此時杭州也已經得到了安慶軍往浙江而來的消息，巡撫張曾敭並沒有料到對方來的這麼快，加上幕僚判斷對方一路虛張聲勢並不敢來攻杭州這樣的大城，所以並未嚴加防範，隻是嚴令紹興清軍防備安慶軍來襲。
到了杭州城外，熊成基提出讓一部份人先潛入城內，等到半夜攻取城門，放大隊人馬入城。
李秉衡提議混入城的任務由南洋來的兄弟完成。大家都對他們放心，並無異議，隻等半夜信號一起便裏應外合奪城。
但李秉衡誌不在此，他的目的是浙江巡撫張曾敭，隻是怕眾人不敢讓他冒險才沒有提出。對於已經訓練多月的溫生才等人，初步達到了他的要求。攻占巡撫府看似駭人聽聞，但的確沒有什麼難度。
半夜兩點，所有人都陷入熟睡。大街上隻由巡夜之人出來轉上一轉，連個鬼影子都看不到。白天潛入後躲藏在城門附近的李秉衡等人開始行動，分出三十人由李燮和帶著等巡撫府火起便迅速搶占城門。李秉衡一行迅速往巡撫府而去，一路上之聽得沙沙的腳步聲，連聲咳嗽都沒人發出。陳伯平對杭州比較熟悉，對巡撫府建築布置也有了解，所以這次由他充當向導。
隻半個小時眾人就到了巡撫府後門，用抓牆鉤上了圍牆後放下繩索，一個接一個的爬上牆又一個個的縋入院中。雖然有些人由於緊張動作不協調發出了聲音，但總體沒有出紕漏。門房睡得死豬般猶在夢中，被溫生才無聲的解決了。留下兩人看守後門，其他人在陳伯平的帶領下往後院而去。後門的院子往裏兩重就是張曾敭與家屬所在的住處，兩進院子都有一隊清兵看守，中間有一隊巡邏兵會在後院的巡邏。趁著巡邏兵到前麵去的時候，李秉衡抓住機會帶著一部份人上前準備打對方一個措手不及，另一部份人則爬上牆搶占製高點。悄悄到近前，對方還未發覺。李秉衡拿著衝鋒槍，手一揮衝了過去，一時槍聲大作，門口那隊守衛沒有來得及回擊就被全殲。裏麵的那隊守衛聽得槍聲起，趕緊過來增援，被搶zhan有利位置的同誌打的趴在地上不敢起身。李秉衡乘勢帶了人衝了進去，將殘敵解決。這時早已有同誌控製住了各個要道，三三兩兩的清兵衣冠不整地從廂房中衝出來，全被打死在門口。巡邏的那隊清兵趕了回來，與李秉衡等人憑著建築掩護對射。李秉衡手一指，溫生才帶了幾個人從側麵繞過去賞了幾個手雷，炸的對方哭爹喊娘。眾人從了上去三下五除二解決了對方。沿著遊廊長驅直入，一路隻由零散的抵抗。溫生才帶著一部份同誌迅速攻到前院與後院的連廊，搶占防守點，將從前院趕來增援的清兵擋住。蜂擁而來的清兵知道大事不妙，拚命進攻，但在自動火器的集中掃射下，隻不過是徒勞的送命而已。清兵不要命的進攻，不多時已積屍數重，胡亂的放著槍。但這些同誌都是在南洋跟著李秉衡練得賊精的角色，搶占的射擊點對於對方來說都是射擊死角。這時李秉衡與陳伯平已經輕鬆解決了戰鬥，將張曾敭等人一網成擒。分出部分人從側麵的花園進去，從旁邊殺出，打的對方如落花流水。隨著前院的陷落，局勢基本已經穩定。
此時李燮和早已搶占城門將熊成基等人放了進來，大隊人馬分成數股，往各個重要府衙而去。城內聽見槍聲，都道是革命黨人打了進來。各處的官員惶惶不可終日，逃得逃躲的躲。有部分清兵妄圖組織起來鎮壓革命黨，被一陣亂槍打的再不敢露臉。在聽說張曾敭被擒獲後，再也沒有人妄圖抵抗。熊成基等人迅速的掌控了各個城門以及重要府衙，並派出馬營四處維持秩序，防止擾民事件發生。
城內軍學界的同誌紛紛揚眉吐氣，前幾日與秋瑾等裏應外合奪取杭州時功虧一簣，如今總算不用如過街老鼠般躲躲藏藏。聽得攻占杭州的是安徽來的同誌時，紛紛歡呼雀躍，組織起來幫助熊成基等人控製全城。
馬宗漢提議將張曾敭等部分鎮壓革命的頑固分子就地正法，人頭掛在城牆上以震懾蠢蠢欲動者。雖然有些殘忍，但也是這個時代的慣例，李秉衡也就由他。隻是將其他官員與家屬以及恩銘等安慶捕獲的官員一並關入了大牢，不再去管他們。
熊成基將各個存糧的府庫打開，將糧食分給城內百姓。又出具安民告示，告以革命軍來曆及宗旨，以拉攏人心。
將所有收集到的白銀等財產分給士兵們部分以犒勞此次大功，餘下的仍有不少，都被熊成基拿去招募兵丁與交給城內軍學界同誌所用。
城內士紳以及富戶等見革命軍並不擾民，也不上門來催要勞軍費。心下有些揣揣，部分人借勞軍的名義過來送錢送物，李秉衡都命人退回去。