就在法國遠征聯合艦隊調派、製定作戰計劃的過程中，遠東黃海艦隊與南海艦隊，早就做足的迎戰的一切充分準備，早就開始對所有戰艦進行維修保養，給全體參戰的水兵們足夠的休假時間，用於養精蓄銳，等待敵人的到來。
在黃海與渤海的海戰之後，遠東兩支艦隊的全體水兵、軍官全體歸隊，直接就進行了緊張的訓練與演習，同時根據遠東海軍總司令劉清輝的判斷，法國艦隊最有可能就是分兵兩路，一路攻擊頭頓海港，另一部分則是巡弋南海，為另一支攻擊艦隊提供安全保障。
對此，劉清輝製定了一個對應的作戰計劃，那就是在頭頓海港外50海裏處，布置遠東海軍全部的潛艇編隊，同時派出南海艦隊死守頭頓港，而遠東海軍主力，黃海艦隊迎戰巡弋的法國艦隊，因此，遠東海軍與法國海軍的主力戰艦，就開始向南海頭頓海港附近沿海集結、靠近，等待最佳的時機。
同時南亞地區的遠東陸軍，也開始向頭頓港外圍地區集結，主要在新安、西寧、現代三地駐防，徹底放棄金邊的防禦陣地，也就在這樣的一個重要時期，發生了一件大事，那就是英國與法國的矛盾，不過這一切都是因為法國當局的自大和李寧宇的暗中操作導致，而法國也因為英國的出兵，不得不分兵15萬，退守北部地區，防止英軍的侵入。
還有一點就是，長途跋涉的第二軍團，在李西華的指揮下，終於在金邊會戰結束後，抵達了內地與越南交界處，不過李西華不久之後就收到了李寧宇的嚴令，原本準備休整的第二軍團，立即繼續向南推進，直到進入越南與老撾邊境地區才開始休整，不過與從緬甸和印度而來的英軍，形成了由北向南進攻之勢。
在獲取法國遠征聯合艦隊的作戰計劃之後，遠東海軍艦隊立即在法國艦隊可能經過海上通道上布雷，還組織了監視分艦隊，形成了一個龐大的情報預警係統，縱深達到220公裏以上，可見遠東海軍，已經在南海做好了戰鬥準備。
而法國遠征聯合艦隊，由於無法在中立國家加煤，以及等待南亞地區殖民軍的配合，在最後一次進行海上加煤之後，每艘戰艦上的燃料數量足夠行駛500海裏，法國海軍元帥羅傑斯下令開始執進攻頭頓港的計劃，不過這時的法國戰艦基本都嚴重超載，另外就是在此期間，太平洋艦隊發生了一次兵變事件，不過卻被羅傑斯硬壓了下來。
1900年9月9日，法國遠征聯合艦隊的第一分艦隊，也就是太平洋艦隊開始進入頭頓海港150公裏海域，法國製定的南海大戰中的頭頓海戰爆發，也是著名的南海大戰的前奏，遠東與法國海軍，雙方各有主力鐵甲主力戰列艦24艘，鐵甲巡洋艦87艘，不過遠東隻有27艘，法國擁有60艘。
但遠東擁有四支潛艇編隊，60艘攻擊潛艇，而遠東海軍戰艦，無論是戰列艦還是巡洋艦，都要比法國遠征聯合艦隊的航速快，平均高達20-22節，而法國戰艦平均下來的航速隻有16-18節，火力上遠東戰艦也占優勢，遠東戰列艦與巡洋艦每分鍾可以發射炮彈330發，也就是總重量為219噸的炮彈，而法國戰艦最多隻能發射434發、259噸，因為在雙方戰艦的數量上，遠東少於法國60艘戰艦。