二世覺得趙高說的太有道理了，前有李斯的理論依據，後有趙高的實際支持，左青龍，右白虎，天下大安。
於是二世就把朝中大事的處置權都交給趙高，自己躲在後宮慢慢享樂。
趙高從此大權獨攬。
過了一段時間，趙高聽說丞相李斯對自己的做法有些不滿，如果是別人還好說，李斯的地位多少讓趙高忌憚，所以決定幹掉李斯取而代之。
他主動去見李斯，告訴他天下盜賊紛亂，皇上卻在不斷征兆民夫修建阿房宮，還天天玩狗鬥雞，不理朝政，李斯作為當朝丞相應該去勸諫一下皇上。
李斯非常感動，覺得趙高一心為國，說的都是大實話，他告訴趙高，自己一直想勸諫，但是陛下身居後宮不見大臣，沒有機會啊！
趙高馬上大包大攬的告訴李斯，我會在陛下不忙的時候通知李大人進宮麵聖。
李斯很感動，趙高很陰險。
李斯不知道，他正一步步走入趙高的圈套。
趙高專門挑二世玩的正爽的時候通知李斯來覲見，連續幾次，把二世徹底搞毛了，大發雷霆，罵道：我天天不忙的時候李斯不來，專門挑我忙的時候來打擾我，是不是看我年紀小，故意欺負我啊！
趙高馬上趁熱打鐵，告訴二世：李斯自認為在沙丘平台這件事情上立了大功，想讓陛下可以封他做王，沒有得逞所以對陛下非常不滿。我還聽說他兒子三川郡守李由，與關東那些盜賊經常聯係，勾勾搭搭，陰謀裏應外合對付陛下。
這個帽子夠大，二世立刻下令，由趙高全權做主，查查三川郡與盜賊勾結的情況。
李斯聽說趙高陷害自己，也顧不上撕破臉，馬上上書二世揭發趙高，他以田氏代齊的例子比喻趙高，指出趙高大權獨攬，欺上瞞下，誹謗大臣，有謀朝纂位的野心。
二世看到李斯的詔書以後非常不高興，他狠狠的罵了李斯一頓，告訴李斯趙高之所以被重用是因為他忠誠，有才華，努力，守信義，是皇上唯一可以依賴的人，以後不允許對趙高胡亂猜疑。
在二世眼裏，趙高是大秦的柱石。
不但如此，二世還把這件事情告訴了趙高。
趙高感動的淚流滿麵，馬上向二世表忠心，巴不得當場把心掏出來給二世看。
經過這件事情以後，二世更加信任趙高。
過了一段時間，關東盜賊愈演愈烈的消息傳來，滿朝文武大臣都非常擔心，丞相馮去疾，李斯，將軍馮劫一起規勸二世，希望可以減少兵役，水路交通的建設等浩大的工程，減輕徭役，收取民心，把更多的精力放到平亂上來。
二世龍顏大怒，以李斯之前的言論的駁斥了這次勸諫。在二世看來，天下之所以鬧成這樣就是因為這些大臣沒有盡心盡力，如今自己的工作沒有做好，反倒來說皇上的不是，簡直就是大逆不道。
君王一怒，血流成河。
馮去疾，李斯，馮劫被移交司法查辦。
馮去疾，馮劫受不得侮辱，憤憤自殺。
李斯沒有自殺，被關進大獄。二世命令趙高徹底調查李斯父子與盜賊勾結謀反的情況。
李斯的家人門客全部被逮捕，趙高派人把李斯往死裏打，李斯在堅持了1000大板以後屈打成招，認罪畫押。
為了給自己洗清冤屈，李斯在獄中下筆千言，給二世寫下了最後一道詔書，這便是前文提及的“獄中上書”
比起前兩篇，這道詔書短小精悍，李斯在文中采用反語的方式曆數自己七大罪狀，希望二世明察。
這七大罪狀分別為：
離間六國統一天下；
平定北疆南越；
提高大臣待遇；
建立社稷宗廟；
統一度量衡文字；
修建馳道；