太平洋戰爭初期，南方軍進展迅速，兵分四路作戰，山下奉文的25軍沿馬來半島——新加坡方向，本間雅晴的14軍沿菲律賓方向，飯田祥二郎的15軍沿緬甸——泰國——印度方向，今村均的16軍沿爪哇方向。不到半年時間，南方軍即侵占了新加坡、馬來西亞、菲律賓、印度尼西亞以及南太平洋上的許多島嶼，攻占了10倍於日本本土、擁有富饒自然資源和1.5億人口的大片土地。同時，日方損失甚微，包括海軍在內，僅傷亡15000人，損毀飛機380架，驅逐艦4艘。
經過兩年的時間，因為戰局的一再失利，字去年後，日本就加強了南方派遣軍的實力。在王漢章為進攻泰國之前，日軍為撤離泰國之前。
第7方麵軍〈司令部在新加坡，司令官土肥原賢二〉：第29軍（第37，第94師團，第37，第70旅團），第16軍（第48師團，第28旅團），第37軍（獨立混成第56，第71旅團），直轄之第46師團，獨立混成第26旅團，共計10萬人，主要任務是防止盟軍在馬來亞、新加坡、婆羅洲、爪哇島及蘇門答臘。
第14方麵軍（司令部在呂宋）：第35軍〈第1，第16，第26，第30,第100，第102師團，獨立混成第54，第55旅團，步兵第68旅團〉，第41軍（第8師團），直轄之第10，第19，第23，第103，第105，坦克第2師團，第1挺進集團，獨立混成第58旅團，第4飛行師團。
1941年11月在南方軍隸下設置第14軍，作戰地域配置在菲律賓方麵。1942年10月改編升格成第14方麵軍，司令官本間雅晴，兵力20萬人。
第18方麵軍（司令部在曼穀，司令官中村明人)：第15軍（第4師團），直轄之第15，第22師團，獨立混成第29旅團，曼穀防衛隊，一共5萬人。
南方軍直轄：第14師團(獨立混成第49，第53旅團），第2軍（第5，第32，第35，第36師團，獨立混成第57，第128旅團），第18軍（第20，第41，第51師團）第38軍〈第2，第21，第55旅團，獨立混成第34旅團〉,第3航空軍（第5，第9飛行師團，第55航空師團。人員25萬人，由派遣軍司令官寺內壽一指揮，作戰區域在太平洋諸島。
從兵力上來講，日軍的南方派遣軍兵力雄厚，而且是日軍最精銳的部隊，如果不是美國在太平洋上猛烈的進攻，王漢章肯定會麵臨一場前所未有的大戰，當然王漢章能走到今天也跟日軍的戰略格局小有關，日軍開始沒十分的在意，他們認為先擊敗美國，中國遠征軍就不足為慮，但是他在美國手中是一敗再敗，而遠征軍，王漢章卻迅速的成長起來，日本因此錯過了最佳的進攻時間。
瘟疫爆發後，駐紮印尼和馬來的第七方麵軍麵對洶湧的瘟疫，無力製止，他們隻有十萬人，卻要穩住5、6千萬的印尼土著，就算有土著兵協助，他們的人手還是不夠，想殺都不知道從那裏開始，同時也殺不過來，看似健康的人可能明天就發作了。
最後土肥原賢二隻能對日本軍隊和僑民進行防護，而石原四郎也飛快的抵達了新加坡。
根據駐紮在當地的軍醫的報告，石原四郎看著病人的症狀，很快意識到是他的研究成果，肯定是土著們來了印尼和新加坡，把這裏的人傳染了。
“土肥原君，根據下麵的檢驗報告，和本人部下的親自檢查，本人已經可以確定這次瘟疫的病毒是本人研究所研究的新型細菌。不過我隻是在泰國和柬埔寨使用了，本來是配合大本營消滅支那遠征軍的，但是沒想到他們居然跑得比兔子還快，使得計劃落空。”
“根據我本人在那裏半個月的觀察，瘟疫蔓延的速度非常的快，比在支那實驗室爆發的更快，我綜合了一下，一是這邊的環境更適合細菌的滋生，而是這裏的人口密集且不愛衛生，如今瘟疫已經全麵爆發，雖然我們有藥物可以救治，但是抱歉，藥物造價昂貴，我沒有那個能力去救幾千萬人，”石原四郎說道。
土肥原道：“石原君應該知道印尼、馬來亞和越南同樣的重要，這裏有帝國最急需的資源，最重要的是石油資源，另外還能為幾十萬派遣軍提供軍糧，如果這裏任由瘟疫爆發，那麼經濟就會遭到嚴重的破壞，不但沒有了糧食，同時石油和其他礦產的正常生產怕是也會受到影響。”
“石原君，我不關心土著死多少，但是我在乎的是帝國在這裏的利益，特別是帝國急需的物資，不管你用什麼辦法，無比保證正常的生產。”土肥原的話非常的嚴厲，讓石原四郎都有點怕怕。