界。天然邊界已成為人們強加於大自然的界線。非洲國家邊界的形成是人類曆史這一情景的具體表現。
在帝國主義瓜分非洲之前，非洲國家基本上都是由某些輪廓線模棱兩可的山川、湖泊、沙漠、荒原分開的，不存在劃定屬於哪個國家權限的地區界線。這種情況是由這樣兩個因素決定的：其一，非洲地廣人稀，即使一些組織結構比較完善的國家，如埃及、摩洛哥和埃塞俄比亞等，其中央政權也隻能在一個較為有限的區域內行使職能，不可能有為邊境土地而與鄰國爭吵的問題；其二，非洲各民族多數以遊牧打獵為業，為尋求水源、牧場和獵區，要經常遷徙，這就使得邊界概念反而顯得多餘。例如，摩洛哥、阿爾及利亞在撒哈拉地區早先就不存在任何明確的界限，那時它們各自的“司法權力和行政權力在沙漠地區是對人員和部落行使的，而不是對構想出來的領土行使”。正因為這樣，長期以來，在非洲，人們對於“邊界”這一概念是模糊不清的，或者說根本沒有。
但是，到了19世紀末和20世紀初，隨著帝國主義對非洲的瓜分，西方列強按照自己的實力和利益把非洲大陸人為地劃成條條塊塊，豎碑立界，就使非洲大陸原先模棱兩可的自然疆界變成明確固定的人為邊界。
西方列強在非洲占領的起初是零碎、局部的地區，相互間一般不發生矛盾。但從1870年代起，隨著占領範圍的日益擴大，相互間的矛盾也產生了。為了減輕並緩和矛盾，1884年11月，在德國首相俾斯麥的主持下召開了柏林會議。經過激烈爭吵，1885年2月，與會者簽訂了一項總決議書。它規定，以後任何國家在沿海占據領土，必須通知全體列強；占據沿海便可以得到內地的一份權利；一切領地的兼並必須伴隨以實際占領，否則無效。
繼柏林會議之後，西方列強又簽訂了一係列的雙邊協定，例如，1890年的英德協定，1891年的英葡協定，1894年的法比協定，1898年和1904年的英法協定等等。這些協定都以分贓的方式解決相互間的領土爭執，確定彼此殖民地的邊界線。
在當時對非洲地形測量不足和對非洲內地不甚了解的情況下，帝國主義者除了以某些河川、湖泊和山脈等作為邊界以外，還采用了如下幾種方式：
第一，以表示地球表麵方向的經線、緯線為殖民勢力範圍的邊界線。例如，埃及和利比亞之間的邊界線，基本上是以東經25度線為界，而埃及與蘇丹之間的邊界線基本上是以北緯22度線為界。又如，納米比亞和博茨瓦納、南非（阿紮尼亞）之間的一部分國界線，是以東經20度為界，而南緯22度線則構成了納米比亞和博茨瓦納700公裏的邊界線。
第二，以兩地之間的幾何直線或曲線為邊界線。馬格裏布諸國在大陸上的國界線和撒哈拉以南各國的大部分國界線，基本上都是使用這種直線或曲線形成的。以尼日爾的邊界為例，在劃定南部邊界即尼日爾—尼日利亞邊界問題上，1890年8月5日的英法協定就曾把從薩巴到巴羅阿之間的直線作為邊界線。隻是由於這條線在橫穿時涉及到某些交通線和經濟區劃，後來又經英、法多次協定，才形成了今日以許多不同點之間的直線或曲線連接的尼日爾—尼日利亞的邊界。尼日爾和達荷美（今貝寧）之間的邊界被規定為從加亞東南20公裏的一個點為起點，沿著尼日爾河約125公裏直到梅克魯河河口，繼而沿梅克魯河直到約100公裏的地為止。尼日爾與上沃爾特之間的邊界被規定為北起古納山，經卡比亞淺灘，到通格通格天文座標，然後折向東南，穿過特臘—多裏小道，到塔奧天文座標，直到博索邦古以北10公裏的西爾巴河。尼日爾與馬裏之間的邊界，在尼日爾的特臘行政區和馬裏的安鬆戈之間基本上是由古納山到拉貝藏佳的直線構成。繼之由拉貝藏佳到安德蘭布坎，再由安德蘭布坎經過費林格北麵的最後一個村莊蒂格塞芬以北，溯阿茲哈爾河穀而上，直達埃坦博沼澤地，再由此正北方向到北緯19度以北40公裏的地方，即同阿爾及利亞撒哈拉沙漠南部邊界的交叉點為止的邊界，基本上也是由直線構成。至於尼日爾與阿爾及利亞之間的邊界，則被規定為從這個交叉點開始，一直到位於格讚以南15公裏的一個點，再以這個點折向因阿紮瓦以北15公裏的一點，一直伸到同利比亞邊界相交的一個點。這點是東經12度與北回歸線的交叉點，確切的名稱是1010號點（即加雷特·德魯埃特·傑梅爾）。尼日爾與利比亞的邊界是由1898年6月14和1919年9月12日的法意協定規定的，即西部自1010號為起點，沿東南方向作一傾斜線，直至圖木。然後又自圖木起，按照習慣上的一條直線，直到乍得與利比亞相交的那個點，即北緯23度和東經15度的相交處為止。至於尼日爾的東部邊界，從尼日爾—利比亞—乍得的共同邊界點起，直到科馬杜古約貝河河口，基本上是由不同經緯度的交叉點之間的直線構成。
第三，以互換領土的辦法形成邊界線。例如，英屬塞拉利昂西北部邊界就是英國殖民者將科納克裏附近的洛斯群島讓給法國，換得法屬幾內亞部分領土後形成的。又如，馬拉維的北部邊界是1890年7月英國以赫爾戈蘭島換來德國的讓步形成的，南部邊界則是英國為了取得馬尼卡蘭而把一片土地讓給葡萄牙殖民者的結果。
帝國主義殖民者在非洲劃分勢力範圍邊界雖有這些不同的方式，但在實際運用時都以各自的利益為依據，以各自的實力作後盾。這就決定他們在劃分勢力範圍邊界的過程中必定是爾虞我詐，勾心鬥角，甚至不惜以武力相威脅。一般說來，帝國主義殖民者是以自己侵略勢力所能達到的極限作為自己殖民勢力範圍的邊界。
經過帝國主義間的激烈爭奪，到第一次世界大戰前夕，非洲大陸50來個國家地區的邊界已基本上形成。這些國家地區的邊界總長達4.64萬公裏。其中按經線或緯線劃的邊界占44%，用直線或曲線的幾何方法劃的占30%，由河川、湖泊和山脈構成的占26%。結果，原先非洲國家的傳統邊界被破壞了，各民族的聚居區域被破壞了。昔日屬於同一的民族，現在被分割在不同的國家和地區；昔日在同一國家的不同民族，現在被分割在不同的國家和地區，相互變成外國人。
在撒哈拉以北非洲，阿拉伯人的居住區被英國、法國、意大利、西班牙四國分占。
在西非廣大地區，許多民族聚居區域被弄得四分五裂。例如，原先由於曆史上的和地理上的因素，西非尤其是幾內亞灣沿岸地區，民族的分布與自然地理、經濟區劃一樣是東西方向延伸的。但帝國主義者劃定這個地區勢力範圍邊界時，卻主要是南北向，即從海岸至內陸的垂線來劃分的，幾乎都是相當生硬的幾何線，或者是順沿一些絕少符合當地民族分布的河流分水嶺等。其結果就使這一帶民族聚居區域比非洲其他地區更加支離破碎。如富爾貝人有80萬被分在法屬幾內亞，28萬分在塞內加爾，11萬分在葡屬幾內亞，還有一部分人分在英屬岡比亞和塞拉利昂。埃維族有50多萬人被分在英屬黃金海岸，30萬人分在德屬多哥，20萬人分在法屬達荷美。卡努裏族地區分別劃入法屬尼日爾、英屬尼日利亞和法屬乍得。還有曼丁哥族、豪薩族、莫西族、約魯巴族等，都活生生地遭到了割裂。
在非洲南部地區，許多民族聚居區域和國家也被弄得支離破碎。例如，馬拉維族被分割在英屬尼亞薩蘭、德屬東非（今坦桑尼亞大陸部分）、葡屬莫桑比克和英屬南羅得西亞、北羅得西亞；隆達王國被分割到葡屬安哥拉、比屬剛果和英屬北羅得西亞；剛果王國被分割到法屬剛果、比屬剛果和葡屬安哥拉。其他如恩戈尼族、堯族、馬塔貝萊族、馬肖納族等，也都被分割在不同的國家和地區。
在非洲東北部，索馬裏族聚居區域被分割成意屬索馬裏、英屬索馬裏、法屬索馬裏、埃塞俄比亞的歐加登地區和英屬肯尼亞的東北地區。千年古國埃塞俄比亞，由於意大利侵占厄立特裏亞，成了沒有出海口的內陸國家。
上述事例說明，在帝國主義者劃分勢力範圍邊界的過程中，由於非洲許多民族的聚居區域被分割，一些國家的傳統邊界遭破壞，導致許多國家的邊境地區出現了外來民族問題，出現了少數民族問題，產生了維護民族統一與鞏固國家邊界安全之間的矛盾和糾紛。同時，用經、緯線劃分邊界的方法，在地圖上標出容易，但用地形測量圖線表示卻很困難。這就使一些國家和地區長期陷入無休止的邊界爭端和民族糾紛。帝國主義在非洲劃分勢力範圍時的人為邊界，是當代非洲國家邊界爭端和民族糾紛的總根源。
從曆史上看，由帝國主義的人為邊界所造成的非洲國家的邊界爭端，大體上可分兩個階段：第一階段，從帝國主義在非洲劃分勢力範圍開始到大多數民族國家獨立之前；第二階段，從非洲大多數民族國家取得獨立直到今天。
邊界爭端的第一階段，主要是在帝國主義殖民地、保護國與非洲民族國家、土著居民之間進行。爭端都由帝國主義者挑起，並以有利於帝國主義國家而結束。由於非洲北部地區的社會發展水平高於撒哈拉以南地區，所以這一階段能在邊界問題上同帝國主義者進行鬥爭的主要是非洲北部地區的國家。
在馬格裏布地區，法國殖民者征服阿爾及利亞以後，為了變摩洛哥為自己的殖民地，在阿爾及利亞和摩洛哥邊境地區經常製造磨擦事件。在摩洛哥的要求下，1901年，法國與摩洛哥在拉拉—馬爾尼亞締結了一項條約，詳細規定了從海岸至特尼埃薩西之間的阿爾及利亞與摩洛哥的邊界線。關於特尼埃薩西以南地區，即撒哈拉，條約僅指出兩個主權國家對各自的臣民行使權力，依什和菲吉格兩個村民點為摩洛哥屬地，其他村民點由阿爾及利亞管轄。位於這些村民點以南的領土，條約規定：“由於無人居住，沒有必要劃定邊界。”但過後不久，法國殖民者利用其經濟優勢和軍事實力，單方麵把行政管理權擴展到這些村民點以南地區，從北緯32度向南擴展到北緯27度以遠，占領了圖瓦特綠洲，繼之又占領了廷杜夫。法國殖民者為了使摩洛哥承認這一事實，1912年劃了一條從特尼埃薩西到科隆布—貝沙爾地區之間的邊界線，即所謂“瓦尼埃線”。直到1928年，摩洛哥才被迫承認“瓦尼埃線”為行政和稅收的邊界線。
在東北非，索馬裏族居住區在帝國主義瓜分非洲時被分割成五個部分。歐加登地區劃歸埃塞俄比亞主要是英國的主意。1897年，英國為了不讓埃塞俄比亞支持當時蓬勃高漲的蘇丹人民抗英鬥爭，雙方簽訂了一項秘密協定，英國答應把歐加登地區交給埃塞俄比亞。但在這個地區的邊界劃定後，英、法、意三國又總想以犧牲埃塞俄比亞領土的辦法來維護和擴大自己在這個地區的地盤。特別是意大利，為了侵占埃塞俄比亞的領土，接二連三鼓動邊境地區牧民在需要牧場和水源的時候，任意進入埃塞俄比亞的地界，並且由意屬殖民地的邊防部隊提供武裝保護。英國為了把意大利的擴張矛頭引向埃塞俄比亞，以保護自己在肯尼亞的利益，1925年同意大利簽訂了一項協定，英國承認並答應支持意大利在埃塞俄比亞取得經濟勢力的要求，意大利則答應支持英國獲得一塊租借地，以便在塔納湖建立攔河壩。三年以後，英意兩國又簽訂了一項永久和平與同盟條約，這就更助長了意大利對埃塞俄比亞邊界的進犯和領土的蠶食。到1930年，雙方在具體劃分意屬索馬裏和埃塞俄比亞的邊界線上出現了嚴重對立，終於導致1934年在瓦爾瓦爾地方的嚴重軍事衝突。由於意大利使用優勢兵力和現代化武器，埃塞俄比亞軍隊被迫從邊界後撤。接著，意大利就作了入侵埃塞俄比亞的準備。1935年，意大利公然發動了侵略埃塞俄比亞的戰爭，占領了包括歐加登地區在內的整個埃塞俄比亞。
在撒哈拉以南非洲，殖民當局與土著居民在邊界問題上的糾紛也經常發生。隻是由於當時土著居民處於無權地位，這樣的糾紛一般不為外界所知。例如，根據1904年條約劃定的英屬黃金海岸和德屬多哥殖民地的界線，達戈姆巴族居住區被分成兩半，達戈姆巴族為此提出了抗議。但直到第一次世界大戰結束、這一帶重新劃界時，達戈姆巴族居住區才得到統一。然而就在這重新劃界過程中又出現了新的矛盾，原德屬多哥的埃維族居住區又被分割開，分屬於英、法兩個委任統治地。埃維族對這種分割也提出了抗議。但隻是到第二次世界大戰後改為托管地，他們才被允許正式提出自己的反對意見。
第二次世界大戰後，隨著非洲民族的日益覺醒和非洲民族解放運動的蓬勃開展，非洲的麵貌發生了重大的變化。帝國主義在非洲的殖民統治寶座一個個相繼倒塌，民族獨立國家一個個陸續出現。但是帝國主義殖民者埋下的邊界爭端的禍根仍沒有消除，邊界衝突事件仍不斷發生。所不同的是，過去邊界爭端主要發生在殖民地當局與非洲民族國家、土著居民之間，而現在主要發生在非洲民族國家之間；過去邊界爭端的解決是靠強權政治，使用武力，而現在強權政治、武力因素雖不時也起作用，但和平協商解決邊界爭端越來越為人們所接受，逐漸成為曆史的潮流。
非洲民族國家間的邊界爭端首先表現為，有些民族國家主張改變殖民時期劃分不當的人為邊界，有些則主張維持殖民時期的邊界。這種矛盾情況存在於獨立後的許多國家之間，其中尤以馬格裏布地區最為突出。
馬格裏布地區國家之間的邊界爭端主要存在於撒哈拉地區。摩洛哥於1956年獨立後，就多次提出要求調整與阿爾及利亞在撒哈拉地區的邊界問題。1958年9月19日阿爾及利亞共和國臨時政府成立後，摩洛哥馬上承認它是唯一能夠討論邊界問題的權力機構。1961年7月6日，雙方締結了一項關於邊界問題的秘密協定。協定規定：“摩洛哥國王陛下政府重申無條件支持阿爾及利亞人民爭取民族獨立和國家統一的鬥爭”；“阿爾及利亞共和國臨時政府承認，因法國武斷強行劃界而造成的兩國間的領土問題，將通過摩洛哥王國政府和獨立的阿爾及利亞政府之間的談判加以解決”。“為此目的，兩國政府決定成立一個阿—摩委員會。該委員會將本著馬格裏布友好和團結的精神，盡快舉行會議，研究並解決這一問題”。此外，阿爾及利亞共和國臨時政府重申，通過阿爾及利亞和法國之間談判可能締結的任何協定，在涉及阿—摩領土劃界上，不應當使摩洛哥受到損害。
但是，自1962年7月2日阿爾及利亞宣布獨立之日起，在兩國存有爭議的科隆布—貝沙爾地區的哨所附近多次發生衝突。兩國還因此互相攻訐。隻是由於非洲有關國家元首的多次調解，雙方才於1963年10月30日簽訂了停火協定。1964年2月20日，在非洲統一組織的調解下，雙方簽署了一項新協定，劃定了非軍事區。1967年11月，雙方通過多次會議，在伊夫拉恩簽署了一項團結、合作條約。條約規定，雙方在發生爭端時保證不訴諸武力，並同意將懸而未決的問題交給雙方代表人數相等的委員會。1970年5月成立了一個雙方人數相等的邊界委員會，以調整不合理地段的邊界線。
在阿爾及利亞與摩洛哥之間發生邊界爭端的同時，阿爾及利亞與突尼斯之間的邊界爭端也發生了。與摩洛哥一樣，1956年突尼斯獨立之後，也多次提出調整與阿爾及利亞在撒哈地區的邊界。突尼斯提出調整的主要理由是，兩國在撒哈拉地區的邊界從未劃定過，現在有必要加以調整。但法國當局卻答複說，突尼斯在獨立前已同意接受現有的邊界。到1962年阿爾及利亞獨立之前，阿爾及利亞與突尼斯邊界摩擦事件不斷發生。阿爾及利亞獨立後，由於阿爾及利亞與摩洛哥邊界爭端加劇，阿爾及利亞與突尼斯邊界問題退居次要地位。在1967年阿爾及利亞與摩洛哥簽訂伊夫拉恩條約後，阿爾及利亞與突尼斯正式舉行了關於邊界問題的談判，並於1968年4月16日簽訂了邊界協定。根據協定，確立了從比爾羅馬恩到聖堡之間250公裏的分界線。與阿爾及利亞和摩洛哥在撒哈拉地區的邊界線一樣，突尼斯與阿爾及利亞的這條邊界線基本上繼承了法國殖民時期的劃法。