俄國應該念及兩國友好之邦的關係，既然稱兩國之間關係親密，應該在修築鐵路之時即考慮到兩國的利益，而非一國之私利”。恩澤還稱：“俄國狡猾殘忍，各國都對之頗為忌諱。作為一個大國，俄國常常以欺詐的形式侵略他國，很少以武力的方式攻取。”對此，以恩澤為首的東北地方官打算自築鐵路，以防止俄國修築向南的鐵路支線。1897年10月，依克唐阿、延茂和恩澤會奏請勘定吉林至奉天的鐵路，“預防俄路分枝南侵，以保利權而弭後患”。軍機處奉旨批示曰：“著照所請。”不久膠州灣事件爆發，這一旨在限製俄方擴張的建議也就無形中被擱置了。
回頭考察恩澤對《中俄密約》的抵製，以及提出修築吉林至奉天的鐵路的建議，可以大致發現恩澤在此期間思想經曆的波折。光緒九年（1889年），恩澤移職吉林，對東北邊境情況始有關注，尤其對俄國的動態持續保持警惕。可以說，恩澤對俄國早有戒心，他對清政府的“聯俄政策”從一開始就不像一般朝野輿論那樣抱有樂觀態度。
恩澤初任黑龍江將軍積極招墾荒地之時，即對俄國睥睨四鄰的野心異誌擁有更為直觀的感觸。其時，對於東北荒地的處理，清廷盡管表麵封禁，但在實際上卻處於弛禁狀態，對此既成事實清廷毫無作為，獨呼奈何。清廷的這一態度，直接導致占有大部分土地的蒙古貴族、旗主因利益驅動將土地轉租、甚至轉賣給俄國。恩澤接任黑龍江將軍一職後，對俄國對中國東北土地覬覦之心始有警惕，並隨即對東北荒地招墾現狀作細致考察，上奏懇請清廷實施弛禁政策。獲允後，恩澤立即詳擬墾荒章程。對將荒地租賃俄國之行為嚴令製止，並予以重罰。當恩澤得知《中俄密約》簽訂後，恩澤對俄國的惡感更為深刻，他強烈呼籲清廷切勿受俄國蒙騙。據此可以觀察到，就恩澤的思想理路而言，伴隨著俄國的鐵路延伸至中國境內，他對俄國的警惕已演變為隨時做好作戰準備的警備姿態。
其時，恩澤實業救國的理想在修築鐵路建議中得以彰顯。恩澤深受儒家文化的熏陶，尤其對桐城派散文情有獨鍾。桐城派文章主雅，講究起承轉合，投射到為人處世上與儒家的中庸結合頗為緊密。然而，恩澤還是一位詩人，熱衷於高適的慷慨激昂。究其二者之間的本質關係，隔閡遠遠大於融合。因此，恩澤逐漸走向“師夷長技以製夷”，受洋務運動的影響是一方麵，另外與自身的文化修為及遠大政治抱負也有很大關係。
二、訓練鎮邊軍
鎮邊軍是清代黑龍江曆史上繼前期八旗之後素質較好、戰鬥力較強的一支軍隊。它是對八旗的改造，雖來源於八旗，卻沒有清末八旗製度那樣衰敗。這支軍隊的最初的統帥為黑龍江將軍依克唐阿。中日甲午戰爭中，鎮邊軍以其勇猛頑強的浴血奮戰，為黑龍江人民爭得了光榮和驕傲。但天不憐見，由於甲午戰爭中清廷的整體上的弱勢，加以依克唐阿指揮不力，鎮邊軍也蒙受了“逃兵”的恥辱。
甲午戰爭以後，朝廷諭令鎮邊軍回防黑龍江。光緒二十一年（1895年）十二月，清廷將依克唐阿遣撤的鎮邊軍八營交由恩澤督辦操練。
對於一個曾經馳騁疆場的武將而言，這可謂是天降祥瑞。事實上，在恩澤的腦海裏，一直有這樣一個畫麵：有朝一日，率領親自操練的軍隊，給日俄軍隊以致命一擊。從後來發展的情形來看，清廷的此種安排，與其說是給了恩澤一個實現夢想的機會，毋寧說亦給了鎮邊軍一個振興的契機。
恩澤總結甲午戰爭失敗原因時就曾直言：平壤一役，清軍與日軍武力差距不大，清軍卻節節敗退；日軍偷渡鴨綠江後，宋慶3萬大軍三天內潰不成軍。何以至此？武器裝備落後於日本，固是重要原因，然則軍事策略陳舊卻是根本原因。基於此，恩澤身為鎮守黑龍江等處地方將軍，督辦黑龍江鎮邊軍事宜，非常重視邊防軍的操練，先後上疏請改練洋操。
除演習行軍陣法之外，又演習真行軍陣，並教演修築隱身掩體。馬隊則演習馬上分合聚散、層疊包抄衝鋒、過溝橋之類，以及馬下騰躍、馬上隱伏擊刺各項技藝。他對練兵之法，特別注意思想鍛煉，主張“陣技既已精熟勤練”。“勢須先練其心，更煉其膽。然心膽之勇怯，非久曆危險之境實未易呈露。”舉出“甲午一役，舉無數快槍、快炮，竟不能以一戰，實因承平過久，皆以軍事為兒戲，鄙武夫而弄文墨，既無忠愛憤發之憂，又無深固不搖之氣，一聞真戰，心目先逃，幾何而不敗。”認為是更要接受的教訓。
光緒二十二年（1896年）三月，恩澤奏請“變通營製”，“分為中左右三路。擇要水陸分防。”清廷準奏。光緒二十五年（1899年）八月二十日恩澤又奏：“查江省鎮邊一軍，舊有馬隊五起、步隊九營、炮隊一營。以馬隊五起歸一統領，以步隊九營分為中左右三路，委三統領。去冬因鐵路事棘，兵力過單，不敷分布，奏奉諭允，添募馬隊兩營、步隊四營。又以一馬二步為一路，作為前後兩路，委兩統領。先鎮邊軍後均係八成隊額，計共馬步炮二十一營。”顯然，以炮營取代水師營，有利於鎮邊軍提高戰鬥力；三處駐守變成五路設防，更是加強了戰略控製網絡。
隨後，恩澤經清廷諭準，命令募勇16營，成立鎮邊新軍，兵源主要是各城八旗西丹及鄂倫春族青壯。麵對新的形勢，恩澤等對黑龍江省重新進行了軍事布防：鎮邊軍左路初駐璦琿，後改駐通肯、呼蘭、綏化一線；後路駐嫩江源；前路駐呼倫貝爾、西大嶺；中、右路駐齊齊哈爾、呼蘭、綏化，後改呼、綏防軍向東南沿鬆花江防守。鎮邊新軍實際招募15營2哨，分5路設防：中路守璦琿，前路守鬆花江口及都魯河、湯旺河一帶，左路守黑龍江下遊孫別拉、觀音山一帶，右路守黑龍江上遊法別拉、漠河一帶，後路守“城西西山兼分防城北瀕江黑河屯一帶”。
由於恩澤訓練鎮邊軍和鎮邊新軍一意師法西洋，清廷對此頗為顧慮。光緒二十五年（1899年）九月，清廷諭令：“西洋的操練方法固然有可取之處，但是中國的法度怎麼能全部廢除，無論是哪一種操練的方法，總的來說，技精膽壯頗為重要，惟其如此，才能製勝。希望能破除成見，悉心訓練為要。”
盡管如此，恩澤不為所動，仍然按照既定方略，積極地加緊訓練，以期速成。
光緒二十六（1900年）年六月，沙俄侵略軍大舉進犯東三省。深受恩澤器重且為其保舉的時任黑龍江將軍壽山，率領鎮邊軍、鎮邊新軍與黑龍江各族人民奮起抵抗。在璦琿方向，鎮邊新軍後、右、中、左路軍與黑龍江城八旗兵並肩抗敵，先後激戰於黑河屯、卡倫山、璦琿城、匡安嶺、北大嶺等地，給予俄軍沉重打擊；於呼倫貝爾地方，鎮邊軍中、前、後路軍聯合義勝軍，在呼倫貝爾、西大嶺一帶，與敵人周旋達半個月，許多愛國將領在這場悲壯的反侵略戰爭中血染疆場，英勇捐軀。據光緒三十一年(1905年)統計，二十六年七八月間僅各地陣亡的官佐：北興安嶺鎮邊新軍7人；呼蘭河口鎮邊軍7人；呼倫貝爾鎮邊軍2人；黑龍江城八旗及鎮邊新軍5人；西路小橋子鎮邊軍10人；二龍、博爾多屯鎮邊新軍2人；呼蘭鎮邊軍2人；西興安嶺鎮邊軍、義勝軍15人；觀音山鎮邊新軍2人；汪啟河口鎮邊新軍2人。鎮邊軍與鎮邊新軍一道為保衛祖國邊陲作出了較大的貢獻。
三、籌辦民團與造械並舉
恩澤在加緊操練新軍的同時，審時度勢地籌辦保甲、團練。光緒二十五年三月，恩澤奏報朝廷，稱保甲團練，業已開始舉辦。隨後，恩澤一麵嚴定④章程，一麵先從省城辦起，以十家為一牌，設牌首一人；五牌為一甲，設甲長一人；兩甲為一團，設正、副團總二人；五團為一路，設正、副路總二人。
至於其訓練方法，恩澤規定，每逢舊曆初一、十五，由路、團總以下諸人集練一次，責成附近駐防軍隨時督查操練諸法，加意梭巡，不容間斷，其旨在以駐防軍與團練相表裏，既以團練彌駐防軍之不足，亦以駐防軍助團練之勢、督團練之成，達到呼應靈通，相互為用。
為加強對保甲團練的管理，恩澤還於省內設保甲局（後改由將軍衙門兵司管理），主管其事。迨至五年，全省除呼倫貝爾及布特哈所屬各旗外，各地保甲團練之籌辦業已粗具規模，堪為可用。
此外，黑龍江由於添練鎮邊新軍，軍火需要日益急迫。恩澤考慮軍火製造乃軍中要務，如不儲備於平日，或難應付於臨時。然而，黑龍江省向無專門製造軍火的部門，原來所需，皆由吉林機械局兼造。如一旦發生事端，便有緩不濟急之虞。於是，恩澤奏請朝廷，要求仿照奉、吉兩省設局製造軍火的成案，選派妥員在黑龍江城擇地設立專局，督飭按實際需求製造，“以廣邊備而利操防”。清廷對此奏議給予了批準，這在一定程度上可以滿足邊疆的防禦需求。