在解放初期的這次整修中，寺主關符清達喇嘛用力尤多，應用器物，像設莊嚴，多所補充，其設備之齊全，增飾之煌麗，為當時西安諸寺之冠。
直到此時，康熙禦製碑及碑亭仍存；康熙於禦製碑銘之後所賜“慈雲西蔭”禦匾仍存，懸掛於大佛殿殿門上；慈禧太後“西狩”時所題“法相莊嚴”匾額猶存，懸掛於二殿殿門上方；康有為所題“莊嚴佛土”匾額猶存，懸掛於一進院西偏殿殿門上方。據記還有乾隆帝所題“佛教聖地”禦匾留存。其它如唐代石雕佛蓮座、東院行宮中的楠木龍床、宮燈和自西郊崇聖寺（即金勝寺）移來之漢白玉蓮花甕亦存。
“文革”中，在“破除四舊”的呼嘯聲中，宗教領域尤其成為重災區，廣仁寺在劫難逃，受到了其有史以來最嚴重的破壞。首先是寺內文物被洗劫一空。藏文《甘珠爾》藏經被燒毀；漢文大藏經已被送往造紙廠，後被市文管所有關人員發現拉回保管而幸存至今；包括一尊二米多的唐代銅質綠度母像和一尊北魏石佛像在內的寺中全部佛像或被毀、或被遷移他處；二張楠木床和三十餘對楠木宮燈亦流落他處；萬年燈及八角燈亭、碑亭和山門被拆除、碑石被推倒，寺中喇嘛6人全被趕到工廠、農村勞動改造。其中，寺院住持關符清達喇嘛被送到西安市北大街一車廂廠勞動，並於1971年病故於該廠；楊宗仁喇嘛被送到蒲城縣某公社山西大隊勞動；龔明勤喇嘛被送到長安縣東大公社勞動；田玉珍喇嘛、和森林喇嘛、王靜維喇嘛被送到終南山山根的靈感寺教養院勞動。寺中喇嘛被掃地出門之後，蓮湖區武裝部和人防部在原山門以南蓋起了兩幢樓房和數十間平房，寺內殿、堂、廂房、僧寮被上述單位占為作家屬宿舍；東偏院的齋堂、馬廄、磨房、菜地總麵積達十五、六畝地全被圍巾廠占用。以上占用全是無償的，沒有得到寺僧允許。
“文革”延續了十年，廣仁寺的劫難也延續了十年，這隻是就災難的結束而言；如果就醫治這次災難所造成的創傷，就要不折不扣地落實黨的宗教政策；退還寺產而言，則直至今日仍有許多問題有待解決。“文革”以後的政策落實，首先的問題是讓被趕離寺的喇嘛回歸。1978年，楊宗仁喇嘛和龔明勤喇嘛先後從勞動教養處返回寺院，其他四個喇嘛已在勞動教養中病故，永遠也回不來了。落實政策的第二個問題是清退被抄寺物及占用單位退房、遷出。被抄財物已經十不存一，法器、莊嚴、陳設、楹聯匾額或被毀壞或被私人侵吞、索退無望，最後收回來的唯有漢文大藏經、康熙《禦製廣仁寺碑》真跡、康熙禦題匾額《慈雲西蔭》等數種而已。清退房地產至1984年，占用殿、堂、廂房的住戶遷出完畢；至1992年前後，蓮湖區武裝部退還新建的辦公樓；剩餘部分，市、區宗教部門正在積極協調落實。
宗教政策的落實使廣仁寺的前途充滿了希望。正是這種希望，鼓舞著寺內喇嘛們持續不斷、不遺餘力地進行寺院的修複工作。主持此項工作的人先是楊宗仁喇嘛，後是龔明勤喇嘛，居士們也為之作出不懈努力，在政府的大力支持下，自1984年至1999年，他們依次進行了如下工作：
揭頂翻修了大殿、二殿和經堂；
至1986年全部彩繪了寺內主要殿、堂；
翻修寮房十間；
1992年在原址按原式樣重建山門三間和兩個角門；
重置萬年燈並作八角木亭覆之；
1994年重建禦碑亭；拆除舊照壁殘壁，在原址按原式樣重建照壁；
1995年修建兩眼龍眼泉；
此後又用方磚重鋪一進院、二進院地麵。
此間，中國佛教協會趙樸初會長曾親臨廣仁寺視察，並題“廣仁寺”匾額，又撥專款助修山門；青海塔爾寺、甘南拉卜楞寺也鼎力相助，今大殿內供奉之綠度母像即是由全國人大常委、中國佛協常務副會長、中國四大活佛之一、第六世嘉木樣·洛桑久美圖旦卻吉尼瑪親自開光後，從拉卜楞寺送來的。
在修複殿宇的同時，喇嘛們還為寺中殿堂添置了諸佛像，其中，大佛殿的像設有中間的綠度母像，木質，貼金，1988年由甘肅拉卜楞寺迎來；東文殊菩薩像，西普賢菩薩像，皆泥塑，新造。正殿門外的匾額乃康熙所題“慈雲西蔭”的原件，廊上兩根大紅圓柱上金書“方外雲山無非幻境，靜中歲月自有長春”楹聯；東偏殿像設有：中釋迦牟尼像、右（北）阿彌陀佛像、左（南）藥師佛像，皆木質，落實政策中自省佛教協會迎來，門外上方彩繪“八寶”；西偏殿像設有：中觀音菩薩像、左（北）彌勒菩薩像、右（南）關公像（伽藍神），皆泥質，1998年新塑。門外上方彩繪“八寶”，匾額為“莊嚴佛土”，由康有為書，風格為仿《石門銘》書體；藏經殿供奉宗喀巴大師像，泥質，1986年新造；殿門外上方懸慈禧太後題“法相莊嚴”複製匾額，兩旁對聯為“蒲座開函風滿室”“花池洗缽雨添泉”；東偏殿用作接待室，西偏殿則是居士協助寺院辦事的公廨；經堂內供奉新塑的藏式大威德金剛像。
現在的廣仁寺，從總體上看已經是煥然一新，盡管幡蓋帳幔、法器蒲座之類尚顯陳舊或短缺，但卻在逐步地再現昔日之輝煌和宏麗。住寺喇嘛也在增加，除正式住持龔明勤達喇嘛外，2001年11月，廣仁寺為複興藏傳佛教格魯派的傳統和學風，保證寺院的持續發展；從蒙古族地區延聘了數位喇嘛正式進住廣仁寺。此外，寺中還有來自甘南的掛單喇嘛。由於他們的到來，寺中每日的誦經儀式已經恢複，螺號聲、誦經聲重新在廣仁寺的上空回蕩、繚繞。日後，廣仁寺設想引進資金、化募布施，以備進一步建設寺院之用；在此同時邀請國內著名活佛、高僧大德來寺講經說法，主持法會；擬將寺內寬廣之防空洞改造成藏傳佛教文化的展覽室；籌劃重建黃教領袖的行宮等等。可以期待，在全寺喇嘛、廣大居士及四方善信的團結合作、共同努力下，廣仁寺必將再度成為陝西境內著名的黃教道場，成為化度眾生、法海津梁的靈山淨土、耆閣香城。