在南北戰爭期間，《紐約時報》刊登了一係列反映戰爭的文章，其中有一篇報導披露了皮爾龐特采用不正當手段，欺騙弗吉尼亞山義勇軍隊長弗萊蒙特，慫恿他購買霍爾步槍以解決槍支彈藥的不足問題，並獲得了不義之財。這次事件極大的損害了皮爾龐特的名譽，也給他的一生造成了永遠抹不掉的汙點。
美國南北戰爭爆發後，槍支、彈藥、糧食等物資十分短缺，於是美國所有的商人都認為這是一個極好的賺錢機會，投機商們自然也不利外。當時，在華盛頓陸軍總部槍械倉庫已經發黴腐爛的木箱中，有5000支老式的霍爾步槍，由於年代久遠，這些槍已無法使用。有個叫亞瑟·伊士曼的商人看中這是個賺錢的好機會，就和陸軍部定好了合同，約定90天後以每支3，5美元的價格用現金買下這批步槍。訂好合同後，亞瑟·伊士曼便到處兜售這批槍支，後來，他將這張合同轉給了紐約的一個投機家——賽門·史蒂文斯，雙方約定的價格是每支11，5美元。史蒂文斯聯絡到了最後的買家約翰·c·弗萊蒙特少將——剛剛成立但還沒來得及組建的西部軍隊司令，這是一個比任何軍官都熱衷於尋找武器的人。因此，協議很快達成了，史蒂文斯以每隻22，5美元的價格向美國軍隊提供了5000支卡賓槍16。而這時那些槍還在陸軍部的島嶼上，原封不動的裝在箱子裏，也就是說，北方軍隊以1，75萬元賣出這批槍後，又要以11萬元的價格把稍加改裝的槍買回來。
對投機者而言，這無疑是一筆利潤豐厚的買賣，而當務之急就是需要湊足一筆錢把槍買回來改裝。而錢從哪裏來呢，史蒂文斯想到了年輕的銀行家皮爾龐特。
皮爾龐特那時還很年輕，他很為自己能夠洞察別人品質的能力而自豪，但同時他也缺乏謹慎的經驗。史蒂文斯向摩根要求貸款2萬美元，並解釋說有個機會買到一批政府不想要的步槍，但缺乏資金。這是事實，但他同時掩蓋了再將這批槍賣給政府的真相。在這個容易賺錢、風險又小的“機會”到來時，皮爾龐特很難再保持警惕，而且史蒂文斯還以步槍作為抵押，並保證從第一期收入中償還借款，於是，皮爾龐特就貸給了史蒂文斯2萬美元，並收取了7%的利息，外加5400美元的代理費。至此，皮爾龐特在不知道內情的情況下，就已被卷進了一場肮髒的交易。而在他發現這其中的細節之後，他果斷地停止了提供新的貸款，並從軍隊付給史蒂文斯的第一筆款項中扣出了他的所得26343，54美元。
後來，這筆交易作為典型，受到了專門成立的特別委員會的調查，皮爾龐特因為提供了貸款和支票被牽扯其中。經過訴訟和調查，最後特別調查委員會作出如下報告：
“摩根商行所付的槍支訂金沒有強有力的證明來說明它是合法的。摩根在聽證會上拒絕說明他是怎樣根據史蒂文斯和弗萊蒙特少將所訂的合同來支付訂金的。因此，對於摩根商行所一再聲稱的所謂霍爾步槍事件是一件合法的交易的說法，本委員會實難表示讚同。
現在，我們國家正麵臨著前所未有的嚴重考驗，我們每個人都應該以國家整體利益為重。摩根先生聲稱自己是一個良好的市民，對於這一點，我們很不讚同。在這方麵，我們為什麼不學學法國呢？在法國，每當一座橋梁、紀念堂或其它公共建築物完工，總要在上麵刻上‘法國市民的職責’，以此來提醒法國人的愛國民族心，而現在我國公民的這種政治上的道德就很缺乏了……”
此時的摩根雖然隻有26歲，但已經成為華爾街冉冉升起的一顆新星，他目光敏銳而不缺乏膽量，行事果斷而有魄力。但無法改變的是，年輕的摩根，已經被這則醜聞否定了他身為“市民”的“責任”。
5，事業的穩步發展
雖然黃金投機使皮爾龐特獲得了極大成功，他的敏銳洞察力和市場分析能力也受到了父親的讚賞，但是，j·s·摩根也客觀的認識到皮爾龐特缺乏耐心，而且容易心浮氣躁。他認為如果皮爾龐特的合作夥伴能換成一個作風穩健、經驗豐富的管理者的話，將會對他有更大的幫助，這一點得到了皮爾龐特的共識。
於是，在這次黃金投機之後，皮爾龐特解散了他的公司——摩根商行，並很快重組了新公司，進一步擴大了規模。新加入公司的是他以前的同事——鄧肯商行的查爾斯·達布尼及其表弟古特溫。新公司也由此改名為達布尼·摩根商行，代表倫敦皮鮑狄公司在美國的利益。在公司中，皮爾龐特牢牢掌握著對倫敦關係的大權，雖然名字排在了達布尼之後，但地位並不比他低。新成立的公司不再從事黃金投機，主要是處理倫敦皮鮑狄公司在美國的業務，做公債和其它債券生意。
這一時期，皮爾龐特在生活上也有了很大的改變。1866年，皮爾龐特與法蘭西絲·崔西結婚，同年生下了長女露易莎。1867年法蘭西絲又為皮爾龐特生下了唯一的兒子小j·p·摩根，即傑克。小摩根後來繼承父業，掌管了摩根商行，並將父親留下的基業進一步擴展。第一次世界大戰（1914~1918年）中，他因從事美國政府公債的銷售而名聲大振，後來因接受哈洛德·斯坦利等人的加入而將公司名稱改為“摩根·斯坦利商行”。