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神農本草經名例上藥一百二十種為君，主養命以順應上天，無毒，多服久服不傷人。欲輕身益氣、延年益壽者以上經為本。
中藥一百二十種為臣，主養性以順應人事，或無毒、或有毒，宜斟酌服用。欲遏病、滋補虛羸者以中經為本。
下藥一百二十五種為佐、使，主治病以順應土地，多毒，不可久服。欲除寒熱邪氣、破積鬱病者以下經為本。
三品共計三百六十五種，法三百六十五度，一度應一日，以成一年。把此數翻倍，合七百三十種。
藥中有君、臣、佐、使，以便互相支持、製約。通常適宜的配置是一君、二臣、三年、五使，又可一君、三臣、九佐使。
藥有陰陽配合、母子兄弟，根、莖、花、實、苗，皮、骨、肉。不同藥物之間，藥性不同，有宜單行者、相須者、相使者、相畏者、相惡者、相反者、相殺者。這七種情形，醫者要針對藥性，並合起來觀察。當用藥性相須、相使者，勿用藥性相惡、相反者。若藥物有毒但是適宜互相製約，則可用相畏、相殺者；若不是這樣，則不能合用。［時珍說藥有七情：獨行者，指單方，不需輔藥；相須者，指藥物是同類，不可分離，如人參、甘草，黃檗、知母之類；相使者，指主藥之佐使；相惡者，指藥物奪取彼此之能量；相畏者，指藥物受到彼此之製約；相反者，指兩不相合之藥；相殺者，指製約彼此之毒性。古方中多有用相惡、相反者。所以，相須、相使同用者，為用藥之帝道；相畏、相殺同用者，為用藥之王道；相惡、相反同用者，為用藥之霸道。
藥有酸、鹹、甘、苦、辛五味，又有寒、熱、溫、涼四氣，及有毒無毒。藥物是陰幹、曝幹，采、造的時月，生熟，出於何種土壤，藥物的真、偽、陳、新，各有方法。藥性有適宜製丸者，有適宜製散者，有適宜煎煮者，有適宜酒泡者，有適宜製膏者，也有兼宜以上各種製作方法者。凡此種種，皆要順從藥性，不得逾越。
欲治療疾病，必先了解它的根源，等候治病時機。若五髒未虛，六的未竭，血脈未亂，精神未散，那麼，服藥必活。
療寒用熱藥，療熱用寒藥，飲食不消用吐、下藥，鬼疰、蠱毒用毒藥，癰腫、瘡、瘤用瘡藥，風濕用風濕藥，根據各自病情選擇相宜的藥物。
病在胸膈以上者，宜先進食後服藥；病在心腹以下者，宜先服藥後進食。病在四肢血脈者，宜空腹且在白天服藥；病在骨髓者，宜飽食且在夜間服藥。
那些主要的大病，有中風、傷寒，寒熱、溫瘧，中惡霍亂，大腹水腫，腸澼下痢，大小便不通，奔豚上氣，咳逆、嘔吐，黃疸、消渴，留飲癖食，堅積、症瘕，驚悸、癲癇、鬼疰，喉痹、齒痛，耳聾、目盲，金瘡踒折，癰腫惡瘡，痔漏癭瘤；男子五勞、七傷，虛乏羸瘦；女子帶下崩中，血閉陰蝕；蟲蛇蠱毒所傷。此為大致病類，其間的變動枝葉，各宜依照端緒以用藥。
七方［岐伯說氣有多少，形有盛衰，治療有緩急，藥方有大小。又說，病情有遠近，症候有中外，治療有輕重。病情近者用奇方，病情遠者用偶方。發汗不用奇方，下瀉不用偶方。病情近則化偶方為奇方，劑量小而病除；病情遠則多用由奇方合成的偶方，需大劑量方能治愈。奇方不行則用偶方，偶方不行則從另外的角度考慮，所謂寒、熱、溫、涼，表現出的也許是與之相反的症候。［王冰說髒位有高下，腑氣有遠近，病症有表裏，藥用有輕重。單方為奇，複方為偶。心肺為近，肝腎為遠，脾胃居中。腸
胞膽，亦有遠近。唯有識見高遠者，能夠權衡利弊對症下藥。藥方與其重不如輕，與其毒不如善，與其大不如小。［時珍說對主要病症我們要進行正麵治療，對附加病症進行相反治療。比如，熱邪在下而上有寒邪，則以寒藥為主、熱藥為佐。服藥之後，熱氣既散，寒性也就消失了。寒邪在下而上有浮火，則以熱藥為主、寒藥為佐，服藥之後，寒氣既消，熱性也就散了。［完全說症候的改變在於病情，治病在於藥方，配製藥方在於醫生。方有七類：大、小、緩、急、奇、偶、複。配製藥方的主體，源於氣味。寒、熱、溫、涼，四氣生於天；酸、苦、辛、鹹、甘、淡，六味成於地。所以有形為味，無形為氣。氣為陽，味為陰。辛甘發散為陽，酸苦湧瀉為陰；鹹味湧瀉為陰，淡味滲泄為陽。或收或散，或緩或急，或燥或潤，或軟或堅，各隨髒腑的病症，而施行藥的品位，於是七方可成。所以，奇、偶、複方，是三種藥方的劑量的大小；大、小、緩、急方，是四種配製方法。故稱：治有緩急，方有大小。
大方［完全說身表為遠，裏為近。大小，是配製奇、偶方的方法。假如小承氣湯、調胃承氣湯，是奇方中的小方；大承氣湯、抵擋湯，是奇方中的大方，因為需要用它進攻裏麵的病症。［從正說病人兼有幾種病症，一二味藥就不適合；肝腎及下部的病症，必須采用大方。王太仆以心肺為近，肝腎為遠，脾胃為中。劉河間以身表為遠，身裏為近。他認為，身體一半以上有三分氣，為天。身體一半以下有三分氣，為地。中間為人。
小方［從正說小方有兩種：有一味主藥兩種從藥的小方，適合第一卷序列
於邪氣單一的疾病；有分成兩部分而多次服用的小方，適用於心、肺及上焦諸病。［完全說肝、腎位遠，治療它們的病必須劑量大而味數少，使其氣迅急下走；心、肺位近，要治療它們的病，必須劑量小而次數多，使其氣易散而上行。肺服九、心服七、脾服五、肝服三、腎服一，乃五髒生成之數。
理方［王冰說假如病在腎而心氣不足，服藥宜急過，不使氣味襲心，以免腎藥欺心，心力更衰。上、下、遠、近之病與此相同。［完全說聖人治上不犯下，治下不犯上，治中上下俱無犯。［好古說治上必妨下，治表必妨裏。用黃芩以治肺必妨脾，用肉蓯蓉以治腎必妨心，服幹薑以治中必僭上，服附子以補火必涸水。［從正說理方有五：有以甘甜延緩之方，如甘草、糖、蜜之類，病在胸膈，取其留戀；有以藥丸延緩之方，與湯散相比，其藥效遲慢；有味品眾多之理方，藥品眾多則相互拘製，不得各展其藥性；有無毒治病之理方，無毒則性純功緩；有氣味俱薄之理方，氣味薄則長於補上治上，及至蔓延到下部，藥力已衰。
急方［完全說味厚者為陰，味薄者為陰中之陽；所以，味厚可致使下泄，味薄則通氣。氣厚者為陽，氣薄者為陽中之陰；所以，氣厚則發熱，氣薄則發汗。［好古說治主病宜用理方，緩則治其本；治從病宜用急方，急則治其標。表、裏、汗、下，皆有所當緩、當急。［從正說急方有四：有急病急攻之急方，比如針對中風之類的疾病；有湯散蕩滌之急方，下咽易散而行速；有毒藥之急方，毒性能上湧下泄以減弱病勢；有氣味俱厚之急方，氣味俱厚，直趨於下而力不衰。
奇方［王冰說單方也。［從正說奇方有二：有獨用一藥之奇方，適宜於病在上而近者；有藥和陽數一、三、五、七、九之奇方，宜下泄不宜發汗。
偶方［從正說偶方有三：有兩味相配之偶方；有古之二方相合之偶方，古謂之複方，皆宜於病在下而遠者；有藥合陰數二、四、六、八、十之偶方，宜發汗不宜下泄。
複方［好古說複者，再也，重也。所謂十補一泄，數泄一補也。還有，傷寒見風脈，傷風得寒脈，為脈症不相應，亦以複方應對。［從正說複方有三：有二方、三方、數方相合之複方，如桂枝二越婢一湯、五積散之類；有本方之外另加別藥，如調胃承氣加連翹、薄荷、黃芩、梔子為涼膈散之類；有兩分均等之複方，如胃風湯各等分之類。
十劑［徐之才說藥有宣、通、補、泄、輕、重、澀、滑、燥、濕十種，是藥之大體，然而《神農本草經》沒有記錄，在那以後的人們也未作敘述。凡是用藥的人，必須詳細審查，則不會遺失。
宣劑［杲說外部感受了六淫之邪，欲傳入體內，脾實而不受，淫邪在胸中鬱積，天分氣分窒塞不通，而出現嘔吐症狀，這就是“壅”。故必破氣之藥，如薑、橘、藿香、半夏之類，瀉其壅塞。［經（即《神農本草經》，下同）說凡是癲癇中風、胸中諸實、咳痰寒結、胸中熱鬱，上而不下，久則咳嗽、氣喘、腹脹，生成了水腫之病，非宣劑不能治愈。
［完全說鬱積不散為壅，必須用適宜的方法散去，如痞滿不通之類。用藥攻其裏，則宣劑藥效上行，瀉劑藥效下行。湧劑即是瓜蒂、梔子之類。發汗通表亦同。［好古說經有五鬱，木鬱則透出它，火鬱則散發它，土鬱則削弱它，金鬱則下泄它，水鬱則折毀它，皆宣劑的功效。［時珍說壅即堵塞；宣即驅散、發散。鬱塞之病，不升不降，傳化失常。所以，氣鬱有餘，則用香附、撫芎之類引開，不足則需補中益氣。火鬱微則用山梔、青黛發散，甚則升陽解肌發汗。濕鬱微則用蒼術、白芷之類燥解，甚則用風藥偏勝。痰鬱微則用南星、橘皮之類化解，甚則用瓜蒂、藜蘆之類翻湧。血鬱微則以桃仁、紅花之類運行，甚則用吐、利之法疏導。食鬱微則用山楂、神曲消除，甚則用上湧下利之法減輕。這些都是宣劑。
通劑［從正說通即流通。大小便不通，宜用木通、海金沙、琥珀、大黃之類使其暢通。［時珍說滯即留滯。濕熱之邪留於氣分，形成痛痹癃閉者，宜用淡味之藥上助肺氣下降，通其小便，以泄氣中之滯，木通、豬苓之類就行。濕熱之邪留於血分，形成痹癰腫注、二便不通的，宜用苦寒之藥下引，通其前後，以泄血中之滯，防己之類就行。［經說味薄者通，故淡味之藥稱為通劑。
補劑［之才說補益之藥可去虛弱之症，人參、羊肉之類就是。［杲說人參甘溫，能補氣虛；羊肉甘熱，能補血虛。羊肉補形，人參補氣。凡氣味與二藥相同者，都是補劑。［從正說五髒各有藥劑補瀉，五味各補其對應的髒腑，虛症有表虛、裏虛、上虛、下虛、陰虛、陽虛、氣虛、血虛。［經說精不足者補味，形不足者補氣。五穀、五菜、五果、五肉，都是補養之物。［時珍說虛則補其根本。生薑之辛補肝，炒鹽之鹹補心，甘草之甘補脾，五味子之酸補肺，黃檗之苦補腎。又如，茯神之補心氣，生地黃之補心血；人參之補脾氣，白芍藥之補脾血；黃芪之補肺氣，阿膠之補肺血；杜仲之補腎氣，熟地黃之補腎血；芎之補
肝氣，當歸之補肝血之類，皆補劑。
泄劑［之才說泄劑可去閉塞之證，葶藶、大黃之類就是。［杲說葶藶苦寒，氣味俱厚，與大黃相比不差，能泄肺、大腸之閉。大黃性喜走而不是留守，能泄血閉時腸胃中的渣穢之物。一泄氣閉利小便，一泄血閉利大便。凡氣味與二藥相同者，都是泄劑。［從正說實則泄之。芒硝、大黃、牽牛、甘遂、巴豆之類，都是泄劑。［時珍說去閉症就第一卷序列
是去實，即去火。肝火鬱積則泄以芍藥之酸，心火鬱積則泄以甘草之甘，脾火鬱積則泄以黃連之苦，肺火鬱積則泄以石膏之辛，腎火鬱積則泄以澤瀉之鹹。
輕劑［從正說風寒之邪，開始時寓居在皮膚，頭痛身熱，宜解體表之邪。癰、瘡、疥、痤，俱適宜解表之法，以發汗藥泄，以毒煙熏，皆為輕劑的功用。凡熏、洗、蒸、炙，熨、烙、刺、砭，導、引、按、摩，皆表汗之法。［時珍說輕劑可解除閉塞。閉有表閉裏閉，上閉下閉。表閉者，風寒傷身，腠理閉密，陽氣鬱積，不能外出，表現為發熱、惡寒、頭痛、脊寒等病，適宜以輕揚之劑發汗，而表自解。裏閉者，火熱抑鬱，津液不行，皮膚幹閉，表現為肌熱、煩熱、頭痛、目腫、昏瞀、瘡瘍等病，適宜以輕揚之劑清爽肌肉，而火自散。上閉有二：一則外寒內熱，上焦氣閉，表現為咽喉閉痛之證，適宜以清涼之劑揚散，則閉自開；一則飲食寒冷抑遏陽氣在下，表現為胸膈痞滿閉塞之證，適宜揚其清而抑其濁，則痞自泰。下閉亦有二：一則陽氣陷下，表現為裏急後重，數至廁而不行之證，隻需升其陽而大便自順，即所謂下者舉之；一則燥熱傷肺，金氣鬱積，竅閉於上，而下閉膀胱，表現為小便不利之證，適宜以升麻之類探吐，上竅通而小便自利，即所謂病在下而取之上。
重劑［從正說重即鎮縋之義。怯則氣浮，如喪神守，而驚悸氣上，朱砂、水銀、沉香、黃丹、寒水石之類，皆為重劑。久病咳嗽，涎潮上湧，身體瘦弱不堪者，鎮以重劑。［時珍說重劑有四：有驚則氣亂，魂氣飛揚，如喪神守者；有怒則氣逆，肝火激烈，病狂善怒者，並以鐵粉、雄黃之類平其肝；有神不守舍，多驚健忘，迷惑不寧者，宜以朱砂、紫石英之類鎮其心；有恐則氣下，精誌失守，如人將捕者，宜以磁石、沉香之類安其腎。大概由於重劑壓浮火而墜痰涎，不隻治怯之故。故諸風掉眩及驚癇痰喘，吐逆不止及反胃之病，皆因浮火痰涎為害，俱宜鎮以重劑。
滑劑［完全說澀則氣著，必須利以滑劑，滑能養竅。［從正說大便燥結，宜用麻仁、鬱李之類；小便淋漓，宜用葵子、滑石之類。［時珍說著，即有形之邪留著於經絡髒腑之間，表現為尿濁滯、痰涎、胞胎、癰腫之類，皆宜以滑藥引去留著之物。大便澀者，用菠薐、牽牛之類；小便澀者，用車前、榆皮之類；精密澀者，用黃檗、葵花之類；胞胎澀者，用黃葵子、王不留行之類；引痰涎自小便去者，則用半夏、茯苓之類；引瘡毒自小便去者，則用五葉藤、萱草根之類。以上種種，皆為滑劑。
澀劑［完全說滑則氣脫，如開腸洞泄、便溺遺失之類，必以澀劑收斂。［從正說寢汗不禁，難以麻黃根、防風。滑泄不止，難以豆蔻、枯礬、木賊、罌粟殼。喘咳上奔，難以烏梅、訶子。凡酸味近幹澀者，即收斂之意。［時珍說脫，有氣脫、血脫、精脫、神脫。脫則散而不收，故用酸澀溫平之藥，以斂其耗散。汗出亡陽，精滑不禁，瀉痢不止，大便不固，小便自遺，久嗽亡津，皆為氣脫。下血不已，崩中暴下，諸大亡血，皆為血脫。牡蠣、龍骨、海螵蛸、五倍子、五味子、烏梅、榴皮、訶黎勒、罌粟殼、蓮房、棕灰、赤石脂、麻黃根之類，皆澀藥。氣脫兼以氣藥，血脫兼以血藥和氣藥，氣為血之統帥。脫陽者見鬼，脫陰者目盲，此為神脫，這就不是澀藥所能收的了。