第奧古原想能在馬林迪與船隊會合，於是他們繼續向北航駛，可是中途偏離了航線，最後大約在馬嘎多克索（Magadoxo）地區看見了非洲海岸。他們然後沿海岸繞過了瓜達富伊角（Guardafui），向西行駛了900公裏，到達了索馬裏北部、亞丁灣南部的柏培拉港口城市。所以就歐洲人來說，他們還首次了解了索馬裏海岸和亞丁灣南部海岸。大部分海員這時已染上了壞血病，第奧古把幾十個重病號送上岸，安排在一個阿拉伯人的鎮子裏，並留下十幾個人照顧他們。船上隻剩下四十來人，其中一半也是病號。當地阿拉伯人襲擊殺死了上岸的全部葡萄牙人（約60人，因每船乘員約百人），並乘小船進行偷襲，企圖奪取停在港口的葡萄牙大船。船上的海員用火槍打退了阿拉伯人的進攻。這是又一起由阿拉伯人挑起的流血事件。第奧古決定迅速返回葡萄牙，途中他們又因病損失了25人。這艘船沒有運回什麼有價值的貨物，然而卻給歐洲帶回了馬達加斯加島和索馬裏海岸的第一手資料。
航海世家迪亞士家族在大航海和地理發現時代出了幾位著名人物。迪尼斯·迪亞士曾於1445年發現了塞內加爾河口，佛得角和戈雷島；巴托羅繆·迪亞士於1487年發現了好望角，繞過了非洲最南端；第奧古·迪亞士這次又發現了非洲第一大島馬達加斯加；兄弟倆的孫輩鮑洛·迪亞士（Paolo）於1560年率船隊到達安哥拉寬紮河口。鮑洛溯河而上60裏格，同與葡萄牙結盟的當地統治者會合，助他平“叛”。鮑洛還在巴西探險殖民過。1574年鮑洛又率船隊去安哥拉，修建了羅安達港，它後來成為安哥拉的首都和最大港口。後來鮑洛率軍在寬劄河（Kwanza）流域和盧卡拉河（Lukala）流域進行殖民戰爭，最後死於戰場。
1502年意大利地圖學家坎丁諾繪製了新的世界地圖。該圖長2.2米，寬1米，用羊皮並加彩著色，保存至今。坎丁諾把馬達加斯加島首次完全正確地畫在了地圖上。在以後的10年期間，葡萄牙人探察了馬達加斯加島的幾乎全部海岸及其沿海水域。
綜上所述，1500-1501年的葡萄牙人二航印度意義比較重大。這次遠航確切地發現了巴西，開始了對南美大陸的發現進程；發現了非洲第一、世界第四的大島，59.5萬平方公裏的馬達加斯加；開辟了從非洲最西部到美洲最東部橫渡大西洋最短的新航線。同時它還是迄當時為止最遠的一次遠洋航行，他們連續橫渡了大西洋、印度洋，經過到達了歐、非、美、亞四大洲，從而把這四大洲的部分地區聯係起來。從此以後，葡萄牙人、歐洲人在印度洋上的活動、乃至循此新航路進入太平洋的活動都主要是擴張、征服、海盜、通商性質，不再有什麼重大的地理發現和探險考察了。