綜上所述，我們認為蓬萊古船是在元朝建造使用的，其最晚使用期限不應晚於明初洪武九年，即公元1376年蓬萊水城修建以後。
二、關於古船的性質
我們知道，作為海船必須具有較好的抗沉性、適航性、穩定性，而蓬萊古船船體修長而窄，呈流線型。船頭首柱高高翹起，尖頭闊尾。船的長寬比為造船史中少見的5：1，這種瘦長型船舶的快航性顯然很好。但它艙位不深，又加上被分隔為14艙之多，顯然不利於裝載貨物，而且在船艙內也沒有發現裝載的貨物。那麼，這種“快速型“的船舶究竟有何用途呢？蓬萊地方史誌記載，北宋慶曆二年（1042年）為抵禦北方遼國的南侵，登州郡守郭誌高“奏置刀魚巡檢，水兵三百戍沙門島，備禦契丹。”在今水城修建水寨，屯駐“刀魚戰棹”，名叫“刀魚寨”。因為其水師所駕駛的戰船，形狀狹長酷似刀魚（刀鱭，即帶魚），故被稱為“刀魚舡”。此後，在去宋代不遠的元代，來自日本的倭寇不斷在東南沿海騷擾。《元史》雲：“武宗至大二年七月，樞密院臣言：‘去年日本商船根本焚掠慶元，官軍不能敵。”在陸地馳馬縱橫的元軍，遇到來自海上騷擾的難題，現實使元統治者認識到：“以水路之兵習陸路之技，驅步騎之士從風水之役，難成易敗。”fi]從而開始注重訓練水師，加強海上軍事力量。那麼，位於海上交通要衝的蓬萊自然不能例外。史載：“元初……登萊李瑄舊軍內起僉一萬人，差官部領禦倭討賊，而水軍之防仍循宋製。”由此可知，元朝蓬萊水城仍象北宋時期一樣，照舊駐紮著水師，用於巡邏海麵，出哨防洋，防禦倭寇的海上騷擾。當時元水師采用的戰艦，很可能沿襲采用了宋朝戰船“刀魚戰棹”的船型，並加以演變和發展，形成了我們今天所看到的這種在造船史上罕見的長寬比為5：1的蓬萊古船，也就是元朝古戰船。
如果說單從文字記載方麵來考證蓬萊古船為戰船，根據尚不充分的話，那麼，我們再從船上發現的遺物來進行分析。上已提到，古船上僅有高足杯、鐵劍、石球、灰瓶、人骨等，就在這數量有限的幾件文物中，除高足杯為日常用品外，其它都是用於戰爭的軍事遺物。鐵劍深深插人艙壁，殘長19cm；石球直徑12cm應係元代軍中常用的拋石機之遺物；裝滿石灰的陶瓶，醬色，棒錘形，製作粗糙，在船外淤泥中亦發現有許多同樣的陶瓶，顯然是製造煙幕和殺傷敵人視力的灰瓶；在船底還發現有炸裂的銅銃口。這些都充分說明了古船的性質是用於軍事。另外，在船艙淤泥裏還發現兩塊骨色泛黑的人骨，一件長15cm，其一端骨關節保存完好，為人體的前臂骨；另一件長22cm，骨關節不存，屬人體何部骨骼不詳。該兩件骨骼的發現，為蓬萊元朝戰船的曆史更增添了撲朔迷離的色彩。
此外，蓬萊元朝古戰船出土於港灣偏僻的西南角。這裏位於港內深處，波平浪靜，是個泊船的好地方，可以避免狂風巨浪對船舶的危害。然而，引人注意的是，在這裏同一地層中，東西走向埋藏著三艘古船。從現場上觀察，埋藏的三艘古船既不會遭受自然界大風浪的襲擊，又沒有人為破壞的跡象，那麼是什麼原因使三艘古船停泊在一起呢？從發掘的古船船板觀察，該船許多原厚20cm的船板，經過長時間的使用，厚度已磨成9cm。在船體上兩處地方還經過了修補。據此我們可以推知，這艘出土的戰船經過長期使用後，不再進行修補，作為退役的戰船被停泊在港灣的偏僻處。鑒於此，其他二艘古船應是同一原因，完成了“出哨巡洋、禦倭討賊”的曆史使命，退役後停靠在一起，被遺棄在港灣的偏僻處，這可能也是元朝戰船上發現遺物很少的原因。