市場經濟要求金融機構在經營活動中，力爭以最少的消耗獲得最大的利潤。這樣，一方麵可以為國家建設積累資金，促進本單位事業發展；另一方麵可以增加職工收入，提高職工的生活水平。利潤的多少，主要取決於收入和費用的高低。因此，收入和費用總是財務管理的一個主要內容，同時也是金融審計工作的重點內容。收入和費用的審計是確定各項收入和費用是否真實、正確，收入和費用是否相互配比，收入和費用的表達是否恰當，是否符合國家法規、會計準則和財務通則的規定。對收入和費用審計的範圍主要有：營業收入的審計；投資收益的審計；營業外收入的審計；營業成本及費用的審計；營業稅金及附加的審計；營業外支出的審計等。
一、營業收入的審計
金融機構的營業收入是指在一定時期內，通過對外提供金融業務或者其他有關金融服務而取得的收入，主要包括利息收入、金融企業往來收入、手續費收入、證券銷售與證券發行收入、租賃收益、彙兌收益、其他營業收入等。營業收入的主要特征是與金融機構的業務經營密切相關，凡不是與業務經營活動密切相關的收入，一般不作為營業收入。營業收入是金融機構收益的主體，也是各項耗費得以補償和積累的主要來源。
對營業收入的審計，重點是檢查各項收入的核算內容是否完整，是否包括了所有內容；各項收入是否真實，有無虛增虛收的情況；各項收入是否合法合規，是否包含有違規業務取得的收入。
（一）利息收入的審計
利息收入是金融機構對客戶發放各項貸款與辦理貼現而計收的利息。利息收入在營業收入中占有很大的比重，尤其是在當前金融行業分業經營的情況下，利息收入是金融機構特別是銀行財務成果的重要內容。
金融機構應按期計提各項貸款利息並確認收入，貸款到期（含展期）90天及以上尚未收回的，其應計利息納入表外處理；已計提的應收利息，在貨款到期90天後仍未收回的，或應收利息逾期90天後仍未收到的，衝減原已計入損益的利息收入，轉做表外處理。已轉入表外處理的應收利息，在實際收到時確認為當期利息收入。
在對利息收入進行審計時，應注意以下幾個方麵：
（1）檢查貸款的期限和利率的執行情況。主要檢查貸款賬、據、合同三者是否相符，逾期貸款是否及時轉入了逾期科目（或逾期戶），並計收罰息；是否執行了中央銀行規定的利率檔次，有無擅自提高或降低利率的行為；按規定調整利率時，是否實行了分段計息；逾期90天以上的貸款是否轉表外計息，有無為了虛增收入將表外利息收入轉入表內，或為了虛減收入將表內利息收入轉為表外的情況。
（2）檢查計息方法的正確性。檢查是否按規定結息期以及規定的利率結息，利息計算是否正確。
（3）檢查利息入賬的情況。檢查利息收入是否全部入賬，有無記錯或轉移利息收入的情況，應將利息憑證與有關單位存款賬戶利息支出相核對，看其是否相符正常，對重點單位，如有必要可填製對賬單與借款單位核對，檢查內外賬務是否相符；尤其應注意被審計單位是否執行了權責發生製，年末應收未收的利息收入是否計入了當期損益。
（二）金融企業往來收入的審計
金融企業往來收入是指各金融機構係統內、金融機構之間以及金融機構與中央銀行相互之間資金往來產生的利息收入，利差補貼收入等。
對金融企業往來收入進行審計時，應注意以下幾個方麵：
（1）檢查計息的範圍。注意檢查各項往來、上存和拆出資金是否全部按規定計息，有無遺漏或錯收的情況。
（2）檢查利率的使用。檢查各項資金是否按規定正確使用有關利率檔次，有無違反利率政策，隨意提高或降低利率的情況；利率變動時，是否按照規定計息，有無隨意混淆新舊利率計算時限的情況。
（3）檢查入賬情況。檢查分析金融企業往來收入計算是否正確，是否及時入賬，有無弄虛作假，轉移收入的情況；對拆出資金利息收入應根據拆出資金期限和協議規定的利率，檢查利息計算是否正確，入賬是否及時，有無轉移、隱瞞收入截留私分的情況。
檢查時，還應特別注意往來科目發生額的變化情況，不要單獨檢查金融企業往來收入明細資料，要結合金融機構有關往來科目一起檢查，如：存放同業款項、拆放同業、拆放金融性公司等科目的發生額是否正常，對大額業務要進一步查看憑證，檢查資金來源是否正常，有無在往來科目中進行隱瞞存款、違規拆借、對外投資等事項的發生。
（三）手續費收入的審計
手續費收入是金融機構在辦理各項業務中收取的手續費。金融機構在辦理業務時收取的手續費，可以分為兩類：一是自營業務手續費；二是代理業務手續費，如代理發行國庫券、股票、債券及代理中央銀行業務等所收取的手續費或推銷費。
對手續費收入進行審計時，應注意以下幾個方麵：
（1）檢查各項業務手續費是否按規定的收費標準和收費範圍收取，有無擅自擴大或縮小收費範圍，改變收費標準，錯收、漏收的情況。
（2）檢查手續費的收取方式和計算是否正確。對收取現金的，出納人員是否及時、逐筆向客戶收取，收費手續是否齊全；對定期彙總轉賬收取手續費的，檢查其是否及時填記收費單據，彙總扣款憑證與附件是否相符，一定時期有關收取手續費的自營業務和代理業務的業務量是否與同期收費總額基本一致。
（3）檢查各項手續費收入是否及時入賬，有無轉移收入、私設“小金庫”的情況，有無截留、私分等問題。
（四）其他營業收入的審計
其他營業收入是指包括租賃收入、房地產開發收入、谘詢收入、外彙買賣收入、信托收入、證券發行及買賣收入等其他與經營業務有關的營業性質的收入。在對其他營業收入進行審計時，應嚴格按照有關規定，檢查其是否準確計算，如數入賬；“其他營業收入”科目的核算手續是否齊全，有無不按製度辦事的情況。
二、投資收益的審計
投資收益是金融機構通過購買有價證券或以資金、實物、無形資產對外投資所獲得的收益，它是金融機構財務的組成部分。對其進行審計時，應注意以下幾個方麵：
（一）經營性證券收益的審計