那知就在紹武朝廷內部還討論商議的時候,金聲桓己經等不及了,帶領著人馬己經退進到汀州府。
那知鄭成功可不是個隻會說不會做的人，早就在汀州府裏埋伏下了人馬，金聲桓的部隊一到，立刻就遭到鄭牟的襲擊，結果被打得大敗，四散奔逃，幸好是金聲桓、王得仁頗有些勇力，帶領著數千殘兵殺出重圍，躲進黃公嶺去了。隨後鄭成功又上書紹武朝廷，稱金聲桓無令進犯汀州，意欲不軌，被自己岀兵殺敗。
朱聿鐭和蘇觀生等人聽了，雖然惱火，但也沒有辦法，畢竟鄭成功說的也不無道理，金聲桓退進福建，確實是沒有任何人下令。金聲桓又是降將，說他意欲不軌，也並不是說不通的。而且現在事情也己經發生了，紹武朝廷也不敢責怪鄭成功，隻好命令蘇觀生去調解。
經過了好一番功夫之後，鄭成功終於接受了金聲桓投降紹武朝廷的事實，但禁止金聲桓部駐紮在汀州府，而是命金聲桓移軍邵武府。因為邵武府的地域不大，隻有汀州府的一半，而且緊鄰建寧府，處在商家軍的左右夾擊，把金聲桓扔在這裏，當然是有意打壓他，不讓他有東山再起的機會。另一方麵紹武朝廷也覺得讓金聲桓守在邵武府，可以擋住建寧府的商家軍進攻，而且離福州也比較近，因此也認為這樣的安排也不錯。
但這時金聲桓連遭慘敗之後，部下隻剩四千多人，現在回想一下，要是直接投降商家軍，弄個團長也能管著三四千人，到頭來除了有一個公爵的虛名之外，啥都沒了，因此金聲桓連腸子都悔青了。但現在能有一塊安身之地就己經不錯了，那還有資格挑挑揀揀，金聲桓也二話沒說，老老實實的帶領著餘部去了邵武府。
而在這段時間裏，羅遠斌也占領了江西省的全境。因為商毅的命令隻是江西，不包括福建，因此商家軍也沒有繼續進軍，在江西省駐紮下來。而紹武朝廷見商家軍並沒有進攻福建的意圖，也就放心下來，然後又把商家軍的事情放到一邊，開始琢磨怎樣利用金聲桓，來牽製鄭成功。
到這時商毅的擴展計劃中，江南的部份己經全部完成，現在商毅的統製範圍己經包括湖南、江西、浙江三個省的全部地區。
另外在南方居然還發生了一個小插曲,廣東的尚可喜宣布，反清複明，奉立魯王朱以海為帝，原來尚之孝從江西撤回到廣東之後，尚可喜也十分緊張，因為一但商毅打完了覺羅巴哈納和金聲桓，下一步要收拾的，恐怕就是自己了，雖然說自己現在坐鎮廣東，手裏有六七萬大軍，但尚可喜還是頗有自知之明，幾十萬清軍都打不也商家軍，何況是自己這六七萬人呢？
因此尚可喜首先準備聯合覺羅巴哈納，共同對付商家軍，但他又不希望覺羅巴哈納放到廣東省境內來，隻能讓他們在贛州拒守，卻沒想到金聲桓殺了覺羅巴哈納，投降了紹武朝廷，江西之地也被商家軍盡占。尚可喜也十分後悔，早知如此，就該讓覺羅巴哈納進廣東來，在自已的眼皮低下，金聲桓決不敢亂來。
但這時後悔也晚了，而且尚可喜又聽說，雖然金聲桓己經投降了紹武朝廷，但商家軍仍然不放過他，照打不誤，因此讓尚可喜打消了也投降紹武朝廷，以拒商家軍的想法，而這時商家軍的勢力己經和廣東交界，於是尚可喜一邊調兵遣將，防守廣東的各交通路口，一邊又招集手下的眾將，商議對策。
其實也沒有好商議的，打肯是打不過商家軍了，隻能選擇跑，因此也有人建議，不如乘船從海上逃跑，返回江北去。但一來海路漫漫數千裏，卻了福建以外，盡是商家軍的地盤，誰知途中會發生什麼變故，而且另一方麵，就這麼輕易放棄了廣東，尚可喜也還有點舍不得，能夠得到一塊地盤可不容易，現在屁股還沒有坐熱乎，就要放棄，尚可喜一時也下不了這個決心，畢竟商家軍也還沒有兵臨城下來。
而這時又有消息傳來，商家軍隻占領了江西，並沒有繼續進攻福建，看來對紹武朝廷還是有幾分顧忌，而尚可喜也由此想到了一個辦法。原來在尚可喜進取廣東的時候，抓住在廣東廣西交界處存身的魯王朱以海，以及魯王監國的一些官員，因為朱以海的身份不同，因此尚可喜也要向南京的多鐸請示，如何處理朱以海，但一直沒有得到回複，結果也沒有殺朱以海，而是將他關押在廣州直到現在。
尚可喜的辦法是把朱以海和魯王監國朝廷的官員都放出來，擁立魯王在廣州登基，也成為南明的一部份，而自己搖身一變，也就成了明軍，如果商毅對明室的政權有幾分顧忌，那麼就可以利用朱以海當擋箭牌，擋住商家軍對廣東的進攻，但萬一要是商毅六親不認，一定要占領廣東，那麼自巳也隻能選擇最後一招，等商家軍打到廣州城下的時候，就乘船從海上逃跑。