荊軻坐定後，太子說：“如今秦國貪得無厭，野心十足，如果不把天下的土地全部占為己有，不使各諸侯全部成為自己的臣下，它是不會滿足的。燕國國小力弱，多次遭受兵禍，現在就算征發全國力量也不可能抵擋住秦軍。諸侯都屈服於秦國，沒有誰敢和燕國聯合。我私下考慮能得到天下最勇敢的人出使秦國，用重利引誘秦王，秦王貪圖這些厚禮，我們就一定能如願以償了。如果能劫持秦王，讓他歸還侵占的全部諸侯土地，就像當年曹沫劫持齊桓公那樣，那就更好了；如果秦王不答應，那就殺死他。秦國的大將在國外征戰，如果國內又發生大亂，那麼君臣必定會相互猜疑。趁這個機會諸侯就可以聯合起來，一定會擊破秦國。這是我最高的願望。但不知道把這個使命托付給誰，希望先生您給想個辦法。”
過了一會兒，荊軻才說：“這是國家大事，我才能低下，恐怕不能勝任。”太子上前叩頭，堅決請求荊軻不要推辭。荊軻這才答應下來。於是，太子尊荊軻為上卿，讓他住在上等的館舍，太子每天都前去問候。
之後，為了能接近秦王，荊軻又得到了樊於期的首級和燕國督亢的地圖。
太子丹見荊軻遲遲不動身，以為荊軻變了主意，就對他說：“日子不多了，荊卿還有意入秦嗎？請讓我先把秦舞陽派去吧！”
荊軻大怒道：“你催什麼？往而不返者，豎子也！我之所以停留幾天的緣故，是想等一個人一同赴秦。今太子以為我走得太遲了，那馬上就辭別吧！”於是出發。
太子以及知道這件事的賓客，都身穿白衣，頭戴白帽來為荊軻送行。到了易水岸邊，祭祀完路神，就要上路。這時，高漸離擊起了築樂，荊軻和著曲調唱起歌來：“風蕭蕭兮易水寒，壯士一去兮不複還！”表達了自己義無反顧的精神。接著樂音又變作慷慨激昂的羽聲，人們聽得虎目圓瞪，怒發衝冠。於是荊軻登上馬車飛馳而去。
至秦國都城鹹陽後，荊軻持送厚禮給秦王的寵臣蒙嘉。由蒙嘉進言：“燕王誠振怖大王之威，不敢舉兵以逆軍吏，願舉國為內臣比諸侯之列，給貢職如郡縣，而得奉守先王之宗廟。恐懼不敢自陳，斬樊於期之頭，及獻燕督亢之地圖，函封，燕王拜送於庭，使使以聞大王。唯大王命之。”
秦王聽後非常高興，乃朝服設九賓，在鹹陽宮朝堂上召見燕國使節。荊軻捧著裝了樊於期頭顱的盒子，秦舞陽捧著督亢的地圖，一步步走上秦國朝堂的台階。秦舞陽一見秦國朝堂的那種陣式，不由害怕得發起抖來，臉色蒼白，使秦國群臣大為驚詫。
荊軻隻得對秦王說道：“北方蠻夷粗野之人，從未見過如此大的場麵，未免有些害怕，請大王諒解。”秦王對荊軻說：“叫秦舞陽把地圖給你，你一個人上來吧。”
荊軻從秦舞陽手裏接過地圖，捧著木匣上去，獻給秦王政。秦王政打開木匣，果然是樊於期的頭顱。秦王政又叫荊軻拿地圖來。荊軻把一卷地圖慢慢打開，一一講解。當地圖打開到末端時，出現了一把匕首，於是荊軻右手拿起匕首，左手抓住了嬴政的袖子。秦王此時大驚，起身脫了荊軻，想將佩劍拔出，但劍太長，心裏又著急，劍沒有拔出來。荊軻向秦王撲來，秦王環柱逃避，荊軻緊追秦王。旁邊雖有許多官員，但是都手無寸鐵；而殿下的武士，按秦國的規定，沒有秦王召令是不準上殿的，官員中有個侍醫夏無且，急中生智，拿起手裏的藥袋對準荊軻扔了過去。荊軻用手一揚，那隻藥袋就飛到一邊去了。
最終，秦王在臣下“王負劍”的提醒下，才拔出佩劍斬斷荊軻左股，荊軻栽倒地上，勉強坐起，右手把匕首向嬴政擲去，擊中桐柱，射出火花。嬴政再用劍砍他，荊軻用手去接，五個手指應聲而落。荊軻自知大事未成，倚柱而笑，對嬴政說：“事所以不成功者，以欲生劫之，必得約契以報太子也。”此時，侍從的武士已經趕上殿來結果了荊軻的性命，而秦舞陽也被殿外的武士砍殺於朝堂的台階下。
事後秦王政大怒，命令大將王翦攻打燕國，幾年之後，燕國就滅亡了。