金鹿號挺過風暴後仍按計劃向北航行，11月底，進泊南緯43度一帶的奇洛埃島。島上的印第安一阿勞堪人係不堪忍受西班牙人的暴行從大陸逃來的，他們因而仇視歐洲白人。當德雷克帶人上岸時，他們攆走了英國人，並打死了其中的兩個。德雷克隻得離開此地，繼續北上，在奇洛埃以北的智利海岸，英國人則受到印第安人的友好接待，並得到一位領水員的幫助，於是他們順利到達了南緯33度的瓦爾帕萊索港口城市。可是那兩艘失散的英國船並未按約來此會合（一艘回國，一艘失事）。英國海盜大肆搶劫了這座西班牙移民城市，並奪取了一艘泊在港中的載著酒和黃金的西班牙船。
德雷克繼續向北航行，並通過實地探察“割去了”西班牙人在地圖上向西多畫出的10萬平方公裏的智利西海岸土地，因為這些土地實際上並不存在，或者是西班牙人故意這樣畫的。這樣他便取得了遠航以來的第二項地理發現。德雷克航行之後，南美洲的輪廓在歐洲出版的地圖上便與今天人們在地圖上所看到的差不多了。此後，英國人在南緯27.5度的拜雅-薩拉大（Баия-Салада）港灣停留了一個月，維修船舶，等候失散的同伴。
金鹿號駛過南回歸線後，搶劫了一些西屬港口。其中在卡亞俄港（今秘魯利馬）的一次幹得最得意。港裏停有30艘西班牙船，其中幾艘是軍艦。德雷克竟把金鹿號開進港灣，在敵船中蒙混了一夜，並刺探到明天有船要駛往巴拿馬。第二天早上金鹿號出港，追上這樣一艘西班牙船。經過接舷跳幫戰鬥後占領了該船，繳獲了許多寶石，13箱銀幣，80鎊黃金和26袋銀錠。
在美洲西海岸頻頻得手的金鹿號可以返航，“滿載而歸”了。德雷克推測，原路返回十分危險，損失慘重的西班牙人很可能在麥哲倫海峽一帶等候著他（事實上也的確如此）。於是這個慣於冒險的冒險家決定探一次險，北上穿越西北通道，環繞美洲大陸，東渡大西洋回國。盡管此時歐亞之間的西北通道尚未打通並暫時也打通不了，但英國、西歐的一些人認為已經開通或接近開通了。德雷克認為自己要做的工作便是沿著美洲西海岸北上找到西北通道的西部人口，即推測中的阿尼安海峽，這樣使可進入北方洋，繞過北美回到大西洋了。德雷克從反方向探索西北航路的設想和實踐在探險史上也有一定的意義。金鹿號於是沿美洲太平洋海岸北上，沿途又在尼加拉瓜、墨西哥海岸外搶劫了西班牙人幾次，其中包括大貴族唐·劄拉特的財物。到達北緯42度後，下起了大雪，天氣越來越冷，船上滴水成冰，風暴迭起，到處大霧彌漫。隨船牧師弗萊徹寫道：“這個時節正值6月和7月間……海岸線一直向西北偏移，似乎朝著與亞洲大陸相接的地方延伸……我們在任何地方都沒有見到有海峽的跡象……。這時，我們決定返回溫帶的緯度線上，因為我們現在置身於48度線附近。”這就是說，德雷克他們已到達了今加拿大溫哥華地區。