應高明的要求，商飛公司單獨成立了一個內部審計部門，對所有的工作的流程和執行都有權進行審核，以糾正程序和體係上的缺失，這也包括對商飛公司的供應商的審計，因為供應商的產品質量會直接影響到商飛公司的生產或研發。這個內部審計也是西方大公司的通行的做法，主要是考察財務上和運營上的工作缺失不足，並責令各部門整改。其實這個內審就象人為了健康要不斷檢查自己的各項指標一樣，對企業的不斷改進和發現問題是極有好處的，所以有些西方的公司內審程序極為嚴格，甚至強過外審。這個內審部門由高明親自挑人組建，直接向高明彙報，高明不在時就直接向麥基通報。因為那時的國企對內部審計還很陌生，於是高明在選好了人後就對內審員親自培訓，並帶著他們對公司的各項工作進行了一次試驗審核。
因為許多人不了解內審是什麼，審核前公司上下都人心惶惶的，都覺得這個跟檢查組、整風組啥的一樣，怕是又一次整人、整風之類的運動，有許多人都在底下發牢騷，說怎麼美國人也搞這套，還讓不讓人專心工作了！餘世珍聽到後也有些擔心，急忙找到高明問這是要做什麼。高明就給他仔細講解了內審工作的內容和意義。餘世珍這才明白，雙手讚成，兩人一合計，這樣的誤會還不在少數，不如統一講解傳達一下，免得下麵誤解做出不配合的動作。兩人就把公司的管理人員都召集起來開了個會，由高明給所有人都上了一課，講述內審工作的內容，方式，和意義，並把內審部的員工分派到各個部門和車間去進行現場教育和培訓，要讓人們都明白內審工作的目的不是為了整人。
培訓起到了一定的效果，但還是有一部分人不相信公司的目的是這麼純潔的，總是覺得他們會借機整人報複。這麼多人有這種看法那是很自然的，這也是沒辦法的事，隻有用長期的行動來消除人們的疑慮。
經過一係列的鋪墊和準備，試驗審核很快就展開了，雖然人們都有了準備，但還是查出了無數的漏洞，其中還牽扯到了一起采購部門的涉嫌貪汙的事件，普通的工作缺失都可以改善，但貪汙腐敗損公肥私是絕不可以允許的，必須殺一儆百以正視聽，這一點上高明和餘世珍的觀點非常一致。涉案的兩人在兵器工業部和航空部裏都有人，有些領導建議給個處分就行了，要不再扣些工資啥的，畢竟要抱著治病救人的原則嘛，但高明堅決堅持開除兩人，其他事情都好商量，但公司決不能養活家賊！那可是他的錢，這跟偷他的錢包有什麼分別？不管遇到什麼阻力或是有多大的後台，在商飛絕不允許有這類現象出現，一經發現立刻開除，涉及到法律的移送司法機關處理，絕不姑息。
高明的這段話很快就傳到員工的耳朵裏，大部分人聽了都是大快人心，認為高董做得對，就得這麼整治一下公司的歪風邪氣，給商飛公司一片純淨的樂土，再說那確實是人家的錢，誰家的錢被偷被騙了不得急呀！當然，也有些人則擔心這樣做會不會遭到報複，還有些手腳不幹淨的人則被高明的雷霆手段震懾住了，趕緊收手，畢竟商飛公司提供的各項待遇在當時的國內都是極端豐厚的，無數人都削尖了腦袋想往裏鑽呢，真的犯不著為點小錢耽誤了前程。
其實，高明要親自領銜內審部門的原因之一就是要從作風上給眾人立起新規矩，他明白國營公司的一個弊端所在就是損公肥私，但人事體製上又錯綜複雜，解決問題時會遇到各種各樣的掣肘，這個問題必須從一開始就給員工明確地表態，公司其他的工作上的失誤和疏忽都可以容忍，畢竟是人，誰都會出錯，但這種貪汙的行為不屬於那個範疇。而且這件事以出資人的身份來做則更容易推行下去，從這點上來講，高明甚至比餘世珍更合適，他可不怕得罪人，官司打到國務院都可以，讓所有那些有後台的人收手。
當然，也不是沒人想報複一下，但那些後麵算計的人對高明一時也無計可施，人家是投資方，根本和自己不是一個係統，從某種意義上講，隻要人家不犯法，政府也管不著人家，這個工程又是國家的重點工程，想給商飛穿小鞋都要十分小心，上麵的一大票大佬們可都在象關注成長的寶貝兒子一樣關注著商飛呢。