石原四郎想了想道：“這個我明白，但是要救治恐怕來不及了，我看進行重點救治，我們先將重要的地方進行消毒處理，進行重點消毒，以保障這些地方的安全，你看怎麼樣，總之我聲明，就算你全力支持藥物的生產也不可能生產出那麼多藥物的。”
土肥原四郎看石原四郎一臉真誠，他道：“好吧，你去安排，還有盡快，不要讓瘟疫蔓延到僑民和軍隊。”
石原四郎根據土肥原的命令，很快就對新加坡和重要的城市還有原料生產地進行了清理，而馬來半島則是重點區域，這裏比較小，優勢戰略要地，土肥原不希望出現什麼大事。
而馬來的土著則遭了殃，一般的土著要是感冒發燒了不敢去治療，對於這樣的人，日本人一旦發現直接當瘟疫患者處理，他們不是救治，而是消滅後焚屍滅跡，得了病被日本人發現了就是死路一條了。
而印尼人則沒有那麼好的運氣了，馬來半島的人口隻有幾百萬，比較好防治，但是印尼的三個大島集中了印尼百分之九十的人口，一個到最少也是一千萬，爪哇島更是有兩千多萬人，根本無法防治，瘟疫已經四處蔓延，現在誰也沒辦法得知誰感染了，誰沒有感染。
等待印尼人的隻有泰國人一樣的下場了，而當地的華人大部分集中在重要的城市，日本在這裏進行了防治，因此他們大多數人僥幸的躲過了這一劫，不過因為其他地方的瘟疫使得日軍的收入極大的減少，因此日本人對他們的盤剝更加的厲害，基本上隻是讓他們能活下去，但是這樣已經算是不錯了，之前日本人在印尼、馬來亞日本人不但自己屠殺華人同時還慫恿土著對華人進行殘害。
而印尼和馬來發生瘟疫的時候，菲律賓差不多在隨後的幾天也爆發了瘟疫。因為日本封鎖消息，土著們知道的事情都是對日本有利的報道，大多數人並不知道外界的事情，更不知道東南亞的大瘟疫。
在菲律賓馬尼拉的本間雅晴雖然知道泰國的瘟疫，但是並沒有提醒他要注意防治瘟疫，他自己也壓根沒想過隔著寬廣的南海，瘟疫還能傳到菲律賓，他一直認為需要擔心的是退守西貢的中村明人和在馬來亞的土肥原賢二，因此菲律賓並沒有加強人口流動措施。
不過到菲律賓的泰國人比較少，畢竟距離太遠，所以沒有到處爆發，但是人口最多的主島卻沒有幸免，而且因為土著們發病的不敢上報，所以導致了大量的人被感染，有的很快發作，有的人病毒在身體內潛伏起來，隨時發作，甚至還有的人不會發作，但是會一直潛伏，但是別人接觸他則會感染，然後發作，不知這種人是萬中無一的。
瘟疫在菲律賓迅速的擴大了，而且駐紮在菲律賓的日軍又多，很快在軍隊內也出現了一些感染者，一時間日軍人人自危，再也顧不得防治什麼瘟疫了，很快他們就將自己和外界的土著隔開，同時他們不得不讓石井四郎過來防治瘟疫，至少要保住日軍。
王漢章也終於知道了原來瘟疫是日本人搞的，因此在國際上強烈的控訴日軍的行為，同時派人拍攝了大量的照片，一時間盟國爭相報道，連德國等軸心國也對日本的做法表示譴責，這種事情雖然很多國家都幹過，但是都是秘密進行的，向日本人這樣公開的做這種事情實屬罕見。
而日本也指責是秦國幹的，不過在秦國列舉了大量的證據之後，沒有人相信是秦國幹的，首先日本不戰而逃離泰國就是最明顯的事情，日本人不可能這麼做，另外日本在中國使用毒氣彈、細菌彈早就報道了無數次了。
英美等國看日本的細菌武器威力如此驚人，也十分的擔心，他們們加快了藥物的研製，萬一真的日本人狗急跳牆，到時候自己也好防治。同時美國的登陸菲律賓的作戰計劃被迫擱置。
而日本方麵，瘟疫已經全麵爆發，沒有辦法防治了，除非他不打仗了才會有精力。
到秦軍反攻印尼、菲律賓時，原本印尼7000萬人口之剩下了兩千多萬，菲律賓1600萬人口因為分散在各個島嶼上，加上其特殊的地位，後來因為發病或者被日軍懷疑殺掉的有600多萬，剩下九百多萬人口。這為日後將這些地方納入華夏文明圈極大的減少了阻力。
同時瘟疫橫行，日本在此地的稅收受到嚴重的印象，有些人是染上了瘟疫死的，有些人則是餓死的，同時日本為了保證礦產資源的生產，大量征集土著，壓迫致死。