之後的戰爭發展形勢，也證明了這種擔憂是非常正確的。
混元宗作戰向來不願意多占地盤，不想為駐守城市而分兵，但奪占揚州後，混元宗卻不像以前那樣隻搶財物後就退出去，而是派出一支兩萬人的部隊在揚州駐紮起來，成為進攻清廷的最北方的橋頭堡。
這時候，所有人都突然警醒起來，混元宗的總兵力已經達到八萬人，從南到北的根據地裏還有五萬以上新兵在接受訓練，遠不是以前士兵精悍卻少的情況。
李仙派去駐守揚州的是原來的海軍陸戰隊指揮官喬大青，他在揚州駐紮下來後，依托地形建立極為牢固的防守陣地，又能通過長江獲得各種補給和支援，之後清軍雖然多次反撲揚州，但均以失敗告終，反而成就喬大青的赫赫威名。
在之後的一段時日裏，江西、浙江和福建的清軍幾乎沒能組織什麼有效的反抗，基本是望風而降。
不管是混元宗、三元觀還是太平軍，甚或天地會和其他造反盟友，在這一時期均在快速擴張兵力，多占領地盤，其軍事實力均出現天翻地覆的變化。
1849年春，李仙終於率領五萬精銳重新登陸莆田，然後到九連山，步步推進，絕不冒進，與異人殿留守九連山的守軍發生多場殊死戰鬥。
洞天福地畢竟算是另一個世界，普通士兵在裏頭生存都困難，用起兵來非常麻煩，因此就算在主世界占據絕對優勢的情況下，進攻有大量高手駐守的洞天福地也絕不是什麼容易的事情。
要不然，清廷之前擁有天下，又有異人殿的修士輔助，也不會隻能占領十幾個洞天福地，其餘地方任由敵視自己的武學門派占據，就是連三元福地這樣離廣州很近的地方也由得三元觀經營。
還好，李仙這次做足了準備，軍中高手無數，但是先天高手就有二十人以上，而九連山的實力在之前的戰鬥中受到極大削弱，又有大量高手被抽調，此時的防守力量處在數百年來的穀底。
不過，這一戰依然打得天翻地覆，混元宗足足打了半年才將九連山拿下，光複了著名的南少林福地。
這一戰，一方麵大大鼓舞了天下武林的士氣，另一方麵也標誌著混元宗有了自己獨立的福地，不需要再跟三元觀擠在一起，對混元宗而言，其意義不比南京的陷落差多少的。
在1849年年底的時候，長江以南九成以上的地區都落入造反者們手中，使得造反勢力和清廷之間的勢力對比發生根本的變化。
隻是，隨著占領的地盤越來越多，造反者們之間的摩擦也越來越頻繁，別的不說，廣西魔教自持為魔尊留下的正統傳承，甚至自稱太平軍，不願意加入各大門派組成的華夏盟，隻承認跟華夏盟是盟友關係，其心思昭然若揭。
不過，這樣一來魔教也得罪了華夏盟大部分門派，而且擱置了百年多的正邪之爭也不見得完全平息，魔教就開始被華夏盟有意無意地孤立起來。