同時，省領導和有關部門還開展了重點調查和暗訪，掌握全省農村稅費改革總體情況，及時發現和糾正存在的問題。連續3年進行的全省性、多層次的督查工作，為改革試點的順利進行和實現預期目標，發揮了很好的監督檢查和保駕護航作用。
農村稅費改革是一項綜合性改革，涉及麵廣，必須適時啟動配套改革，整體推進，否則，單單改革農業稅製、稅率降低幾個點，減輕農民負擔很難保持長久。安徽省不失時機地推進了與主體改革相互促進，相得益彰的鄉鎮機構改革、村級改革、農村義務教育改革和縣鄉財政體製改革等相關配套改革，使改革整體效應得以充分發揮。
首先，鄉鎮機構改革的成敗直接影響農村稅費改革的成效。從2000年下半年到2001年底，全省基本完成鄉鎮機構改革，做到機構精簡到位，人員精簡、定崗到位，用人機製轉換到位，政府職能轉換到位。這為順利推進農村稅費改革打下了堅實的基礎。在鄉鎮機構改革順利推進中，財力支持是關鍵。在中央財政轉移支付的支持下，省財政盡最大努力，千方百計增加對鄉鎮的轉移支付和專項補助資金。部分市、縣也擠出資金對鄉鎮給予補助，基本彌補了鄉鎮因農村稅費改革而形成的財力缺口，保證了鄉鎮正常運轉的基本經費需要。整個改革中，中央對安徽省的財政轉移支付規模達到33億元，省對縣、鄉、村安排的稅費改革轉移支付和補助資金規模達41.2億元，其中，對縣鄉轉移支付31.9億元，對村級的補助9.3億元。實踐證明，財政為深化農村稅費改革、鞏固改革成果提供了經濟基礎；在財力的支持下，農村各項配套改革順利推行，不僅大幅度減輕了農民負擔，而且花錢“換”來了一個農村公共服務由財政供給、城鄉二元結構逐步消除的新局麵。這既是曆史發展的必然，也是公共財政的應有之義。
其次，不斷建立和完善以縣為主的農村義務教育管理體製，調整農村中小學教育布局，堅持把農村稅費改革與促進農村義務教育健康發展緊密結合起來，在財政預算和上級轉移支付資金中優先安排農村義務教育經費，確保經費投入不低於稅費改革前的水平，並做到逐年有所增加。2001年，全省農村義務教育經費總投入達55.94億元，比2000年增長22％。從2001年9月起，在對11個縣試點的基礎上，全省實行農村中小學教師工資上劃到縣統一管理和發放。
第三，開展村級改革，並村並組，擴大村組規模，增加村級收入，減少支出。嚴格控製村幹部數額，實行交叉任職。加強村級管理，實行村務公開，成立村民民主理財小組。對農業兩稅附加收入較少、運轉困難的村，由各級財政予以補助，幫助解決村組幹部報酬、五保戶供養和村級運轉必不可少的經費需要。
第四，通過清理整頓，建章立製，公開政策，規範程序，明確責任，嚴肅紀律，加強農民負擔監督管理，實行農民負擔監督卡等製度，初步建立了確保農民負擔長期穩定不反彈的有效監管機製。
改革步伐在不懈努力中前行
農村稅費改革在中國改革史、財政史上是破天荒的，對財政分配政策、支出政策的調整產生了深遠影響。現在看來，這場改革不僅僅是解決了農民減負、規範征繳行為和緩解幹群關係問題，而且正是由於在改革中不斷暴露出了一些深層次的矛盾和問題，才有了後來的公共財政體製改革、鄉鎮機構改革以及其他一係列配套改革。也正是由於農村稅費改革的深入，才打破了曆代農民不享受再分配的曆史。回頭看，沒有農村稅費改革，公共財政的陽光不可能這麼快地普照到農民頭上，不可能有現在的穩定局麵。可以說，改革達到了以下幾個目標：
實現了“三個滿意”目標
安徽的農村稅費改革試點，基本實現了溫家寶在安徽農村稅費改革試點動員大會上提出的“把農村稅費改革這件大事辦好，讓農民滿意、讓基層幹部滿意、讓中央滿意”的目標要求。
減負政策到位，農民滿意。2000年改革當年，全省農民政策性負擔減輕幅度為31％；2001年，農民負擔繼續下調，減負幅度達35.6％；2002年，減負幅度達37.5％；到2005年我省全麵取消農業稅，全省共減輕農民政策性負擔54.5億元，人均減負109.4元，畝均減負93.8元。廣大農民在這場改革中得到了實實在在的好處，衷心支持和擁護改革。
職能轉變到位，基層幹部滿意。通過改革，把基層幹部從要錢、要糧的繁雜事務和幹群關係緊張的工作環境中解脫出來，使基層幹部能夠集中精力抓發展、促改革，為農民辦實事、解難事，更好地履行基層政府的社會管理和公共服務職能。同時，農村稅費改革把鄉村運轉作為農村稅費改革“三個確保目標”的重要內容之一，采取精簡鄉鎮機構人員、完善縣鄉財政體製、加大對鄉鎮財政轉移支付力度、提高村級補助標準等一係列措施，保障了鄉鎮和村級組織運轉，不僅保證了鄉村幹部工資正常發放，還消化了曆年欠發的工資，基層幹部在改革中得到實惠，因此，積極理解和支持改革，主動參與和推動改革。