中華帝國洪憲三年七月二十七日，商毅在大阪城收到消息，得知酒井忠勝率領大軍從江戶出發，趕赴尾張而來，於是商毅也立刻下令，率軍出了大阪城，首先向彥根城發動進攻。這一次戰鬥，也就是被後世稱為第二次關原合戰的前哨戰。
彥根城位於琵琶湖的東岸，京都東北約五十公裏的地方，彥根藩的藩治所在，是由江戶進入京都地區的必經之後，地區位置十分重要，在關原合戰中，曾是豐臣軍主將石田三成的駐地，而現在也是幕府軍防守的最前沿陣地。
彥根藩是的第一任藩主是德川四天王之一的井伊直政，因為彥根藩是守衛由關西進入關東地區的咽喉要路，也是德川幕府的最前沿防線，這一次酒井忠勝派遣了鬆江藩主鬆平綱隆、高鬆藩藩主鬆平賴常、小田原藩藩主稻葉正則三位大名領大軍二萬五千人，進駐彥根藩，幫助藩主井伊直孝駐守，加上本藩的人馬，和從大阪城逃出的敗軍，現在彥根藩共有人馬四萬五千人餘人。
而以中華軍為守的倒幕一方，要與幕府軍進行決戰，就要首先攻占彥根城，就能夠將幕府軍堵在關西以外，並且把決戰的戰場定在關原地區。
當然商毅之所以要等到現在才出兵，就是因為怕搶先占領了彥根城之後，幕府軍會害怕中華軍的兵勢強大，不敢從江戶出兵，而是全力守衛江戶一帶地區，層層設防，這樣就會給中華軍帶來許多麻煩，必須逐城逐地的攻取，戰事曠曰持久，因此商毅一定要等到幕府軍出兵之後，才進攻彥根城，這樣一來，就算是幕府軍得知彥根城失守，但大軍已經出城，也是箭在弦上，不得不發了。
江戶離彥根大約有四百多公裏的路程，而且在其中還要翻躍飛馬單（這個字打不出來，左馬右單）山脈，因此至少需要七到十天的時間，而從大阪到彥根隻有一百多公裏，基本都是平坦大道，而京都離彥根更近，因此既使是扣除探子傳回消息的時間，中華軍仍然有三到四天的攻城時間，完全是足夠的。
而且這一次出兵，中華軍集中登陸曰本以來的最強舡兵力，包括第十一軍全軍，第九軍特種兵旅、第四旅，護衛軍第一師、第二旅，共計兵力近六萬餘人，而在京都集結的倒幕軍十二萬多大軍, 也都全數出動。全軍的總計兵力達到十八萬多人。
在京都集結兵力的時候，商毅也將倒幕軍進行了編製，畢竟倒幕軍是來自於四十七個不同的大名，如果沒有一定的組織，打起仗來非亂不可。因此商毅將倒幕軍平均分成三個大隊，分別由毛利廣綱、鍋島勝茂、有馬忠賴三人統領，而毎個大隊中，又分為三個小隊，除了毛利廣綱、鍋島勝茂、有馬忠賴三人各直領一隊之外，另外六名主將分別是：人吉藩藩主相良賴喬、柳河藩藩主立花鑒虎、岡藩藩主中村清久、廣島藩主淺野綱晟、足守藩藩主木下利貞、土佐藩藩主山內豐昌。
這樣總計將十二萬大軍分成九個小隊，毎隊一萬人到一萬五千人不等。在戰鬥中也就可以方便調派。
七月二十九日，中華軍率領著倒幕大軍，到達彥根城前。
而這時在彥根城前，幾位守城的大名為在為如何抵擋中華軍的進攻而爭論不體，因為現在熊本、大阪兩城都相繼失守，戰鬥的過程也傳到彥根城裏，城主井伊直孝就認為中華軍的火炮過於厲害，彥根城的城牆還不如熊本、大阪兩城，因此一但守在城裏，就可以讓中華軍在城外從容的布置火炮，守城是肯定守不住的，不如出城與中華軍進行野戰，這樣一來，中華軍的火炮也就失去了作用。
火炮在野戰中的作用不大，這是日本人的常識。而另外三人中，鬆平綱隆支持井伊直孝的建議、而鬆平賴常和稻葉正則還是認為應該留守在城裏，畢竟倒幕軍有十八萬大軍，既使是出城野戰，自己的勝算也不大。
但就在這時，探孑向城中報告，來進攻彥根城的，隻是中華軍的人馬，總兵力不足五萬，其他的倒幕軍在離彥根三十裏的地方就停了下來。
這一消息令彥根城裏的四位大名又驚又喜，不明白倒幕軍內部到底是發生了什麼事情，難道是鬧內亂不成嗎？但現在進攻彥根城的中華軍與幕府軍的兵力大體相當，在這種情況下，鬆平賴常和稻葉正則也沒有理由再反對出戰了，畢竟在此之前，中華軍的強悍主要是表現在以猛烈的火炮轟擊和爆破摧毀城牆，而並沒有顯示野戰方麵的能力，而按曰本人的觀念，無論是火槍還是火炮，在野戰中的作用都不大。
因此井伊直孝也立刻下令率領四萬大軍出城，在城南布陣迎戰中華軍，四位大名全數出戰，以鬆平綱隆帶領一萬二千人馬為左翼，靠著今須山的東側布陣，由鬆平賴常領一萬三千人馬為右翼，靠著琵琶湖列陣，井伊直孝和稻葉正則率領一萬五千人馬為中陣。布出一個漂亮的雁形陣。