（四）檢查會計憑證保管的完整性和合規性
（1）抽查部分會計憑證，看每日賬務處理完畢，是否及時集中全部憑證，按會計科目順序進行整理裝訂。如：對每一科目的傳票，是否按現收、現付、轉借、轉貸的順序整理，排放在科目日結單後麵；各科目傳票張數是否與本科目日結單上填寫的傳票張數相符。
（2）檢查會計憑證的裝訂和保管是否規範。如：裝訂時是否將傳票及附件整理整齊，另加傳票封麵、封底，用線繩裝訂牢固，並在繩結處用紙條加封，加蓋裝訂人員和會計主管人員的騎縫章。
（3）檢查已裝訂的會計憑證是否按年度編排序號，並及時登記有關會計檔案登記簿，入庫保管；調閱和銷毀會計憑證手續是否完善，有無隨意拆封或銷毀會計憑證的情況。
（五）有價單證和重要空白憑證管理的審計
有價單證，是指有價值的特殊單證，如國庫券、定額本票、存單等，這些單證一經銀行簽發，就具有較強的支付能力，因此，應視同現金加強管理。對有價單證要貫徹“證賬分管、證印分管”等原則，即會計管賬、出納管證，以相互製約、相互核對。通過表外（備忘）科目核算，建立有價單證登記簿，按單證種類、票麵金額等立戶，定期核對。有價單證的調入、撥出、領用、運送等均比照現金管理辦法辦理。
重要空白憑證，是指一旦由銀行或客戶填寫並經蓋章後，就具有支付效力的、未使用的空白憑證，如支票、彙票、本票、存折、聯行報單等等。對重要空白憑證要通過表外（備忘）科目進行核算，建立重要空白憑證登記簿，按品種立戶，並登記憑證的起訖號碼，由專人負責管理，以保證單證的完整與安全。
四、賬務組織與處理程序的審計
賬務組織，是指在銀行會計核算中，賬簿設置、賬務處理程序和賬務核對方法等有機配合的賬務體係。建立科學的賬務體係，不僅可以保證銀行會計核算工作有條不紊地進行，而且有利於銀行會計核算質量和工作效率的提高。
銀行會計的賬務組織體係由明細核算和綜合核算兩大核算係統所構成。明細核算，是按分戶賬賬戶分戶核算，反映各單位和各項資金增減變化及其結果的詳細情況的核算係統。綜合核算，是按會計科目或總賬進行彙總核算，反映各類資金增減變化及其結果的總括情況的核算係統。明細核算和綜合核算都是根據共同的會計憑證，按照“雙線核算”的原則，進行平行登記，分別進行的核算。因此，明細核算是綜合核算的具體化，對綜合核算起補充作用；綜合核算則是明細核算的概括，對明細核算起統馭作用。兩者在反映情況方麵相互配合、相互補充，在數字方麵則相互聯係、相互製約，共同構成了銀行會計完整的、科學的、嚴密的賬務組織體係。
對銀行會計賬務組織與賬務處理程序的審計應主要從以下幾方麵進行：
（一）會計賬簿使用與管理情況的審計
會計賬簿，是由相互聯係並具有一定格式的賬頁所組成，用來分類記載各項經濟業務的記錄簿冊。會計賬簿是會計核算的重要工具，它是將大量的、分散在會計憑證上反映的經濟業務經過歸類整理，按照經濟業務發生的先後順序，分類地、係統地進行記載和反映，從而為編製各種會計報表提供數據和資料，並提供銀行經營管理者以及其他有關方麵所需要的各種經濟指標。對會計賬簿的審計，重點應檢查各種會計賬簿的設置、登記和管理情況。
1.檢查會計賬簿設置和登記情況
對會計賬簿設置和登記情況進行檢查，主要是檢查會計部門是否根據業務情況和會計核算的需要，按照綜合核算和明細核算兩大核算係統分別設置有關賬簿；序時賬簿、分類賬簿和各種備查賬簿的設置是否齊全，登記是否及時、準確，是否符合會計製度的有關規定。具體內容如下：
（1）檢查現金收入、付出日記簿的設置與登記。檢查出納專櫃是否按收款、付款分設現金收入和現金付出日記簿，有無合並設置的現象；檢查出納收款員和付款員是否根據現金收入、付出傳票，逐筆序時記載現金收入日記簿和現金付出日記簿，有無並筆記載和不按業務發生先後順序記載的情況；檢查每日營業終了，是否按現金收入、付出日記簿分別結出合計數，與現金收付總數核對，並結計現金庫存簿。
（2）檢查分戶賬的設置與登記。檢查是否按銀行賬戶管理辦法的有關規定開立基本存款賬戶、一般存款賬戶、臨時存款賬戶和專用存款賬戶；是否按戶立賬，有無合並立戶或以憑證代替分戶賬的情況。檢查記賬員是否根據傳票逐筆連續記載並隨時結出餘額；記賬時是否根據憑證切實核對戶名、賬號、印鑒、餘額等，有無串戶、冒領、透支等會計質量事故的發生；是否寫明記賬日期、對方科目、憑證號碼及業務內容摘要等。
（3）檢查總賬的設置與登記。檢查總賬是否按會計科目設置，有無亂設總賬或總賬設置不全等情況。檢查總賬是否根據各科目日結單的借、貸發生額合計數按日記載，並結出餘額。對借貸雙方同時反映餘額的總賬，是否根據餘額表或分戶賬各戶的借、貸方餘額分別加總填記，有無軋差記載的情況。
（4）檢查備查賬簿的設置與登記。備查賬簿是適應某些業務需要而設置的賬簿。它名目繁多、形式各異。如各種登記簿等，大部分都是專用的。檢查時，主要檢查是否根據業務需要和核算要求以及有關規定進行設置，是否建立了嚴密的處理手續，及時記載，及時銷記。
2.檢查會計賬簿的管理情況
（1）檢查賬頁的啟用與結轉。銀行賬簿多為活頁賬，檢查賬簿的管理首先應檢查賬頁啟用時，賬頁上首規定填記的主要事項，如賬號、戶名、領用憑證記錄、利率等是否詳細填寫。
分戶賬複寫賬頁平時每記滿一頁後應更換，並將舊賬頁最後餘額直接過入新賬頁，新賬頁首行摘要欄加蓋“承前頁”戳記。總賬每月更換新賬頁一次，將舊賬頁上的“上年底餘額”“自年初累計發生額”“月終餘額”分別過入新賬頁的“上年底餘額”“本年累計發生額”“上月底餘額”欄。年初更換新賬頁時，隻過上年底餘額。
年度終了，各科目分戶賬除儲蓄賬和未核銷的卡片賬可以繼續使用外，均應更換新賬頁。在舊賬頁的最後一行餘額下加蓋“結轉下年”戳記，並將最後餘額過入新賬頁，新賬頁應寫新年度1月1日，首行摘要欄加蓋“上年結轉”戳記。丁種賬賬頁應在舊賬頁未銷各筆的銷賬日期欄加蓋“結轉下年”戳記，將未銷賬各筆過入新賬頁，並結出餘額，在摘要欄加蓋“上年結轉”戳記，同時填列舊賬頁的發生日期及摘要，以備查考。